Əsas Fərq – DNT Ligase vs DNT Polimerase
DNT liqaza və DNT polimeraza orqanizmlərin DNT replikasiyası və DNT təmiri mexanizmlərində iştirak edən mühüm fermentlərdir. DNT liqazası nukleotidlər arasında fosfodiester bağlarının əmələ gəlməsini kataliz edərək DNT fraqmentlərini birləşdirməyə cavabdehdir. DNT polimeraza şablon DNT istifadə edərək onun tikinti bloklarından (nukleotidlərdən) DNT sintezindən məsuldur. Bu, DNT liqaza və DNT polimeraza arasındakı əsas fərqdir.
DNT Ligase nədir?
DNT liqase 3’ – OH və 5’- PO4 nukleotid qrupları arasında fosfodiester bağının əmələ gəlməsini kataliz edən və DNT fraqmentlərinin birləşməsini asanlaşdıran fermentdir. O, həmçinin molekulyar stitcher kimi tanınır. Bu qabiliyyət DNT-nin boşluqlarını və ya yarıqlarını doldurmağa və DNT replikasiyası zamanı əmələ gələn Okazaki fraqmentlərini birləşdirməyə imkan verir. DNT ligazaları rekombinant DNT molekullarının istehsalı üçün rekombinant DNT texnologiyasında çox faydalıdır. DNT liqazı vektor DNT ilə maraqlanan DNT birləşir. Buna görə də orqanizmlər üçün vacib fermentdir.
DNT liqaz fermenti funksiyası üçün kofaktordan və Mg2+ ionlarından asılıdır. DNT ligazalarına kömək edən iki kofaktor var. NAD+ bakterial DNT liqazaları üçün kofaktor kimi çıxış edir, ATP isə tez-tez kofaktor virus və eukaryotik DNT liqazaları kimi çıxış edir. Eukaryotik DNT liqaz fəaliyyəti üç əsas addımla tamamlanır.
Addım 01. DNT liqaza ATP molekuluna hücum edir və pirofosfat (iki fosfat qrupu) və AMP buraxır və nəticədə AMP ilə kovalent bağlanaraq liqaza-adenilat ara məhsulu əmələ gətirir.
Addım 02: əmələ gələn AMP aralıq fermenti AMP-ni nikin 5' fosfatına köçürür və DNT – adenilat əmələ gətirir (DNT zəncirinin 5′-fosfat oksigeni liqaza-adenilat ara məhsulunun fosforuna hücum edir).
Addım 03: DNT liqaza polinukleotidlərə qoşulmaq üçün nikin 3′-OH-nin DNT-adenilat üzərinə hücumunu katalizləyir və AMP-ni azad edir.
DNT liqazları adətən T4 bakteriofaqından təcrid olunur və rekombinant DNT texnologiyasında geniş şəkildə istifadə olunur.
Şəkil 01: Nick təmirində DNT liqazası
DNT Polimeraz nədir?
DNT polimeraza DNT sintezində və genom replikasiyasında iştirak edən bütün orqanizmlərdə mövcud olan hər yerdə olan bir fermentdir. Genetik məlumat DNT polimerazalarının köməyi ilə valideyndən nəslə keçir. Mövcud DNT üçün tamamlayıcı yeni DNT sintezini katalizləyir. DNT polimeraza primer ardıcıllığının 3' OH qrupuna nukleotidləri (nuklein turşularının tikinti blokları) əlavə edir və zəncir əmələ gəlməsini 5' istiqamətində davam etdirir. DNT polimerazalarının əksəriyyəti 5'-dən 3'-ə qədər polimeraza və 3'-dən 5'-ə qədər eksonükleaza aktivliyinə malikdir.
Prokaryotik DNT polimerazaları beş əsas qrupda təsvir edilmişdir. Eukariotlarda ən azı 16 müxtəlif DNT polimeraz var. Bütün bu DNT polimerazaları yeddi ailəyə, yəni A, B, C, D, X, Y və RT (Əks transkriptaza) qruplaşdırılıb.
Şəkil 02: DNT polimeraza əsaslanan DNT replikasiyası
DNT Ligase və DNT Polimerase arasındakı fərq nədir?
DNT Ligase vs DNT Polimerase |
|
| DNT liqase nukleotidlər arasında fosfodiester bağlarının əmələ gəlməsini kataliz edən və DNT fraqmentlərini birləşdirən fermentdir. | DNT polimeraza nukleotidlərdən istifadə edərək DNT sintezini kataliz edən fermentdir. |
| DNT Replikasiyasında Rol | |
| DNT liqase DNT replikasiyasında Okazaki fraqmentlərini birləşdirən əlavə fermentdir. | DNT polimeraza DNT replikasiyasında əsas fermentdir. |
| Tələblər | |
| Mg2+ ionlarından və ATP/NAD+ kofaktorlardan asılıdır | Bu, şablondan, nukleotidlərdən, primerlərdən və Mg2+-dan asılıdır. |
| Funksiyalar | |
| DNT liqaza DNT rekombinasiyası, DNT təmiri və DNT replikasiyası üçün vacibdir. | DNT polimeraza DNT replikasiyası, DNT təmiri və DNT rekombinasiyası texnologiyası üçün vacibdir. |
Xülasə – DNT Ligase vs DNT Polimerase
DNT liqase fosfodiester bağları ilə DNT fraqmentlərini birləşdirmək üçün lazım olan vacib bir fermentdir. DNT polimeraza yeni DNT sintezi üçün vacib olan əsas fermentdir. DNT ligaza və DNT polimeraza arasındakı əsas fərq onların funksiyasıdır. Bununla belə, hər iki ferment DNT təmiri, DNT replikasiyası və rekombinant DNT texnologiyası üçün vacibdir.
