dATP ilə ddATP arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, dATP DNT sintezini dayandırmır, ddATP isə DNT sintezini dayandıra bilir. Bunun səbəbi, ddATP-də pentoza şəkərin 3ʹ mövqeyinə bir H atomu, dATP isə 3ʹ mövqeyinə bağlı OH qrupu olmasıdır.
dNTP-lər DNT-nin tikinti bloklarıdır. Purin və ya pirimidin əsaslarına görə dörd növ dNTP var - bunlardan biri dATP. dATP-nin azotlu əsası adenozindir. ddNTP-lər Sanger ardıcıllığında istifadə olunan nukleotidlərdir. Dörd növ ddNTP var. ddATP ddNTP-dir.
dATP nədir?
Deoksiadenozin trifosfat DNT-nin tikinti bloku olan nukleotiddir. DNT polimeraza fermenti DNT sintezi üçün substrat kimi dATP-dən istifadə edir. dATP üç komponentdən ibarətdir: bir deoksiriboza şəkər molekulu, bir adenozin və üç fosfat qrupu. Buna görə də purin nukleosid trifosfatdır. dATP-nin kimyəvi formulu C10H16N5O12 P3, və onun molekulyar kütləsi 491.182.
Şəkil 01: dATP
dATP şəkər komponentləri baxımından ATP-dən (adenozin trifosfat) fərqlənir. ATP-də riboza şəkəri var. Transkripsiya zamanı dATP bazası urasil nukleotidi ilə cütləşir. DNT sintezində iştirak etməklə yanaşı, dATP həm də hüceyrə canlılığını qorumaq üçün enerji ötürən molekul kimi çıxış edə bilər. Orqanizmdə yüksək səviyyədə dATP toksikdir, çünki o, ribonukleotid reduktaza fermenti üçün rəqabət qabiliyyəti olmayan inhibitor kimi çıxış edə bilər. İmmunitet funksiyasının pozulmasına səbəb ola bilər.
ddATP nədir?
Dideoksiadenozin trifoafat və ya ddATP, Sanger sıralama metodunda istifadə edilən dörd növ nukleotiddən biridir. Struktur olaraq, ddATP də dATP-yə bənzər üç komponentə malikdir. Bunlar adenin bazası, deoksiriboza şəkəri və üç fosfatdır.
Şəkil 02: ddATP
dATP-dən fərqli olaraq, ddATP-də bitişik nukleotidlə fosfodiester bağı yaratmaq və zəncirin uzanmasını davam etdirmək üçün pentoza şəkərinin 3ʹ mövqeyində OH qrupu yoxdur. Onun 3′ mövqeyində H atomu var. Buna görə də, ddATP daxil olduqdan sonra DNT sintezi sona çatır. Bu, Sanger ardıcıllığının əsas prinsipidir. Buna görə də, ddATP Sanger ardıcıllığında zəncirvari uzanma inhibitoru kimi işləyir. Sanger sıralamasında dörd boru istifadə olunur və bir boruya ddATP əlavə olunur.
dATP və ddATP arasında hansı oxşarlıqlar var?
- dATP və ddATP nukleotidlərdir.
- Hər ikisi adenin, dezoksiriboza və üç fosfatdan ibarətdir.
- Onlar üzvi birləşmələrdir.
- Həm dATP, həm də ddATP Sanger ardıcıllığında borulara əlavə edilir.
dATP və ddATP arasındakı fərq nədir?
dATP pentoza şəkərinin 3′ mövqeyində OH qrupu, ddATP isə pentoza şəkərinin 3′ mövqeyində OH qrupu yoxdur. Bundan əlavə, dATP DNT sintezində istifadə olunan bir monomerdir, ddATP isə Sanger ardıcıllığı zamanı zəncirin uzanmasını dayandırmaq üçün istifadə olunur. Beləliklə, bu dATP və ddATP arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, dATP fosfodiester bağları yarada bilər, ddATP isə fosfodiester bağları yarada bilməz.
Aşağıdakı infoqrafika yan-yana müqayisə üçün dATP və ddATP arasında daha çox fərqi cədvəl şəklində göstərir.
Xülasə – dATP vs ddATP
Qısaca desək, dATP DNT sintezinin xəbərçisidir, ddATP isə Sanger ardıcıllığında DNT sintezini dayandırmaq üçün istifadə edilən nukleotiddir. Üstəlik, dATP pentoza şəkərinin 3 mövqesində bir OH qrupuna malikdir və növbəti nukleotidlə fosfodiester bağının yaranmasına imkan verir. Eyni zamanda, ddATP-də 3' mövqedə OH qrupu yoxdur; deməli, növbəti nukleotidlə fosfodiester bağı yarada bilmir. Nəticədə, DNT ardıcıllığı uzanmasını dayandırır. Beləliklə, bu, dATP və ddATP arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
