Polisom profilinin yaradılması ilə ribosom profilinin yaradılması arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, polisom profili tərcümə zamanı həm ribosom, həm də mRNA (polisom) istifadə edərək ribosom davranışını təhlil edir, ribosom profili isə tərcümə zamanı yalnız mRNA ardıcıllığından istifadə edərək ribosom davranışını təhlil edir.
Tərcümə mRNT-dəki məlumatı amin turşusu ardıcıllığına çevirən zülal sintezinin ikinci mərhələsidir. Translatomika bir orqanizmin hüceyrəsində aktiv şəkildə tərcümə olunan ORF-lərin (açıq oxu çərçivələri) öyrənilməsidir. Polisom və ribosom profilləşdirmə üsulları, translatomun təhlili kontekstində fərqli parametrləri qiymətləndirmək və nəticə çıxarmaq üçün molekulyar biologiya sahəsində iki növ texnikadır.
Polysome Profiling nədir?
Polizom profilinin yaradılması həm ribosomun, həm də mRNT-nin (polisom) davranışını təhlil edərək xüsusi mRNT-nin tərcümə vəziyyətini müəyyən edən bir texnikadır. Başqa sözlə, bu texnika mRNA-ların ribosomlarla əlaqəsi haqqında məlumat və nəticələr verir. Polisom tərcümənin uzanma fazası zamanı mövcud olan mRNT ilə əlaqəli ribosomlar qrupuna aiddir.
Şəkil 01: Polysome Profiling
Polizomların profilləşdirilməsi hüceyrə lizatını tələb edir, sonra sentrifuqa edilir. Daha sonra sentrifuqa edilmiş nümunə ribosomların kiçik və böyük alt bölmələrini və polisomun formalaşmasında iştirak edən müvafiq mRNT-ni xarakterizə etmək üçün onların sıxlığına əsasən ayrılır. Bundan əlavə, proses optik sıxlığın ölçülməsini də əhatə edir. Mütəxəssislərdən polisom profilinin yaradılması tələb olunur.
Polysome profilləşdirmə texnikası bir çox tətbiqlər üçün vacib vasitədir. Alimlər hüceyrələrdə tərcümə dərəcəsini öyrənmək üçün bu texnikadan istifadə edirlər. Daha dəqiq desək, bu, ayrı-ayrı zülalların və onların xüsusi mRNA-larının öyrənilməsi haqqında dəqiq məlumat vermək üçün bir vasitədir. Müəyyən bir mRNT-nin tərcümə dərəcəsinin öyrənilməsi kontekstində polisom profilləşdirmə texnikası həyati əhəmiyyət kəsb edir. Burada mRNT-nin 3' və 5' ardıcıllığı onların istehsal edilən mRNT miqdarına və tərcümə səviyyəsinə təsirlərinə istinad edərək araşdırıla bilər.
Ribosom profilləşdirmə nədir?
Ribosom profili tərcümə zamanı ribosomun mRNA ilə bağlı davranışını təhlil edən bir texnikadır. Bu texnika Joan Steitz və Marilyn Kozak tərəfindən tapıldı və inkişaf etdirildi. Daha sonra bu texnologiya iki alim, Nikolas və Conatan tərəfindən növbəti nəsil sekvensiya ilə birlikdə daha da inkişaf etdirildi və bu, Ribosomun Yaxınlığının Təmizlənməsi (TRAP) metodologiyasının tərcüməsi kimi müxtəlif əlaqəli texnikaların inkişafına səbəb oldu.
Şəkil 02: Ribosom ardıcıllığı
Ribosom profilinin yaradılması proseduru mRNT-nin təcrid olunmasını, ribosomlara bağlı olmayan RNT-nin çıxarılmasını və ribosomlara bağlı mRNT-nin ayrılmasını əhatə edir. Bu prosedurdan sonra mRNT izolatı əks transkripsiya edilir və cDNT sintezi baş verir. Nəhayət, mRNA ilə bağlı ribosom davranışının xüsusiyyətlərini çıxarmaq üçün ardıcıllıq məlumatları tərcümə profili ilə uyğunlaşdırıla bilər.
Ribosom profili bir çox tədqiqatçılara tərcümənin başlanğıc yerlərinin yerini, hüceyrə və ya toxumada tərcümə edilmiş açıq oxu çərçivələrinin (ORF) tamamlayıcısını, mRNT-də ribosomların paylanmasını və sürətini müəyyən etməyə və nəticə çıxarmağa kömək edir. ribosomların tərcüməsi. Ribosomların profilləşdirilməsi həmçinin ribosom izi və ya Ribo Seq. kimi tanınır.
Polizomların profilləşdirilməsi və ribosomların profilləşdirilməsi arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Polizom və ribosom profilinin yaradılması tədqiqatda vacib olan molekulyar bioloji üsullardır.
- Tərcümə prosesi haqqında məlumat verirlər.
- Hər iki profilləmə prosesi tərcümənin təhlili vasitəsilə məlumat verir.
- Dəqiq nəticələr üçün hər iki texnikanı yerinə yetirmək üçün peşəkar ekspertlər lazımdır.
- Bioinformatika alətləri hər iki texnikada mühüm rol oynayır.
Polizomların profilləşdirilməsi ilə Ribosomların profilləşdirilməsi arasındakı fərq nədir?
Polisom profili tərcümə zamanı həm ribosom, həm də mRNA (polisom) istifadə edərək ribosom davranışını təhlil edir, ribosom profili isə tərcümə zamanı yalnız mRNT ardıcıllığından istifadə edərək ribosom davranışını təhlil edir. Beləliklə, bu, polisom profilləşdirmə və ribosom profilləşdirmə arasındakı əsas fərqdir. Üstəlik, polisom profili sıxlıq qradiyentinin sentrifuqalanması və optik sıxlığın ölçülməsi kimi üsulları əhatə edir, ribosom profili isə mRNT çıxarılması və ardıcıllıq üsullarını əhatə edir. Həmçinin, ribosom profili polisom profilindən daha dəqiqdir.
Aşağıdakı infoqrafika yan-yana müqayisə üçün polisom və ribosom profili arasındakı fərqləri cədvəl şəklində təqdim edir.
Xülasə – Polizom Profili vs Ribosom Profili
Tərcümə mRNT ardıcıllığı haqqında məlumatın amin turşusu ardıcıllığına çevrilməsini nəzərdə tutan zülal sintezinin ikinci mərhələsidir. Bu proses üçün mRNT şablonu, ribosomlar, amin turşuları, tRNT və digər amillər tələb olunur. Polisom və ribosom profili iki molekulyar üsuldur. Polisom profili tərcümə zamanı həm ribosom, həm də mRNA (polisom) istifadə edərək ribosom davranışını təhlil edir, ribosom profili isə tərcümə zamanı yalnız mRNA ardıcıllığından istifadə edərək ribosom davranışını təhlil edir. Polisom profilinin yaradılması sıxlıq qradiyenti sentrifuqasiyası və optik sıxlığın ölçülməsi kimi üsulları əhatə edir. Ribosomların profilləşdirilməsi mRNT çıxarılması, cDNA sintezi və ardıcıllıq kimi üsulları əhatə edir. Beləliklə, bu, polisom profili ilə ribosom profili arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
