Əsas Fərq – VNTR vs STR
DNT tədqiqatlarının filogenetik əlaqələrin dərk edilməsində və müəyyən edilməsində, genetik xəstəliklərin diaqnozunda və orqanizmin genomlarının xəritələşdirilməsində böyük faydası var. DNT analizi ilə əlaqəli bir neçə üsul müəyyən bir genin və ya naməlum DNT hovuzunda bir DNT ardıcıllığının müəyyən edilməsi üçün istifadə olunur. Onlar genetik markerlər kimi tanınırlar. Genetik markerlər molekulyar biologiyada fərdlər və növlər arasında genetik dəyişkənliyi müəyyən etmək üçün istifadə olunur. Dəyişən say tandem təkrarı (VNTR) və qısa tandem təkrarı (STR) fərdlər arasında polimorfizm göstərən iki növ genetik markerdir. Hər iki növ tandem təkrarları olan kodlaşdırılmayan təkrarlanan DNT-dir. Onlar xromosomlarda başdan quyruğa düzülür. VNTR qısa nukleotid ardıcıllığının bir neçə dəfə təkrarlandığı genomun bir hissəsidir. STR, genomdakı DNT-nin yüz dəfə iki ilə on üç nukleotiddən ibarət təkrarlanan vahidlər şəklində təşkil edilən başqa bir hissəsidir. VNTR və STR arasındakı əsas fərq təkrarlanan ardıcıllıqdakı nukleotidlərin sayıdır. VNTR-nin təkrarlanan vahidləri 10-100 nukleotiddən, STR-nin təkrarlanan vahidi isə 2-13 nukleotiddən ibarətdir. VNTR və STR məhkəmə araşdırmalarında geniş istifadə olunur.
VNTR nədir?
Tandem təkrarı müəyyən bir xromosom lokusunda başdan-ayağa təkrarlanan qısa DNT ardıcıllığıdır. Tandem təkrarında başqa ardıcıllıq və ya nukleotid yoxdur. Genomda bir neçə növ tandem təkrarı var. VNTR, onların arasında 10-100 nukleotiddən ibarət təkrar vahidlərə malik olan tandem təkrarının bir növüdür. VNTR mini peyk növüdür. Bu tandem təkrarları bir çox xromosomlarda tapıla bilər. Onlar insan genomunda kəsişib və əsasən xromosomların subtelomerik bölgələrində yerləşirlər.
VNTR-lər fərdlər arasında tandem təkrar polimorfizmini göstərir. Xromosomun müəyyən bir yerində VNTR-nin uzunluğu, həmin DNT bölməsində təşkil edilən təkrarlanan vahidlərin sayındakı dəyişkənliyə görə fərdlər arasında olduqca dəyişkəndir. Buna görə də, VNTR fərdlərin identifikasiyasında güclü bir vasitə kimi istifadə edilə bilər və VNTR analizi genetika, biologiya tədqiqatı, məhkəmə tibb və DNT barmaq çapı da daxil olmaqla bir çox sahədə istifadə olunur. VNTRs sümük iliyi transplantasiyasının kəmiyyətini müəyyən etmək üçün istifadə edilən ilk genetik markerlər idi. VNTR-lər həmçinin məhkəmə ekspertizasında DNT profilinin yaradılmasında istifadə edilən ilk polimorfik markerlər idi.
Şəkil 01: Altı fərddə VNTR-lərin dəyişməsi
VNTR analizi məhdudlaşdırıcı fraqment uzunluğu polimorfizmi və ardınca cənub hibridizasiyası vasitəsilə həyata keçirilir. Beləliklə, nisbətən böyük bir DNT nümunəsinə ehtiyacı var. VNTR profilinin şərhi də problemlidir. Bu məhdudiyyətlərə görə, məhkəmə genetikasında VNTR-nin istifadəsi məhdudlaşdırılmışdır və o, STR analizi ilə əvəz edilmişdir.
STR nədir?
STR tandem qaydasında təşkil edilmiş iki-on üç nukleotid təkrarlanan vahiddən ibarət yüksək təkrarlanan DNT bölməsidir. STR VNTR-ə bənzəyir. Ancaq VNTR-dən təkrarlanan ardıcıllıqdakı nukleotidlərin sayından və təkrarların sayından dəyişir. STR mikropeyk növüdür.
