Serin və tirozin rekombinaz arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, serin rekombinazda serin, sahəyə xüsusi rekombinasiya zamanı DNT-yə hücum etmək üçün ferment tərəfindən istifadə edilən nukleofilik amin turşusudur, tirozin rekombinazda isə tirozin istifadə olunan nukleofilik amin turşusudur. site-spesifik rekombinasiya zamanı DNT-yə hücum etmək üçün ferment tərəfindən.
Sayta-spesifik rekombinasiya (konservativ sahəyə xüsusi rekombinasiya) müəyyən dərəcədə ardıcıllıq homologiyasına malik seqmentlər arasında DNT zəncirinin mübadiləsinin baş verdiyi genetik rekombinasiya texnikasının bir növüdür. Sahəyə məxsus rekombinazlar sahəyə xas rekombinasiya prosesini tənzimləyir. Bu fermentlər serin rekombinaz ailəsi və tirozin rekombinaz ailəsi kimi iki ailəyə qruplaşdırılır. Adlar, DNT-yə hücum etmək üçün istifadə edilən və sahəyə xüsusi rekombinasiyada zəncir mübadiləsi zamanı onunla kovalent şəkildə bağlanan rekombinazların yuxarıdakı iki sinfində mövcud olan konservləşdirilmiş nukleofilik amin turşusu qalığından gəlir.
Serin Rekombinaz nədir?
Sahəyə xüsusi rekombinasiya metodunda iki qısa DNT ardıcıllığı (“hədəf saytlar”) hər iki zəncirdə xüsusi nöqtələrdə kəsilir və kəsilmiş uclar yeni tərəfdaşlara yenidən birləşdirilir. Sahəyə xüsusi rekombinasiya texnologiyaları, DNT-nin hədəf hissəsini əvəz etmək üçün rekombinaz fermentlərindən asılı olan gen mühəndisliyində genomik alətlərdir. Bu DNT-nin yenidən qurulmasını müxtəlif məqsədlər üçün yerinə yetirmək üçün bir çox sahəyə xas rekombinasiya sistemi aşkar edilmişdir. Lakin bütün bu rekombinaz fermentləri iki ailəyə aiddir. Serin rekombinaz onlardan biridir. Onlar üç növ DNT-nin yenidən qurulmasında vasitəçilik edə bilərlər: inteqrasiya, kəsilmə və inversiya.
Şəkil 01: Serin Rekombinaz
Serin rekombinaz kimi sahəyə xas rekombinazlar DNT onurğasını parçaladıqları qısa DNT ardıcıllığını (hədəf yer) tanıyaraq və ona bağlamaqla DNT-nin yenidən təşkilini həyata keçirir. Daha sonra iki DNT sarmalının mübadiləsi baş verir və DNT zəncirlərinin yenidən birləşməsi baş verir. Serin rekombinazda serin, sahəyə xüsusi rekombinasiya zamanı DNT-yə hücum etmək üçün ferment tərəfindən istifadə olunan amin turşusudur. DNT-nin parçalanması zamanı zülal-DNT bağı transesterifikasiya reaksiyası vasitəsilə əmələ gəlir. Fosfodiester bağı parçalanma yerindəki 5'fosfat qrupu ilə konservləşdirilmiş serin qalığının hidroksil qrupu arasındakı fosfoserin bağı ilə əvəz olunur. Yeni bağ hədəf yerində DNT-nin parçalanmasına sərf olunan enerjini saxlayır. Bu enerji daha sonra DNT-ni digər yerdə müvafiq dezoksiriboza hidroksil qrupuna birləşdirmək üçün istifadə olunur. Serin rekombinazlara misal olaraq serin rezolvazalar/invertazalar və serin inteqrazalardır.
Tirozin Rekombinaz nədir?
Tirozin rekombinaz konservativ sahəyə xas rekombinasiyanı tənzimləyən digər ferment sinfidir. Daha əvvəl təsvir edildiyi kimi, tirozin rekombinaz da DNT onurğasını parçaladıqları qısa bir DNT ardıcıllığını (hədəf yer) tanıyaraq və bağlayaraq eyni şəkildə DNT-nin yenidən təşkilini həyata keçirir. Daha sonra iki DNT spiralının mübadiləsi və DNT zəncirlərinin yenidən birləşməsi baş verir.
Şəkil 02: Tirozin Rekombinaz
Lakin tirozin rekombinazda tirozin, sahəyə xüsusi rekombinasiya zamanı DNT-yə hücum etmək üçün ferment tərəfindən istifadə edilən amin turşusudur. Bu sinfin ümumi xüsusiyyəti, 3′-fosfotirozin əlaqəsi yaratmaq üçün kəsici DNT-fosfata hücum edən konservləşdirilmiş nukleofil tirozin qalığıdır. Tirozin rekombinazlar (A1) və tirozin inteqrazları (A2) tirozin rekombinaz ferment ailəsindəki görkəmli ferment qruplarıdır.
Serin və tirozin rekombinaz arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Onlar rekombinaz fermentləri sinfidir.
- Hər ikisi sayta xas rekombinasiyanı tənzimləyir.
- Onlar zülallardır.
- Əsas kimyəvi reaksiya hər ikisi üçün eynidir.
- Hər ikisi transesterifikasiya reaksiyalarını kataliz edir.
Serin və tirozin rekombinazı arasındakı fərq nədir?
Serin rekombinazda serin, sahəyə xüsusi rekombinasiya zamanı DNT-yə hücum etmək üçün ferment tərəfindən istifadə edilən nukleofilik amin turşusudur. Digər tərəfdən, tirozin rekombinazda tirozin, xüsusi rekombinasiya zamanı DNT-yə hücum etmək üçün ferment tərəfindən istifadə olunan nukleofilik amin turşusudur. Beləliklə, bu, serin və tirozin rekombinaz arasındakı əsas fərqdir. Serin rekombinazanın ümumi xüsusiyyəti odur ki, o, DNT ilə fosfoserin bağı əmələ gətirir, tirozin rekombinaz isə sahəyə məxsus rekombinasiya prosesi zamanı DNT ilə fosfotirozin bağı yaradır.
Aşağıdakı infoqrafika serin və tirozin rekombinaz arasındakı fərqləri cədvəl şəklində sadalayır.
-
Cədvəl şəklində serin və tirozin rekombinaz arasındakı fərq
Xülasə – Serin vs Tirozin Rekombinaz
Rekombinasiya homoloqların rekombinasiyasında olduğu kimi DNT-nin oxşar molekulları arasında və ya homoloq olmayan rekombinasiyada olduğu kimi fərqli molekullar arasında baş verə bilər. Sahəyə spesifik rekombinasiya, DNT zəncirinin mübadiləsinin ən azı müəyyən dərəcədə ardıcıllıq homologiyasına malik seqmentlər arasında baş verdiyi bir genetik rekombinasiya növüdür. Rekombinazlar tərəfindən katalizlənir. Əksər rekombinazlar iki ailəyə qruplaşdırılır: serin rekombinaz və tirozin rekombinaz. Serin rekombinaz, sahəyə xüsusi rekombinasiya prosesi zamanı DNT-yə hücum etmək üçün nukleofilik amin turşusu kimi serindən istifadə edir. Tirozin rekombinaz, sahəyə xüsusi rekombinasiya prosesi zamanı DNT-yə hücum etmək üçün tirozini nukleofilik amin turşusu kimi istifadə edir. Buna görə də, bu, serin və tirozin rekombinaz arasındakı əsas fərqdir.
