Hüceyrəsiz DNT ilə dövran edən şiş DNT-si arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, hüceyrəsiz DNT qanda sərbəst dövr edən müxtəlif DNT formalarıdır, şiş DNT-si isə qanda dövr edən parçalanmış şişdən əldə edilən DNT-dir.
Hüceyrəsiz DNT və dövran edən şiş DNT iki növ dövr edən nuklein turşularıdır. Sirkulyasiya edən nuklein turşuları 1948-ci ildə Mandel və Metal tərəfindən kəşf edilmişdir. Daha sonra aşkar edilmişdir ki, xəstə xəstələrdə dövriyyədə olan nuklein turşularının miqdarı xeyli yüksəkdir. Bu kəşf ilk dəfə lupus xəstələri ilə əlaqədar edildi. Bundan əlavə, dövriyyədə olan nuklein turşuları daha yüksək proqnostik dəyərə malikdir və müxtəlif xəstəliklərin aşkarlanması üçün biomarker kimi istifadə edilə bilər.
Hüceyrəsiz DNT nədir?
Hüceyrəsiz DNT (Cf DNT) qanda sərbəst dövr edən dövran edən şiş DNT, hüceyrəsiz mitoxondrial DNT və hüceyrəsiz fetal DNT və s. kimi müxtəlif DNT formalarına aiddir. Hüceyrəsiz DNT-nin yüksək səviyyələri xərçəng, travma, sepsis, miokard infarktı, diabet, insult, oraq hüceyrə xəstəliyi və s. kimi inkişaf etmiş xəstəliklərdə müşahidə olunur. Xərçəng və döl təbabətinə əlavə olaraq, hüceyrəsiz DNT bir çox xəstəlik üçün faydalı biomarkerdir. çoxlu xəstəliklər. Bu DNT transplantasiyadan imtinanı aşkar etmək üçün də istifadə edilə bilər. Onlar həmçinin adi stressin müəyyən edilməsində, doğuşdan əvvəl cinsiyyətin müəyyən edilməsində və atalıq testində istifadə olunur.
Şəkil 01: Hüceyrəsiz DNT
Hüceyrəsiz DNT adətən DNT-nin ikiqat zəncirli hüceyrədənkənar molekuludur. Kiçik fraqmentlərdən (50-200 bp) və daha böyük fraqmentlərdən (21 kb) ibarətdir. Bundan əlavə, o, artıq prostat və döş xərçənginin diaqnozu üçün etibarlı biomarker kimi tanınıb. Hüceyrəsiz DNT əsasən qan dövranında nukleosomlar şəklində dövr edir. Nukleosomlar histonların və DNT-nin nüvə kompleksləridir. Cf DNT-si PCR, kütləvi paralel ardıcıllıq, ultrabənövşəyi spektrometriya, PicoGreen boyanması və ELISA kimi müxtəlif üsullardan istifadə etməklə ölçülə bilər. Qan dövranında Cf DNT-nin aşkarlanması sürətli, asan, qeyri-invaziv, təkrarlanan üsul olduğundan, gələcəkdə autoimmun revmatik xəstəliklər və şişlər kimi çoxsaylı xəstəliklərin diaqnostikası üçün potensial biomarker olacaqdır.
Dövran edən şiş DNT nədir?
Dövran edən şiş DNT-si (Ct DNT) qanda dövr edən parçalanmış şişdən əldə edilən DNT-dir. Şiş mənşəlidir. Sirkulyasiya edən bir şiş bütün şiş genomunu əks etdirə bildiyindən, klinik quruluşlarda potensial faydası üçün geniş cazibə qazanmışdır. Qan çəkən maye biopsiya dövriyyədə olan şişləri yoxlamaq üçün istifadə edilə bilər.
Şəkil 02: Dolaşan Şiş DNT-si
Ct DNT-nin sərbəst buraxılmasında iştirak edən bioloji proseslərə ölməkdə olan hüceyrələrdən apoptoz və nekroz və ya şiş hüceyrələrindən aktiv sərbəst buraxılma daxildir. Sağlam toxumalarda infiltrasiya edən faqositlər Ct DNT-ni təmizləyə bilir. Bundan əlavə, sirkulyasiya edən şiş DNT-nin analizində damcı rəqəmsal PCR, BEAMing, CAPP-Seq (dərin ardıcıllıq), Safe-sequencing və duplex sequencing kimi müxtəlif üsullardan istifadə edilə bilər.
Hüceyrəsiz DNT ilə Dolaşan Şiş DNT-si arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Hüceyrəsiz DNT və sirkulyasiya edən şiş DNT iki növ dövr edən nuklein turşularıdır.
- Onlar nukleotidlərdən ibarətdir.
- Hər iki növ klinik quruluşlarda müxtəlif xəstəliklərin diaqnostikası üçün potensial marker kimi istifadə edilə bilər.
- Onlar qan dövranında olur.
- Hər ikisi DNT molekullarının hüceyrədənkənar formalarıdır.
- Onların hər ikisi infiltrasiya edən faqositlərlə təmizlənir.
Hüceyrəsiz DNT ilə Dolaşan Şiş DNT-si Arasındakı Fərq Nədir?
Hüceyrəsiz DNT qanda sərbəst dövr edən, dolaşan şiş DNT-si, hüceyrəsiz mitoxondrial DNT və hüceyrəsiz döl DNT-si və s. kimi müxtəlif DNT formalarıdır, halbuki dövran edən şiş DNT-si parçalanmış şişdən əldə edilən DNT-dir. ki, qanda dövr edir. Beləliklə, bu hüceyrəsiz DNT ilə sirkulyasiya edən şiş DNT arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, hüceyrəsiz DNT 50-220 bp arasında dəyişən fraqmentlərdə, sirkulyasiya edən şiş DNT isə 134-144 bp arasında dəyişən fraqmentlərdə dövr edir.
Aşağıdakı infoqrafika yan-yana müqayisə üçün hüceyrəsiz DNT ilə dövran edən şiş DNT-si arasındakı fərqi cədvəl şəklində təqdim edir.
Xülasə – Hüceyrəsiz DNT və Dolaşan Şiş DNT-si
Dövran edən nuklein turşuları tənzimlənən və ya təsadüfi mexanizmlər vasitəsilə qan dövranına atılır. Hüceyrəsiz DNT və dövran edən şiş DNT iki növ dövr edən nuklein turşularıdır. Hüceyrəsiz DNT DNT-nin müxtəlif formalarıdır, məsələn, dövran edən şiş DNT, hüceyrəsiz mitoxondrial DNT, qanda sərbəst dövr edən hüceyrəsiz döl DNT-si, dövran edən şiş DNT-si qanda dövr edən parçalanmış şiş əldə edilmiş DNT-dir. Beləliklə, bu, hüceyrəsiz DNT ilə dövran edən şiş DNT-si arasındakı fərqi ümumiləşdirir.