Cis və trans splicing arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, cis splicing intronları çıxaran və eyni RNT transkriptində olan ekzonları birləşdirən molekuldaxili mexanizmdir, trans-splaycing isə intronları və ya outronları çıxaran molekullararası mexanizmdir. eyni RNT transkriptində olmayan ekzonlara qoşulur.
RNT-nin birləşdirilməsi protein sintezindən əvvəl RNT-nin emal formasıdır. Bu prosesdə yeni hazırlanmış pre-messenger RNT transkripti yetkin bir mesajçı RNT-yə çevrilir. Yetkin xəbərçi RNT protein molekulu istehsal etməyə kömək edir. RNT-nin birləşdirilməsi zamanı intronlar (kodlaşdırmayan bölgələr) çıxarılır və ekzonlar (kodlaşdırma bölgələri) yetkin mRNT yaratmaq üçün birləşir. Cis və trans splicing iki növ RNT-ni birləşdirmək mexanizmləridir.
Cis Splicing nədir?
Cis splicing intronları çıxaran və eyni RNT transkriptində olan ekzonları birləşdirən molekuldaxili mexanizmdir. Normal cis splicing tək bir RNT molekulunu emal edir. Cis splicing spliceosomlar tərəfindən həyata keçirilən premRNT-nin tipik birləşməsi prosesidir. İntronda donor sahəsi (intronun 5' ucu), filial sahəsi (intronun 3' ucuna yaxın) və qəbuledici sahə (intronun 3' ucu) birləşmə üçün çox vacibdir. Birləşmə donor sahəsinə intronun 5' ucunda invariant ardıcıl GU daxildir. İntronun 3' ucundakı birləşmə qəbuledici sahəsi invariant AG ardıcıllığına malikdir. AG ardıcıllığından yuxarıda, pirimidin bölgəsi (polipirimidin yolu) adlanan bir bölgə var. Polipirimidin traktından daha yuxarıda, adenozin nukleotidini ehtiva edən bir qol nöqtəsi var. Bu nukleotid lariat əmələ gəlməsində iştirak edir.
Şəkil 01: Cis və Trans Splicing
Əsas spliceosomlar U1, U2, U4, U5 və U6-dır. Onların arasında U1 və U2 çox önəmlidir. Cis splicing-də U1 5' birləşmə yerinə, U2 isə 3' birləşmə sahəsinə yaxın budaq nöqtəsinə bağlanır. U5/U4/U6 eksonları 5' yerində, U6 isə U2 ilə bağlayır. Daha sonra U1 buraxılır. U5 ekzondan introna keçir və U6 5' birləşmə yerində bağlanır. Bundan əlavə, U4 də buraxılır. U6/U2 transesterifikasiyanı kataliz edir, intron liqatının 5' ucunu intronda A nukleotidinə çevirir. Bu, lariat meydana gəlməsinə səbəb olur. Lariatın əmələ gəlməsində U5 eksonu 3' birləşmə yerində bağlayır və 5' yerində parçalanır. Birləşmənin son mərhələsində U2/U5/U6 lariata bağlı qalır və 3' yeri parçalanır. Bundan əlavə, bu mərhələdə ekzonlar ATP hidrolizindən istifadə edərək bağlanır.
Trans Splicing nədir?
Trans splicing intronları və ya outronları çıxaran və eyni RNT transkriptində olmayan ekzonları birləşdirən molekullararası mexanizmdir. Trans-splaycing-də U1 zülalının bağlanması üçün premRNA molekulunda 5' birləşmə yeri yoxdur. Əvəzində qapaqlı splice lideri (SL) RNT outrondakı ardıcıllığa ötürülür.
Şəkil 02: Trans Splicing
Outron pre mRNT-nin 5' qapağı ilə trans splice sahəsi arasındakı bölgəsidir. Bununla birlikdə, U2 zülalı adətən 3' birləşmə yerinə bağlanır. Outronu çıxardıqdan sonra birləşmə lideri (SL) eksonu pre mRNT-də birinci ekzona birləşir. Bundan əlavə, trans-splicing, genləri ifadə etmək üçün Kinetoplastae sinfinin protistləri kimi müəyyən mikroorqanizmlərdə müşahidə olunan bir mexanizmdir.
Cis və Trans Splicing arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Cis və trans splicing RNT-nin birləşdirilməsi mexanizmlərinin iki növüdür.
- Hər iki mexanizmdə intronlar çıxarılır.
- Həmçinin, hər iki mexanizmdə ekzonlar birləşərək yetkin mRNT əmələ gətirir.
- Hər iki mexanizm eukariotlarda olur.
- Bu mexanizmlər prokariotlarda yoxdur.
Cis və Trans Splicing Arasındakı Fərq Nədir?
Cis splicing intronları çıxaran və eyni RNT transkriptində olan eksonları birləşdirən intramolekulyar mexanizmdir, trans-splaycing isə intronları və ya outronları çıxaran və eyni RNT daxilində olmayan ekzonları birləşdirən molekullararası mexanizmdir. transkript. Beləliklə, bu cis və trans splicing arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, cis splicingində intronlar yetkin mRNT yaratmaq üçün çıxarılır. Digər tərəfdən, trans splicing zamanı intronlar və ya outronlar yetkin mRNT yaratmaq üçün çıxarılır.
Aşağıdakı infoqrafika yan-yana müqayisə üçün cis və trans birləşdirmə arasındakı fərqləri cədvəl şəklində sadalayır.
Xülasə – Cis vs Trans Splicing
RNT-nin birləşdirilməsi zülal sintezi prosesindən əvvəl RNT emalının bir formasıdır. Cis və trans splicing, eukaryotlarda olan iki növ RNT birləşmə mexanizmləridir. Cis splicing, intronları çıxaran və eyni RNT transkriptində olan ekzonları birləşdirən molekuldaxili mexanizmdir, trans-splikinq isə intronları və ya outronları çıxaran və eyni RNT transkriptində olmayan ekzonları birləşdirən molekullararası mexanizmdir. Beləliklə, bununla cis və trans splicing arasındakı fərqin müzakirəsi yekunlaşır.
