İzoşizomerlər və izokaudomerlər arasındakı əsas fərq odur ki, izoşizomerlər eyni məhdudiyyət və ya tanınma yerini tanıyıb kəsirlər, izokaudomerlər isə bir qədər fərqli məhdudlaşdırma yerlərini tanıyıb eyni yerdə parçalanır.
Məhdudiyyət fermentləri və ya məhdudlaşdırıcı endonükleazlar ikiqat zəncirli DNT-ni parçalayan bir növ nukleazlardır. Onlar mənşəcə palindromik olan məhdudlaşdırma yerləri adlanan xüsusi ardıcıllığı tanıya bilirlər. Bakteriyalar xarici patogenlərə, xüsusən də viruslara qarşı məhdudlaşdırıcı fermentlər istehsal edir. Bu, bakteriyaların göstərdiyi müdafiə mexanizminin formasıdır. Fermentin strukturundan və kəsiklərin təbiətindən asılı olaraq I tip məhdudlaşdırıcı fermentlər, II tip məhdudlaşdırıcı fermentlər və II tip məhdudlaşdırıcı fermentlər kimi üç növ məhdudlaşdırıcı fermentlər mövcuddur. Bundan əlavə, biokimyəvi aktivlikdən və təcrid mənbəyindən asılı olaraq izoskizomerlər, neoskizomerlər və izokaudomerlər kimi üç növ məhdudlaşdırıcı fermentlər mövcuddur.
İzoşizomerlər nədir?
İzoşizomerlər müxtəlif mənbələrdən gələn, lakin DNT-də eyni məhdudlaşdırma yerini tanıyan və parçalayan bir növ məhdudlaşdırıcı fermentdir. Buna görə də, iki izoskizomer eyni tanınma sahəsinə malikdir. Onlar eyni yerdə parçalanırlar, buna görə də eyni tanınma ardıcıllığına xasdırlar. Məsələn, məhdudlaşdırıcı fermentlər SphI və BbuI CGTAC/G-də tanıyan və parçalanan iki izoskizomerdir.
Şəkil 01: Məhdudiyyət fermenti
İzoşizomerlərin digər cütü HpaII və MspI-dir. Hər ikisi 5′-CCGG-3′ ardıcıllığını tanıyır və DNT-ni parçalayır. Bundan əlavə, Bsp EI və Acc III də müvafiq olaraq Bacillus və Acinetobacter calcoaceticus növündən olan izoschizomerlərdir. İzoşizomerlərin izolyasiyası müxtəlif bakteriyalardan edilə bilər. Onlar müxtəlif bakteriyalardan gəldiyi üçün onların məhdudlaşdırma şərtləri bir-birindən fərqli ola bilər.
İzokaudomerlər nədir?
İzokaudomerlər bir az fərqli ardıcıllığı tanıyan bir növ məhdudlaşdırıcı fermentdir, lakin eyni ucları yaratmaq üçün eyni yerdə parçalanırlar. İzokaudomerlər də müxtəlif bakteriyalardan gəlir. Sau3a və BamHI bir cüt izokaudomerdir. Eyni yerin parçalanmasından sonra 5'-GATC-3' yapışqan uc istehsal edirlər. Digər bir cüt izokaudomer Nocardia corallina-dan NcoI və Pseudomonas alcaligenes-dən PagI-dir. Bu iki ferment də fərqli tanınma ardıcıllığında bağlanır, lakin eyni yerdə kəsilir və eyni yapışqan ucları əmələ gətirir. Buna görə kəsici ucların istehsalı bir-birinə uyğundur və bir-birinə bağlana bilər. XhoI, PspXI və SalI də izokaudomerlərdir.
İzoşizomerlər və İzokaudomerlər arasında hansı oxşarlıqlar var?
- İzoşizomerlər və izokaudomerlər iki növ məhdudlaşdırıcı fermentlərdir.
- İki izoskizomer eyni həzm sahəsinə malikdir, eyni həzm sahəsinə malik iki izokaudomerə bənzəyir.
- Onlar mənşəcə prokaryotikdir.
- Hər ikisinin məhdudlaşdırma tanınması və həzm sahəsi var.
- Onlar bir-birinə uyğun uclar yaradırlar.
- Bundan əlavə, bu fermentlər rekombinant DNT texnologiyasında faydalı alətlərdir.
İzoşizomerlər və İzokaudomerlər Arasındakı Fərq Nədir?
İzoşizomerlər eyni DNT ardıcıllığını tanıyan və eyni məhdudlaşdırma yerində parçalanan məhdudlaşdırıcı fermentlərdir, izokaudomerlər isə bir qədər fərqli DNT ardıcıllığını tanıyan, lakin eyni yerdə kəsilərək eyni yapışqan ucları əmələ gətirən məhdudlaşdırıcı fermentlərdir. Beləliklə, bu izoskizomerlər və izokaudomerlər arasındakı əsas fərqdir.
Aşağıdakı infoqrafik cədvəldə izoskizomerlər və izokaudomerlər arasındakı fərq göstərilir.
Xülasə – Isoschizomerlər vs Isocaudomers
İzoşizomerlər eyni DNT ardıcıllığını tanıyan və eyni yerdə parçalanan məhdudlaşdırıcı fermentlərdir. Digər tərəfdən, izokaudomerlər bir qədər fərqli ardıcıllıqları tanıyan və eyni ucları yaradan eyni yerdə parçalanan məhdudlaşdırıcı fermentlərdir. Beləliklə, bu izoskizomerlər və izokaudomerlər arasındakı əsas fərqdir. SphI, BbuI, HpaII və MspI izoskizomerlərin bir neçə nümunəsidir, Sau3a və BamHI isə izokaudomerlərin iki nümunəsidir. Həm izoskizomerlər, həm də izokaudomerlər təbii olaraq bakteriyalar tərəfindən istehsal olunur.
