Motivlə domen arasındakı əsas fərq odur ki, motiv müstəqil olaraq sabit deyil, domen müstəqil olaraq sabitdir.
Zülallar bədənimizdə mövcud olan mühüm bioloji makromolekullardır. Digər tərəfdən, bir genin genetik kodu bir zülalın amin turşusu ardıcıllığına qərar verəcəkdir. Üstəlik, zülalların birincili, ikincili və üçüncü dərəcəli strukturları var. Əsas quruluş polipeptid zəncirinin amin turşusu ardıcıllığıdır. Polipeptid zəncirləri bir-biri ilə qatlandıqda zülalın ikincil strukturunu əmələ gətirir. Alfa spiralları, beta təbəqələri və super-ikinci strukturlar ikinci dərəcəli strukturlara aiddir. Super-ikinci dərəcəli elementlərin müəyyən qrupları zülal motivləri kimi tanınır. Bir zülalın üçüncü quruluşu zülalın funksiyasını təyin edən üçölçülü quruluşuna aiddir. Domen zülal molekulunun qlobulyar və diskret funksiyası olan qatlanmış hissəsidir. Bu, zülalın əsas funksional və üçölçülü quruluşudur.
Motif nədir?
Motif alfa spiralları və beta strukturları kimi zülalların super ikinci dərəcəli elementlərinin müəyyən qruplaşmasıdır. Onlar müxtəlif zülallarda mövcud olan bir növ nümunələrdir. Motiflər ikinci dərəcəli struktur elementlərinin qatlama naxışlarını və onların qarşılıqlı təsirini təsvir edir. Bu qatlama nümunələri üçüncü dərəcəli strukturlarda mövcud olan oxşar əlaqələrlə sabitləşir. Lakin onlar üçüncü dərəcəli strukturlar qədər mürəkkəb deyillər.
Şəkil 01: Motif
Onlar zülalların ikinci dərəcəli strukturlarının sadə birləşmələridir. Motif özlüyündə sabit deyil. Bundan əlavə, motivlər zülalın quruluşunu izah edir, lakin zülalın funksiyasını proqnozlaşdırmır. Zülal motivlərinə misal olaraq beta-alfa-beta motivi, yunan açar motivi, Beta barel, Beta-meander motivi və s. ola bilər.
Domen nədir?
Domen zülalın fundamental, funksional və üçölçülü vahididir. Müəyyən bir funksiyanı yerinə yetirir. Tək bir protein bir neçə fərqli sahəyə malik ola bilər. Hər bir domen müstəqil vahiddir. Qlobulyar bir quruluşdur. Müəyyən bir funksiya və ya qarşılıqlı əlaqə üçün cavabdehdir. Domenlər xarakterik olmayan bir zülalın funksiyasını fərz etmək üçün istifadə edilə bilər. Zülal təhlil edilərkən, domenlər zülalın funksional vahidləri olduğu üçün bunu nəzərə almaq vacibdir.
Şəkil 02: Piruvat Kinazanın Üç Fərqli Domeni
Domenlər çox sabit və yığcam strukturlardır. Onları digər bölgələrdən asanlıqla ayırd etmək olar. Şəkil 02-də göstərildiyi kimi, piruvat kinaz üç fərqləndirici sahəyə malikdir. Domenin uzunluğu dəyişə bilər və orta uzunluq 100 amin turşusudur. Hər bir domen ikinci dərəcəli struktur vahidlərdən qurulmuş hidrofobik nüvədən ibarətdir. Bir neçə domen birlikdə zülalın üçüncü strukturunu təşkil edir.
Motif və Domen Arasındakı oxşarlıqlar nələrdir?
- Motiv və domen zülal molekullarında mövcud olan vahidlərdir.
- Zülal ailələrini təsnif edərkən faydalıdırlar.
Motif və Domen Arasındakı Fərq Nədir?
Motif alfa spiralları və beta strukturları kimi zülalların super ikinci dərəcəli elementlərinin müəyyən qruplaşmasıdır, domen isə zülalın funksional vahididir. Bundan əlavə, motiv ikinci dərəcəli bir quruluşdur, domen isə zülalın üçüncü strukturundan məsuldur. Üstəlik, domen motivdən fərqli olaraq müstəqil vahiddir. Həmçinin, domen zülalın funksiyasını təsvir edir, motiv isə yoxdur. Motif və domen arasındakı əsas fərqlər bunlardır. Aşağıdakı infoqrafika motiv və domen arasındakı fərqi cədvəl şəklində təqdim edir.
Xülasə – Motif və Domen
Motiv zülal molekulunun ikinci dərəcəli strukturlarının düzülüşüdür. Bir domendən fərqli olaraq, adətən özü sabit deyil. Domen zülalın müstəqil sabit strukturudur. Buna görə də, bir hissəsi və ya bütün protein molekulu ola bilər. Bu, zülalın üç ölçülü əsas funksional vahididir. Üstəlik, bir funksiyası var və müstəqil bir vahiddir. Motif domenin bir hissəsi ola bilər. Lakin domen motivin bir hissəsi ola bilməz. Bu motiv və domen arasındakı fərqdir.
