Hədəflənmiş və hədəflənməmiş proteomikanın əsas fərqi ondan ibarətdir ki, hədəflənmiş proteomika konkret zülalın bolluğunu ölçmək məqsədi daşıyır, hədəflənməmiş proteomika isə konkret zülalı hədəf almır.
Proteomika zülalların, onların strukturlarının və funksiyalarının geniş miqyaslı tədqiqidir. Hüceyrə, toxuma və ya orqanizmdə xüsusi şəraitdə bütün zülal tamamlamasını öyrənir. Hədəflənmiş proteomika və hədəfsiz proteomika kimi iki növ proteomika var.
Targeted Proteomika nədir?
Adından da göründüyü kimi, hədəflənmiş proteomika analiz üçün zülalların kompleks qarışığındakı xüsusi zülal və ya peptidi hədəf alır. Sonra o, əvvəlcədən seçilmiş xüsusi zülalın mövcudluğunu və miqdarını təhlil edir. Bu üsul yalnız bir nümunə üçün və ya bir neçə nümunə üçün mümkündür. Bu üsul hətta müəyyən bir zülal qrupu üçün də uyğundur. Bu, daha dəqiq, kəmiyyət və həssas məlumatlarla nəticələnir. Üstəlik, hədəflənmiş proteomika ilə birlikdə kütləvi spektrometriya daha dəqiq etibarlı ölçmələr yaradır. Bu üsul analiz üçün üçlü dördqütblü kütlə spektrometrindən (QQQ) istifadə edir.
Şəkil 01: Proteomika
Hədəf edilmiş proteomika, əgər siz yıxılan hədəfin həqiqətən yıxıldığını yoxlamaq istəyirsinizsə və ya qan serumunda, beyin mayesində və ya hüceyrə lizatında və s.-də xüsusi zülal/peptidin kəmiyyətini təyin etmək istəyirsinizsə, uyğun üsuldur. Əgər müəyyən bir zülalın nümunələr arasında və ya zaman kursu təcrübəsi zamanı diferensial şəkildə ifadə edilib-edilmədiyini yoxlamaq istəyirsinizsə, ondan istifadə edin.
Hədəfsiz Proteomika nədir?
Hədəfsiz proteomika, adından da göründüyü kimi, analizi üçün xüsusi bir zülal və ya peptidi hədəf almır. Kəşf proteomikası Hədəfsiz proteomikanın başqa adıdır. Əslində, bu, daha “qlobal” təhlildir. Ümumiyyətlə, hədəfsiz proteomikanı yerinə yetirmək “bu nümunədə və ya bir neçə nümunədə hansı zülal və ya zülallar var?” sualına cavab verməkdir. Bu üsul hədəflənmiş proteomika kimi həssas deyil. Lakin o, yeni zülallar da daxil olmaqla bir çox zülalları müəyyən edə və ölçə bilər. Hədəfsiz proteomikalar həm kəmiyyət, həm də keyfiyyət ölçmələri yarada bilər.
Hədəfli və Hədəfsiz Proteomikalar Arasındakı oxşarlıqlar nələrdir?
- Həm hədəflənmiş, həm də hədəfsiz proteomika nümunələrdə zülalları ölçür.
- Onlar proteom analizində vacibdir.
- Bu üsullar kütləvi spektrometriyadan istifadə edir.
Hədəfli və Hədəfsiz Proteomika Arasındakı Fərq Nədir?
Birincisi, hədəflənmiş proteomika zülalların kompleks qarışığında müəyyən bir zülalın və ya peptidin mövcudluğunun və miqdarının müəyyən edilməsidir. Bunun əksinə olaraq, hədəflənməmiş proteomika müəyyən bir zülalı hədəf almadan nümunə və ya nümunələrdə mövcud olan zülalların kəmiyyət və keyfiyyətcə öyrənilməsidir. Hədəflənmiş proteomika əvvəlcədən seçilmiş və ya hədəflənmiş zülallarla, hədəfsiz proteomika isə bu nümunədəki zülalların növlərini tapmaq üçün həyata keçirilir. Üstəlik, hədəflənmiş proteomika hədəflənməmiş proteomikaya nisbətən daha həssasdır.
Xülasə – Hədəfli və Hədəfsiz Proteomika
Xülasə etmək üçün hədəflənmiş və hədəfsiz proteomika iki növ protein tədqiqatıdır. Adlarından göründüyü kimi, hədəflənmiş proteomika müəyyən bir zülalı hədəf alır, hədəfsiz proteomika isə xüsusi bir zülalı hədəf almır. Bu, hədəflənmiş və hədəfsiz proteomika arasındakı fərqdir.
