Proteomika ilə metabolomika arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, proteomika orqanizmin bütün zülallarını, metabolomika isə orqanizmin bütün metabolitlərini öyrənir.
Genomika orqanizmin genetik quruluşunu öyrənir. Proteomika və metabolomika genomika ilə əlaqəli iki omik elmdir. Proteom bir hüceyrə və ya orqanizmdəki bütün zülallara aiddir. Metabolom, əksinə, bir orqanizmin bütün metabolitlərinə aiddir. Beləliklə, proteomun öyrənilməsi proteomika, metabolomun öyrənilməsi isə metabolomikadır. Həm proteomika, həm də metabolomika xəstəliklərin diaqnostikasında və orqanizmlərin xarakteristikasında və skrininqində vacibdir. Üstəlik, hər ikisi hüceyrə biologiyasının bir çox aspektlərində, xüsusən də hüceyrə siqnalizasiyasında, zülalın deqradasiyası və generasiyasında və translyasiyadan sonrakı modifikasiyada bağlıdır.
Proteomika nədir?
Proteom hüceyrə, toxuma və ya orqanizmdə ümumi protein tamamlayıcısıdır. Buna görə də, proteomika bir orqanizmin proteomunun öyrənilməsidir. Proteomikada zülalların müxtəlif xüsusiyyətləri təhlil edilir. Buna görə də, proteomika əsasən zülalların quruluşu, oriyentasiyası, funksiyaları, zülallarla qarşılıqlı əlaqəsi, modifikasiyası, tətbiqi və əhəmiyyətinə diqqət yetirir. Buna görə də hazırda proteomika sahəsində bir çox tədqiqat layihələri həyata keçirilir.
İlk proteomik tədqiqatlar Escherichia coli-də protein tərkibini müəyyən etmək üçün edildi. Ümumi zülal tərkibinin xəritəsi iki ölçülü (2D) gellərdən istifadə etməklə aparılmışdır. Bu layihənin uğurundan sonra elm adamları qvineya donuzları və siçanlar kimi heyvanlarda ümumi protein tərkibini xarakterizə etməyə keçdilər. Hazırda insan zülalının xəritəsi 2D gel elektroforezindən istifadə etməklə həyata keçirilir.
Proteomikanı öyrənməyin bir çox üstünlükləri var, çünki zülallar zülalların katalizator xüsusiyyətinə görə əksər fəaliyyətin idarəedici molekullarıdır. Beləliklə, bütün zülalların öyrənilməsi orqanizmin sağlamlıq vəziyyəti ilə bağlı məlumat verə bilər. Bundan əlavə, proteomikanın genom annotasiyasında, xəstəliklərin identifikasiyası və diaqnostikasında, eksperiment zamanı zülal ifadəsi tədqiqatlarının aparılmasında, zülal modifikasiyalarında və qarşılıqlı təsir tədqiqatlarında və s. kimi bir çox tətbiqi var.
Şəkil 01: Proteomika
Proteomikada ümumi zülalın çıxarılması, 2D gel elektroforezindən istifadə etməklə onların ayrılması, Edmund ardıcıllığı metodu və ya kütləvi spektrometriya kimi üsullardan istifadə edərək ekstraksiya edilmiş zülalların ardıcıllığı və struktur və funksional analizlər daxil olmaqla müxtəlif üsullar iştirak edir. kompüter əsaslı proqram və bioinformatika vasitələrindən istifadə edərək zülalın xassələri.
Metabolomika nədir?
Metabolomika hüceyrə, toxuma və ya orqanizmdəki bütün metabolitlərin öyrənilməsidir. Bu, müxtəlif qabaqcıl analitik və statistik vasitələrdən istifadə edərək hüceyrə metabolitlərinin identifikasiyası və kəmiyyətini əhatə edir. Metabolomika vacib bir araşdırmadır, çünki o, orqanizmin metabolizmi ilə bağlı məlumatları ortaya qoyur.
Şəkil 02: Metabolomika
Metabolik reaksiyaların substratlarını və məhsullarını öyrənmək üçün metabolomika analitik platforma kimi kütlə spektrometriyasından istifadə edir. Kütləvi spektrometriya nəticəsində hüceyrələrin və ya toxumaların faktiki biokimyəvi vəziyyətini əks etdirən metabolitlər və onların konsentrasiyası əldə edilir. Beləliklə, metabolomikanı orqanizmin molekulyar fenotipinin ən yaxşı təmsilçisi hesab etmək olar. Bunlara əlavə olaraq, metabolomikanı proteomikanın uzantısı hesab etmək olar, çünki əksər metabolitlər zülal olan fermentlərin fəaliyyəti nəticəsində əmələ gəlir.
Proteomika və Metabolomika arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Proteomika və metabolomika genomika ilə əlaqəli iki omik elmdir.
- Metabolomika proteomikanın davamı kimi qəbul edilə bilər.
- Proteom və metabolom bir çox tədqiqatla sıx bağlıdır.
Proteomika və Metabolomika Arasındakı Fərq Nədir?
Proteomika hüceyrə və ya orqanizm daxilində strukturu və funksiyası daxil olmaqla zülalların genişmiqyaslı tədqiqidir. Eyni zamanda, metabolomika müəyyən şərtlər altında hüceyrə, toxuma və ya orqanizmdə metabolit profillərinin öyrənilməsidir. Beləliklə, bu proteomika və metabolomika arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, proteomika əsasən zülalların tam dəstinə aiddir, metabolomika isə əsasən peptidlər, karbohidratlar, lipidlər, nukleozidlər və ekzogen birləşmələrin katabolik məhsulları və s. Buna görə də bu, proteomika və metabolomika arasındakı başqa bir fərqdir.
Aşağıdakı infoqrafika proteomika və metabolomika arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
Xülasə – Proteomika vs Metabolomika
Canlı orqanizmlər onların genomundan, zülallarından və metabolitlərindən istifadə etməklə tədqiq edilə bilər. Genomika, proteomika və metabolomika müvafiq olaraq hüceyrənin və ya orqanizmin genetik quruluşunu, zülallarını və metabolitlərini öyrənən üç sahədir. Proteomika vacibdir, çünki o, həm genlərin, həm də ətraf mühitin dinamik əksidir. Metabolomika çox vacibdir, çünki o, hüceyrələrin biokimyəvi reaksiyasının cari vəziyyətini və ya orqanizmin metabolik vəziyyətini birbaşa əks etdirir. Beləliklə, bu, proteomika və metabolomika arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
