SF1 və SF2 arasındakı əsas fərq onların nuklein turşularını açmaq qabiliyyətidir. SF1 yalnız DNT-ni açarkən, SF2 həm DNT, həm də RNT-ni açır.
Helikaz DNT replikasiyası prosesində, eləcə də DNT təmiri proseslərində iştirak edən əsas fermentlərdən biridir. Helikazın əsas rolu ikiqat zəncirli DNT molekullarının ayrılmasını asanlaşdırmaq üçün açılma prosesində iştirak etməkdir. DNT replikasiyasının başlanğıc mərhələsində fermentin fəaliyyəti vacibdir. Helikazlar əsasən struktur fərqlərinə görə Super Ailə 1 və Super Ailə 2 olaraq bölünür. Hər Super Ailədə daha müxtəlif növ helikaslar var.
SF1 nədir?
Super Family 1 helikazı helikaz fəaliyyətini təsvir edən daxili nüvə zülalının yanında heksamerik strukturdan ibarət helikaz növüdür. SF1 helikazı helikazın ən böyük siniflərindən biridir və daha sonra SF1A helikazları və SF1B helikazları kimi təsnif edilə bilər. PcrA, Rep və UvrD kimi zülallar SF1A helikazları sinfinə aiddir. Müqayisə üçün, RecA və Dda kimi zülallar SF1B helikazlar sinfinə aiddir. SF1 spirallarının funksiyaları geniş şəkildə dəyişir. SF1 helikazlarının bəzi həyati funksiyalarına DNT replikasiyası, DNT rekombinasiyası, Okazaki fraqmentinin işlənməsi, telomerin əmələ gəlməsi və DNT zədəsinin nukleotid eksizyonunun təmiri daxildir. Bəzi bakterial növlərdə SF1 tipli helikazlar da konyuqasiya yolu ilə üfüqi gen transferinə kömək edir. Bundan əlavə, viruslarda SF1 helikazları virusun təkrarlanmasına kömək edir.
Şəkil 01: Helikaz Fəaliyyəti
SF1 spirallarının strukturu ilə bağlı çoxlu müxtəlif motivlər var. Onlar SF1 spirallarının bütün müxtəlif növləri (Q, I, Ia, II, III, IV, V və VI) arasında ən azı 7 qorunmuş motivləri ehtiva edir. SF1 helikazının quruluşu kristaldır, burada motivlər birləşir. Motiflər və DNT bağlama yeri arasında xarakterik bir ATP bağlayıcı cibi var. Konservləşdirilməmiş domenlər helikaz molekulunun struktur bütövlüyünü qorumaq üçün paylanır. Bu domenlər SF1A spiralları və SF1B spiralları arasında dəyişə bilər.
SF2 nədir?
Super ailə 2 helikaz helikaz super ailələrinin ən müxtəlif qruplarından biridir. SF2 spirallarının bir çox növləri var, məsələn, RecQ-bənzər spirallar, RecG kimi spirallar, Rad3/XPD və NS3 spiralları. I tip məhdudlaşdırıcı fermentlər kimi bəzi məhdudlaşdırıcı fermentlər də bu kateqoriyaya aiddir. SF2 helikazlarının ümumi funksiyası ikiqat zəncirli DNT-nin açılmasıdır. Bununla belə, SF2 helikazlarının bəzi növləri helikaz fermentləri kimi tam fəaliyyət göstərmək qabiliyyətinə malik deyildir. SF2 helikazları RNT emalında da geniş istifadə olunur. SF2 helikazlarının DEAD-box ailəsi transkripsiya, birləşdirmə, tərcümə emalı və RNT-zülal kompleksinin yığılması daxil olmaqla RNT emalında iştirak edir.
Şəkil 02: Helikaz
SF2 helikazının strukturunda konservləşdirilmiş motivlər də var. Bununla belə, bəzi domenlər SF1 helikazından bir qədər fərqlənir. Onlar həmçinin DNT bağlayan domendən başqa ATP bağlayan domendən ibarətdir.
SF1 və SF2 arasında hansı oxşarlıqlar var?
- SF1 və SF2 helikaz fəaliyyətini göstərir.
- Bundan başqa, hər ikisi DNT replikasiyasında və rekombinasiyasında iştirak edir.
- SF1 və SF2 qorunmuş motivlərdən ibarətdir.
- Hər ikisinin ATP bağlayan domeni və DNT bağlayan domeni var.
- Bu formalar çoxdomenli zülallardır.
- Üstəlik, mutasiyalar hər iki növdə baş verərsə, bu, zərərli təsirlərlə nəticələnəcək.
- Hüceyrə dövrünün davamlılığını təmin etmək üçün həm SF1, həm də SF2 çox vacibdir.
- SF1 və SF2 prokaryotlarda, eləcə də eukariotlarda olur.
SF1 ilə SF2 arasındakı fərq nədir?
SF1 və SF2 helikazın iki super ailəsidir. Onlar geniş müxtəliflik nümayiş etdirirlər. SF1 və SF2 arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, SF1 ilk növbədə DNT-nin açılmasında iştirak edir, SF2 isə transkripsiya və tərcümə zamanı RNT emalında iştirak edir. Zülalın müxtəlif motivlərini müqayisə edərkən, SF1 və SF2 ilk növbədə motiv III və IV motiv əsasında fərqlənir. Struktur oxşarlığına baxmayaraq, SF1 helikazları toroidal heksamerik strukturlar əmələ gətirir, SF2 isə bu struktur quruluşları əmələ gətirmir.
SF1 və SF2 arasındakı digər fərq ondan ibarətdir ki, SF1 spiralları adenin nukleotidlərinə daha çox üstünlük verir, SF2 helikazları isə açılmaq üçün bütün beş nukleotidə üstünlük verirlər. Açılış istiqamətini müqayisə edərkən, SF1 spiralları yalnız 5'-dən 3'-ə qədər yerdəyişmə edir, SF2 spiralları isə hər iki istiqamətdə nuklein turşuları ilə birlikdə yerdəyişmə qabiliyyətinə malikdir.
Aşağıdakı infoqrafika SF1 və SF2 arasındakı fərqləri yan-yana müqayisə üçün cədvəl şəklində təqdim edir.
Xülasə – SF1 vs SF2
Helikazlar DNT replikasiyasında iştirak edən çox vacib və müxtəlif fermentlər qrupudur. Lakin, yüksək müxtəlifliyinə görə fermentlər super ailələrə bölünür. SF1 və SF2 spiralların iki ən böyük super ailəsidir. SF1 ilk növbədə DNT ilə əlaqəli emal ilə əlaqəli olsa da, SF2 həm DNT, həm də RNT emalı ilə əlaqələndirilir. Beləliklə, bu SF1 və SF2 arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, SF1 və SF2 struktur quruluşlarında da fərqlənirlər, çünki SF2 heksamerik strukturlar əmələ gətirmir. SF1 və SF2 helikazlarındakı mutasiyalar hüceyrə dövrünün və DNT təmiri kimi digər həyati mexanizmlərin tənzimlənməsinin pozulmasından sonra xərçəngin inkişafına səbəb olacaq.
