I qrup və II qrup intronları arasında əsas fərq ondan ibarətdir ki, I qrup intronlarda birləşmə reaksiyası guanozin kofaktoru tərəfindən, II qrup intronlarda isə birləşmə reaksiyası daxili adenozin tərəfindən başlanır.
Pre-mRNA həm intronlar, həm də ekzonlara malik olan əsas transkriptdir. Pre-mRNT tərcümədən əvvəl mRNT-yə çevrilməlidir. RNT splicing və ya pre-mRNA splicing belə post-transkripsiya modifikasiyasıdır. RNT-nin birləşdirilməsində intronlar pre-mRNT molekulundan çıxarılır və ekzonlar birləşir. I və II qrup intronlar öz-özünə yapışan intronlardır. Onlar başqa bir fermentin köməyi olmadan pre-mRNT molekulundan ayrılırlar. Buna görə də, onlar pre-mRNT-dən öz birləşmələrini kataliz edən RNT fermentləri və ya ribozimlərdir. Üstəlik, onlar mobil elementlər kimi fəaliyyət göstərmək qabiliyyətinə malikdirlər. Birləşmə zamanı intronu aksizləşdirmək və ekzonları bağlamaq üçün bir sıra trans-esterifikasiya reaksiyaları baş verir. Bu ribozimlər bakteriyalar, arxeya və eukariotlar daxil olmaqla hər üç sahədə mövcuddur.
I Qrup İntronları nədir?
I Qrup intronlar bakteriyalarda, bakteriofaqlarda və eukariotlarda (orqanel və nüvə genomlarında) tapılan bir növ öz-özünə yapışan ribozimlərdir. Onlar əsas genlərdə olur. Onlar pre-mRNT molekulundan öz birləşmələrini kataliz edə bilirlər. I qrup intronlar bir neçə yüzdən üç minə qədər nukleotidə malik ola bilər. Üstəlik, onlar orqanizmlər arasında az ardıcıl oxşarlıq nümayiş etdirirlər.
Şəkil 01: I Qrup İntronlar
İkincil strukturlar dörd qısa bölgədə yüksək səviyyədə qorunub saxlanılır. Birləşmənin iki transesterifikasiya reaksiya mərhələsi var. Qrup I intronlar 5P birləşmə yerində Quanozin kofaktorunun 3' hidroksilinin nükleofil hücumu ilə birləşmə mexanizmini işə salır.
Qrup II İntronlar nədir?
Qrup II intronlar hər üç sahəyə aid olan orqanizmlərdə tapılan öz-özünə yapışan intronlar növüdür. Onlar pre-mRNT-dən öz splicing reaksiyalarını kataliz edən ribozimlərdir. Onlar rRNT, tRNT və protein kodlayan genlərdə olur. Lakin onlar I qrup intronlarından fərqli olaraq nüvə genomlarında tapılmır.
Şəkil 02: II Qrup İntronlar
Qrup II intronlar, I qrup intronlarına bənzər iki transesterifikasiya pilləsi vasitəsilə birləşməni katalizləyir. Bu fermentlər 5′ qoşma qovşağında adenozinin budaq sahəsinin 2′OH nükleofil hücumu ilə splays reaksiyasını başlatır. Birləşmə reaksiyaları zamanı II qrup intronlar lariata bənzər bir quruluş meydana gətirirlər. Üstəlik, intron birləşməsi GTP olmadıqda baş verir.
I Qrup və II Qrup İntronları arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Qrup I və II qrup intronlar müxtəlif mexanizmlərlə öz birləşmələrini kataliz edən iki növ RNT fermenti, ribozimlərdir.
- Onlar böyük ribozimlərdir.
- Hər ikisi hər üç domendə tapılıb.
- Onlar mobil elementlərdir.
- Bundan başqa, onlar rRNT, tRNT və protein kodlayan genlərdə olur.
- Hər iki ferment biotexnologiyada və molekulyar təbabətdə hədəflənmiş gen sökülməsi/yıxılması, gen çatdırılması və ya gen terapiyası sistemləri üçün alət kimi istifadə olunur.
I Qrup və II Qrup İntronları Arasındakı Fərq Nədir?
I qrup intronlar bakteriyalarda, bakteriofaqlarda və eukaryotik orqanella və nüvə genomlarında olan ribozimlərdir. II qrup intronlar bakteriyalarda, arxeyalarda və eukaryotik orqanoidlərdə olan ribozimlərdir. Üstəlik, I qrup intronları 5P birləşmə yerində guanozin kofaktorunun 3′ hidroksilinin nükleofil hücumu ilə, II qrup intronlar isə adenozinin budaq sahəsinin 2′ OH nükleofil hücumu ilə splays reaksiyasını başlatır. 5′ qovşağı. Beləliklə, I qrup və II qrup intronlar arasındakı əsas fərq budur.
Bundan əlavə, II qrup intronlar birləşmə zamanı lariata bənzər quruluş əmələ gətirir, I qrup intronlar isə əmələ gəlmir. Beləliklə, bu, I qrup və II qrup intronları arasında daha bir əhəmiyyətli fərqdir. Bundan əlavə, I qrup intronlar eukaryotik nüvə genomlarında, II qrup intronlar isə eukaryotik nüvə genomlarında tapılmır.
Aşağıda infoqrafika I və II qrup intronları arasındakı fərqləri yan-yana müqayisə üçün cədvəl şəklində sadalayır.
Xülasə – I Qrup və II Qrup İntronları
Qrup I və II intronlar əsas transkriptdən intronları ayırmaq üçün transesterifikasiya reaksiyasını kataliz edən böyük ribozimlərdir. Onlara hər üç sahədə rast gəlinir. Onların hər ikisi mobil genetik elementlərdir. Bundan əlavə, onlar biotexnologiya və molekulyar təbabətdə alət kimi istifadə olunur. Bununla belə, I qrup intronları 5P birləşmə yerində guanozin kofaktorunun 3′OH-nin nükleofil hücumu ilə birləşmə reaksiyasına başlayır. Lakin II qrup intronları 5′ qoşma qovşağında adenozinin budaq sahəsinin 2′OH nükleofil hücumu ilə splays reaksiyasını başlatır. Üstəlik, II qrup intronlar birləşmə zamanı lariata bənzər bir quruluş meydana gətirir, I qrup intronlar isə lariata bənzər bir quruluş yaratmır. Beləliklə, bu, I qrup və II qrup intronlar arasındakı fərqin xülasəsidir.
