ITS1 ilə ITS2 arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, ITS1 eukariotlarda 18S və 5.8S rRNA genləri arasında yerləşən spacer DNT, ITS2 isə eukariotlarda 5.8S və 28S rRNA genləri arasında yerləşən spacer DNT-dir.
Daxili transkripsiya edilmiş spacer (İTS) adətən xromosomda kiçik subunit ribosomal RNT və böyük subunit ribosomal RNT genləri arasında və ya polikistronik rRNA prekursor transkript molekulunda müvafiq transkripsiya edilmiş bölgədə yerləşən spacer DNT-dir. Bakteriyalarda və arxeyalarda 16S və 23S rRNA genləri arasında yalnız bir İTS var. Lakin eukariotlarda iki İTS spacer DNT var: ITS1 (18S və 5.8S rRNA genləri) və ITS2 (5.8S və 28S rRNA arasında). Buna görə də, ITS1 və ITS2 eukariotlarda rRNT genləri arasında tapılan iki ayırıcı DNT-dir.
ITS1 nədir?
ITS1 eukariotlarda 18S və 5.8S rRNA genləri arasında yerləşən boşluq DNT-dir. ITS rRNA genləri arasında yerləşən qeyri-funksional spacer DNT parçasına aiddir. ITS1, ITS2-dən daha böyük uzunluq dəyişikliyinə malikdir. ITS1-in uzunluq dəyişməsi təqribəndir (200-300bp). ITS1 kimi İTS markerləri müxtəlif taksonlar arasında filogenetik əlaqələrin aydınlaşdırılmasında effektivliyini sübut etmişdir. Üstəlik, ITS1 spacer DNT, ITS2 spacer DNT-dən daha az qorunur. ITS1 strukturları yalnız daha kiçik taksonomik vahidlərdə qorunur. Hər bir eukaryotik ribosom klasterində həmçinin xarici transkripsiya edilmiş boşluqlar (5' və 3' ETS) adlanan bölgələr var.
Şəkil 01: ITS1 regionu
ITS1 spacer DNT 5'xarici transkripsiya edilmiş spacer (5' ETS) ilə çox yaxındır. Bundan əlavə, hər kəs filogenetik əlaqə tədqiqatları üçün ITS1 bölgəsini gücləndirmək istəyirsə, bu məqsəd üçün xüsusi bir primer cütündən (geri və irəli primerlər) istifadə etməlidir. ITS1 bölgəsini gücləndirmək üçün laboratoriyaların PCR protokollarında adətən iki primer dəst istifadə olunur. Bunlar ITS1 irəli və ITS2 tərs və ya ITS1 irəli və ITS4 tərsdir.
ITS2 nədir?
ITS2 eukariotlarda 5.8S və 28S rRNA genləri arasında yerləşən boşluq DNT-dir. ITS2 bölgəsi ITS1 bölgəsindən daha qısa uzunluq dəyişikliyinə malikdir. ITS2-nin uzunluq dəyişməsi təqribəndir (180-240bp). Bununla belə, ITS2 bölgəsi bir çox taksonomik vahidlərdə ITS1 bölgəsindən daha çox qorunur. Bu, bütün ITS2 ardıcıllığının ikinci dərəcəli strukturun ümumi nüvəsini paylaşdığını müəyyən edir. Bundan əlavə, bütün angiospermlər arasında 40% ITS2 bölgəsi qorunur, eyni zamanda ITS2 bölgəsinin 50% -ni ailə və daha yüksək səviyyədə uyğunlaşdırmaq mümkündür.
Şəkil 02: ITS2 bölgəsi
Mühafizə sahəsindən asılı olmayaraq, ITS2 bölgəsinin istifadəsi də ITS1 bölgəsi kimi filogenetik əlaqə tədqiqatlarında, xüsusən də göbələk DNT ştrix kodlaşdırmasında çox populyardır. ITS2 bölgəsini gücləndirmək üçün laboratoriyaların PCR protokollarında ümumiyyətlə xüsusi bir primer dəsti istifadə olunur. Yəni ITS1 irəli və ITS4 tərs. Lakin PCR protokolu bu primer dəstindən istifadə etdikdə, o, ITS2 bölgəsi ilə birlikdə ITS1 bölgəsini də gücləndirir. Bundan əlavə, ITS2 spacer DNT 3'xarici transkripsiya edilmiş spacer-ə (3' ETS) çox yaxındır.
ITS1 və ITS2 arasındakı oxşarlıqlar
- ITS1 və ITS2 rRNA genləri arasında yerləşən iki ayırıcı DNT-dir.
- Onlar yalnız eukariotlarda mövcuddur.
- Hər ikisi xüsusi primer cütlərindən istifadə etməklə gücləndirilə bilər.
- Onların hər ikisi qeyri-funksional əlavə məhsullar kimi rRNT-nin yetişməsində ekssiz edilir.
- Hər ikisi filogenetik əlaqənin öyrənilməsi üçün çox vacibdir, xüsusən də göbələk DNT-sinin barkodlanmasında.
ITS1 və ITS2 Arasındakı Fərq
ITS1 eukariotlarda 18S və 5.8S rRNA genləri arasında mövcud olan spacer DNT, ITS2 isə eukariotlarda 5.8S və 28S rRNA genləri arasında yerləşən spacer DNT-dir. Beləliklə, bu ITS1 və ITS2 arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, ITS1 ITS2 ilə müqayisədə daha çox uzunluq dəyişikliyinə malikdir. Digər tərəfdən, ITS2, ITS1 ilə müqayisədə daha qısa uzunluq dəyişikliyinə malikdir. Bu, ITS1 və ITS2 arasındakı digər fərqdir.
Aşağıdakı infoqrafika ITS1 və ITS2 arasındakı fərqləri yan-yana müqayisə üçün cədvəl şəklində sadalayır.
Xülasə – ITS1 vs ITS2
Daxili transkripsiya edilmiş bölgə (İTS) rRNA genləri arasında yerləşən boşluq DNT-nin qeyri-funksional parçasıdır. Bakteriyalarda və arxeyalarda yalnız bir İTS bölgəsi var. Lakin eukariotlarda iki İTS bölgəsi var: ITS1 və ITS2. ITS1 eukariotlarda 18S və 5.8S rRNA genləri arasında yerləşən, ITS2 isə eukariotlarda 5.8S və 28S rRNA genləri arasında yerləşən spacer DNT-dir. Beləliklə, bu, ITS1 və ITS2 arasındakı fərqin xülasəsidir.
