T4 DNT liqaza ilə E. coli DNT liqase arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, T4 DNT liqase T4 bakteriofaqından təcrid olunmuş fermentdir, E. coli DNT liqase isə E. coli bakteriyasından təcrid olunmuş fermentdir..
DNT liqase fosfodiester bağının əmələ gəlməsi ilə DNT zəncirlərinin birləşməsini asanlaşdıran xüsusi bir ferment növüdür. Canlı orqanizmlərin DNT-sindəki tək zəncirli qırılmaları və iki zəncirli qırılmaları təmir etməklə mühüm rol oynayır. Üstəlik, DNT liqazı həm DNT təmirində, həm də DNT replikasiyasında istifadə olunur. Yuxarıda göstərilən istifadələrdən başqa, DNT liqazası rekombinant DNT texnologiyası kimi molekulyar biologiya təcrübələrində də geniş istifadəyə malikdir. T4 DNT liqaz və E. coli DNT liqase iki növ DNT liqaz fermentidir.
T4 DNT Ligase nədir?
T4 liqaza T4 bakteriofaqından təcrid olunmuş DNT-ni birləşdirən fermentdir. T4 bakteriofaqı Escherichia coli-ni yoluxduran bir virusdur. T4 ligaza fermenti molekulyar bioloji laboratoriya tədqiqatlarında ən çox istifadə edilən DNT liqazdır. Normalda, T4 liqaza bitişik nukleotidlərin 5' fosfat və 3' hidroksil qrupları arasında iki zəncirli DNT-nin birləşmiş və ya küt uclu zəncirinin birləşməsini katalizləşdirir. O, həmçinin RNT-nin dupleks molekulda DNT və ya RNT zəncirinə birləşməsini kataliz edə bilər. Bununla belə, bu ferment tək zəncirli nuklein turşularına qoşulmayacaq. Üstəlik, o, E. coli DNT liqazından daha yüksək effektivliklə küt uçlu DNT-ni bağlaya bilir.
Şəkil 01: T4 DNT liqaz
Bu ferment kofaktor kimi ATP tələb edir. Bəzi gen mühəndisliyi tədqiqat təcrübələri artıq vəhşi tipli T4 DNT liqazından daha aktiv DNT liqaz fermentləri istehsal etmişdir. Yanaşmalardan birində onlar T4 DNT liqazını p50 və ya NF-kB molekuluna birləşdirərək füzyon fermenti molekulu yaratdılar. Bu yeni T4 liqaza fermenti vəhşi tipli T4 DNT liqaza ilə müqayisədə klonlama məqsədləri üçün küt uc liqasiyalarda 160% daha aktiv idi. Bundan əlavə, ligasiya reaksiyasını daha dəqiq kataliz etmək üçün T4 DNT liqazının optimal temperaturu 16 °C-dir.
E Coli DNT Ligase nədir?
E. coli DNT liqase E. coli bakteriyasından təcrid olunmuş fermentdir. E. coli DNT liqazını yaratmaqdan məsul olan gen lig genidir. E. coli DNT-si, ligaza, eləcə də əksər prokaryotların DNT liqazları fosfodiester bağını yaratmaq üçün NAD (nikotinamid adenin dinukleotid) tərəfindən əldə edilən enerjidən istifadə edir.
Şəkil 02: E. Coli DNT Ligase
E. coli DNT liqazası 5' fosfat ucları və 3' hidroksil ucları olan ikiqat zəncirli DNT fraqmentləri arasında fosfodiester bağlarının əmələ gəlməsini kataliz edərək DNT fraqmentlərini birləşdirə bilən bir bağlama fermentidir. Bundan əlavə, polietilen qlikol ilə molekulyar sıxılma kimi xüsusi şərtlər istisna olmaqla, küt uçlu DNT-ni bağlamır. O, həmçinin RNT-ni DNT-yə effektiv şəkildə birləşdirə bilmir. Bundan əlavə, E. coli DNT liqazının fəaliyyəti DNT polimeraza 1-in lazımi konsentrasiyada olması ilə gücləndirilə bilər. Bununla belə, DNT polimeraza 1 fermentinin konsentrasiyası daha yüksək olduqda, E. coli DNT liqaz aktivliyinə mənfi təsir göstərir.
T4 DNT Ligase və E Coli DNT Ligase arasında hansı oxşarlıqlar var?
- T4 DNT liqase və E-coli DNT liqase iki növ DNT liqase fermentidir.
- Hər ikisi amin turşularından ibarət zülallardır.
- Bu fermentlər dupleks DNT-də yan-yana yerləşdirilən 5' fosfat və 3' hidroksil sonları arasında fosfodiester bağının əmələ gəlməsini katalizləyir.
- Onların rekombinant DNT texnologiyası kimi molekulyar biologiya təcrübələrində geniş istifadələri var.
T4 DNT Ligase və E Coli DNT Ligase Arasındakı Fərq Nədir?
T4 DNT liqazası T4 bakteriofaqından, E. coli DNT liqaza isə E. coli bakteriyalarından təcrid olunmuş fermentdir. Beləliklə, bu, T4 DNT liqazı ilə E. coli DNT liqazı arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, T4 DNT liqaz üçün enerji mənbəyi ATP-dir. Digər tərəfdən, E. coli DNT liqaz üçün enerji mənbəyi NAD-dır.
Aşağıdakı infoqrafika yan-yana müqayisə üçün T4 DNT liqazası ilə E coli DNT liqazası arasındakı fərqləri cədvəl şəklində təqdim edir.
Xülasə – T4 DNT Ligase vs E Coli DNT Ligase
T4 DNT liqaza və E. coli DNT liqase dupleks DNT-də yan-yana yerləşdirilən 5' fosfat və 3' hidroksil sonları arasında fosfodiester bağının əmələ gəlməsini kataliz edən iki fermentdir. T4 liqaza T4 bakteriofaqından, E. coli DNT liqaza isə E. coli bakteriyasından təcrid olunmuş fermentdir. Beləliklə, T4 DNT liqazı ilə E coli DNT liqazası arasındakı əsas fərq budur.
