Protein alt bölməsi ilə domen arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, zülal alt bölməsi zülal kompleksi yaratmaq üçün digər polipeptid zəncirləri ilə birləşən zülalın ayrıca polipeptid zənciridir, zülal domeni isə polipeptid zəncirinin bitişik bölgəsidir. tez-tez müstəqil şəkildə yığcam, yerli və yarı müstəqil vahidə qatlanan bir protein.
Protein alt vahidi və domeni multimerik zülalın çox vacib hissələridir. Zülallar polipeptidlərdən hazırlanmış polimerlərdir. Hər bir polipeptid zənciri amin turşusu kimi tanınan bir monomerdən əmələ gəlir. Mürəkkəb bir zülalda alt bölmələr, domenlər, motiv və qat kimi fərqli struktur vahidləri var. Mürəkkəb zülalın bu struktur vahidləri onun strukturu və son nəticədə funksiyası üçün son dərəcə vacibdir.
Protein Alt Birimi nədir?
Zülal alt vahidi zülal kompleksi yaratmaq üçün digər polipeptid zəncirləri ilə birləşən zülalın ayrıca polipeptid zənciridir. Struktur biologiyada zülal alt vahidi zülal kompleksi yaratmaq üçün digər zülal molekulları ilə birlikdə yığılan tək zülal molekuludur. Təbii olaraq meydana gələn zülallarda hemoglobin və DNT polimeraza kimi nisbətən az sayda alt bölmə var. Buna görə də onlara oliqomerik deyilir. Digər zülallar çoxlu sayda alt bölmədən ibarətdir, buna görə də onlar multimerik kimi təsvir olunurlar. Məsələn, mikrotubullar və digər sitoskelet zülalları multimerikdir. Multimerik zülalın alt bölmələri eyni (homoloji) və ya tamamilə fərqli (heteroloq) ola bilər.
Şəkil 01: Protein Alt Birimi
Bəzi multimerik zülallarda bir alt birlik katalitik alt vahid ola bilər. Digər tərəfdən, digəri tənzimləmə alt bölməsidir. Katalitik alt bölmənin funksiyası fermentativ reaksiyanı kataliz edir, tənzimləyici alt bölmənin funksiyası isə onun fəaliyyətini asanlaşdırır və ya maneə törədir. Yığıldığı zaman həm katalitik, həm də tənzimləyici alt hissələrdən ibarət olan ferment adətən holoenzim adlanır. Məsələn, I sinif fosfoinositid 3-kinaz fermenti p110 katalitik alt bölməsinə və p85 tənzimləyici alt bölməsinə malikdir. Üstəlik, bir zülalın hər alt vahid üçün bir gen olmalıdır. Bunun səbəbi, alt bölmənin bir kodlaşdırıcı genə malik olan ayrıca polipeptid zəncirindən ibarət olmasıdır.
Protein Domeni nədir?
Zülal domeni zülalın polipeptid zəncirinin bitişik bölgəsidir və tez-tez müstəqil şəkildə yığcam, yerli və yarı müstəqil vahidlərə qatlanır. Zülalın domeni həm də zülalın polipeptid zəncirinin öz-özünə sabitləşən və qalan hissələrdən asılı olmayaraq qatlanan bölgəsi kimi tanınır. Onlar zülalda fərqli struktur və funksional vahiddir. Normalda, domenlər zülalın ümumi roluna töhfə verən xüsusi bir funksiya və ya qarşılıqlı əlaqə üçün cavabdehdir. Məsələn, SH3 domeni təxminən 50 amin turşusu qalıqlarıdır. Onlar müxtəlif zülallarda, o cümlədən adapter zülallarında, fofatidilozitol3-kinazlarda, fosfolipazlarda və miozinlərdə olur. Bu SH3 domenləri zülal-zülal qarşılıqlı təsirində iştirak edir.
Şəkil 02: Protein Domenləri
Domenlərin uzunluğu 50 amin turşusu ilə 250 amin turşusu arasında dəyişir. Sink barmağı kimi ən qısa sahələr metal ionları və disulfid körpüləri ilə sabitləşir. Bir domen tez-tez kalmodulinin kalsium bağlayan EF-əl domeni kimi funksional vahidlər istehsal edir. Bundan əlavə, kimerik zülallar yaratmaq üçün domenlər genetik mühəndisliyi vasitəsilə bir zülal arasında digərinə dəyişdirilə bilər.
Protein Alt Birimi və Domen Arasındakı oxşarlıqlar nələrdir?
- Protein alt vahidi və domen multimerik zülalın struktur vahidləridir.
- Hər ikisi amin turşularından ibarətdir.
- Onlar “polipeptid zənciri” termini ilə bağlıdır.
- Üstəlik, onların hər ikisi zülalın ümumi funksiyası üçün son dərəcə vacibdir.
Protein Alt Birimi ilə Domen Arasındakı Fərq Nədir?
Zülal alt vahidi zülal kompleksi yaratmaq üçün digər polipeptid zəncirləri ilə birləşən zülalın ayrıca polipeptid zənciridir. Digər tərəfdən, zülal domeni zülalın polipeptid zəncirinin bitişik bölgəsidir və tez-tez müstəqil olaraq yığcam, yerli və yarı müstəqil vahidlərə qatlanır. Beləliklə, bu zülal alt vahidi ilə domen arasındakı əsas fərqdir. Üstəlik, zülal alt vahidi zülal domenindən daha böyükdür.
Aşağıdakı cədvəl zülal alt vahidi ilə domen arasındakı fərqi cədvəl şəklində ümumiləşdirir.
Xülasə – Protein Alt Birimi ilə Domen
Zülalların tikinti blokları amin turşularıdır. Zülallar amin turşularının kondensasiyası nəticəsində əmələ gəlir. Protein strukturlarının ölçüləri onlarla və bir neçə min amin turşusu arasında dəyişir. Zülal quruluşu hidrogen bağları, ion bağları, Van der Waals qüvvələri, hidrofobik bağlar və disulfid bağları kimi kovalent qarşılıqlı təsirlər kimi kovalent olmayan qarşılıqlı təsirlərlə sabitləşir. Mürəkkəb bir zülalda alt bölmələr, domenlər, motiv və qat kimi fərqli struktur vahidləri var. Zülal alt vahidi zülal kompleksi yaratmaq üçün digər polipeptid zəncirləri ilə birləşən zülalın ayrıca polipeptid zənciridir. Digər tərəfdən, zülal domeni zülalın polipeptid zəncirinin öz-özünə sabitləşən və qalan hissələrdən asılı olmayaraq qatlanan bir bölgəsidir. Beləliklə, bu, zülal alt vahidi ilə domen arasındakı fərqin xülasəsidir.
