PARP1 və PARP2 arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, bitki və heyvan PARP1 Zn-barmaq DNT-ni bağlayan motivləri, bitki PARP2 isə N-terminal SAP DNT-ni bağlama motivlərini daşıyır.
Poly ADP riboz polimeraza (PARP) nüvə fermentləri olan zülallar ailəsidir. PARP ailəsində 17 müxtəlif növ PARP fermenti var. PARP1 və PARP2 normal DNT təmiri fəaliyyətləri üçün vacib olan iki fermentdir.
PARP nədir?
PARP (Poly ADP ribose polimerase) DNT təmiri, genomik sabitlik və proqramlaşdırılmış hüceyrə ölümü kimi çoxsaylı hüceyrə proseslərində xidmət edən zülallar ailəsidir. Onlar ADP-ribosilasiya adlı prosesi kataliz edirlər. ADP-ribosilasiya DNT zəncirinin qırılmalarını bərpa etmək üçün nikotinamid adenin dinukleotidindən (NAD) ADP-riboz vahidlərinin hədəf substratlara əlavə edilməsinə aiddir.
PARP fermentləri DNT-ni bağlayan zülallardır. Onlar DNT molekullarında mövcud olan nicklər tərəfindən aktivləşdirilir. Onlar DNT qırılmaları ilə bağlandıqdan sonra NAD+-ni nikotinamiddə hidroliz edir və ADP-ribozun polimerləşməsini təşviq edirlər. Beləliklə, PARP nüvə fermentləri DNT təmirində iştirak edirlər. Bundan əlavə, poli-ADP-ribosilasiya replikasiyada, transkripsiya tənzimlənməsində, telomerlərin saxlanmasında və zülalın deqradasiyasında əsas rol oynayan post-translational modifikasiya kimi işləyir. PARP fermentləri həmçinin genom sabitliyinin saxlanmasında, xromatin strukturunun tənzimlənməsində, hüceyrə proliferasiyasında və apoptozda iştirak edir.
PARP1 nədir?
PARP1 PARP protein ailəsinin üzvüdür. Bu ailənin ilk və ən yaxşı səciyyəvi zülalıdır. DNT zədələrini aşkar edən və sonra təmir mexanizminin seçilməsini asanlaşdıran ilk cavab verən kimi çıxış edir. Bundan əlavə, PARP1 tək zəncirli DNT zədələrinin təmirini tənzimləyir.
Şəkil 01: PARP1
Tək zəncirli DNT qırılmalarını təmir etməklə yanaşı, PARP1 replikasiya çəngəlinin irəliləməsini və yenidən başlamasını tənzimləyir. Bundan əlavə, o, alternativ qeyri-homoloji son birləşməni təşviq edir.
PARP2 nədir?
PARP2 PARP zülal ailəsinin başqa bir üzvü proteindir. PARP1 fermenti ilə sıx bağlıdır. PARP2 geni insanlarda PARP2 zülalını kodlayır. PARP2-nin katalitik domeni var, lakin N terminal DNT-ni bağlayan domen yoxdur. PARP inhibitoru olan xərçəng əleyhinə dərmanlar PARP1-ə bənzər PARP2-ni inhibə edə bilər.
Şəkil 02: PARP2
Bitkilərdə, xüsusən də Arabidopsis thalianada PARP2 PARP1-dən fərqli olaraq DNT zədələnməsinə və bakteriya patogenezinə qarşı qoruyucu reaksiyalarda əhəmiyyətli rol oynayır.
PARP1 və PARP2 arasında hansı oxşarlıqlar var?
- PARP1 və PARP2 iki növ nüvə fermentidir.
- Onlar poli ADP ribosilasiyasını kataliz etmək üçün NAD+-dan substrat kimi istifadə edirlər.
- Hər ikisi DNT tək zəncirli qırılmalarla aktivləşdirilir.
- Mməli PARP1 və PARP2 nüvədə yerləşir.
- Həm PARP1, həm də PARP2 xromatinlə qarşılıqlı əlaqədədir.
- DNT zədələrini bərpa edirlər.
- PARP1-ə yönəlmiş bəzi PARP inhibitoru xərçəng əleyhinə dərmanlar da PARP2-ni inhibə edir.
PARP1 ilə PARP2 arasındakı fərq nədir?
PARP1, katalitik domen və N-terminal DNT-ni bağlayan domen olan PARP protein ailəsinin üzvüdür, PARP2 isə N-terminal DNT-ni bağlayan domendən məhrum olan PARP ailəsinin üzvüdür. PARP1 və PARP2 arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, bitki və heyvan PARP1 Zn-barmaq DNT bağlama motivlərini, bitki PARP2 isə N-terminal SAP DNT bağlayıcı motivləri daşıyır.
Aşağıdakı infoqrafika PARP1 və PARP2 arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
Xülasə – PARP1 vs PARP2
PARP-lər DNT zədələrini hiss edən və onları təmir edən nüvə fermentləridir. PARP1 və PARP2 bunlardan bir-biri ilə sıx əlaqəli olan ikisidir. Hər iki fermentin katalitik sahəsi var. Lakin PARP2-də PARP1-də mövcud olan N-terminal DNT bağlayıcı domen yoxdur. Beləliklə, bu, PARP1 və PARP2 arasındakı əsas fərqdir. Hər iki ferment növü substrat kimi NAD+ istifadə edir.