STR analizi təkrarlanan vahidlərin dəqiq sayının ölçülməsində iştirak edir. STR-lər VNT-lərə bənzər fərdlər arasında çox dəyişkəndir. STR profilləri şəxsdən şəxsə dəyişir. Buna görə də, STR analizi molekulyar biologiyada iki və ya daha çox nümunədən DNT-də xüsusi lokusları müqayisə etmək üçün istifadə olunur. Beləliklə, STR-lər molekulyar biologiyada güclü genetik markerlər hesab olunur. O, yüksək polimorfizm dərəcəsinə və nisbətən qısa uzunluğa görə şəxslərin identifikasiyası üçün əla vasitədir.
Hazırda STR-lər məhkəmə genetikasında ən çox istifadə edilən analiz edilmiş genetik polimorfizm alətidir. Əksər məhkəmə işlərinə STR polimorfik analiz daxildir. STR lokusları bütün genomda yayılmışdır. Məhkəmə analizində istifadə oluna bilən xromosomlarda minlərlə STR var. STR analizi VNTR analizi kimi məhdudiyyət uzunluğu polimorfizmini əhatə etmir. STR analizi məhdudlaşdırıcı fermentlərlə DNT-ni kəsmir. İstənilən bölgələri DNT-yə əlavə etmək üçün xüsusi zondlar istifadə olunur və PCR texnikasından istifadə etməklə STR-nin uzunluqları müəyyən edilir.
Şəkil 02: Nümunələr arasında STR dəyişikliyi
VNTR və STR arasında hansı oxşarlıqlar var?
- VNTR və STR kodlaşdırılmayan DNT-dir.
- Hər ikisi tandem təkrarıdır.
- Hər ikisi DNT bölməsinin uzunluğundakı fərqə görə fərdlər arasında polimorfizm göstərir.
- Hər ikisi DNT barmaq çapında və məhkəmə-tibbi tədqiqatlarda güclü genetik markerlər kimi istifadə olunur.
VNTR və STR arasındakı fərq nədir?
VNTR vs STR |
|
| VNTR tandem qaydasında təkrarlanan qısa nukleotid ardıcıllığına malik kodlaşdırılmayan təkrarlanan DNT-dir. | STR tandem qaydasında təşkil edilmiş iki-on üç nukleotid təkrarlanan vahiddən ibarət yüksək təkrarlanan DNT bölməsidir. |
| Ölçü | |
| VNTR-lər STR-dən böyükdür. | STR-lər VNTR-lərdən kiçikdir. |
| Təkrarlanan ardıcıllıqla nukleotidlərin sayı | |
| VNTR-nin təkrarlanan vahidi 10-100 nukleotiddən ibarətdir. | STR-nin təkrarlanan vahidi 2-13 nukleotiddən ibarətdir. |
Xülasə – VNTR vs STR
VNTR və STR molekulyar biologiyada, xüsusən də məhkəmə genetikası sahəsində istifadə olunan iki güclü genetik markerdir. VNTR mini peyk növüdür, STR isə mikropeykdir. VNTR və STR kodlaşdırılmayan, çox təkrarlanan DNT-dir. Onlar tandem təkrarıdır. VNTR və STR-nin ümumi quruluşu eynidir. Ancaq təkrarlanan ardıcıllıqdakı nukleotidlərin sayı və uzunluğu fərqlidir. VNTR 10-100 nukleotiddən ibarət təkrarlanan ardıcıllığa malikdir. STR 2 ilə 13 nukleotiddən ibarət təkrarlanan ardıcıllığa malikdir. Bu VNTR və STR arasındakı fərqdir.
VNTR vs STR-in PDF versiyasını endirin
Bu məqalənin PDF versiyasını yükləyə və sitat qeydlərinə uyğun olaraq onu oflayn məqsədlər üçün istifadə edə bilərsiniz. Lütfən, PDF versiyasını buradan yükləyin VNTR və STR arasındakı fərq.
