Praymer və promotor arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, primer, hədəf DNT ardıcıllığının gücləndirilməsi üçün PCR-də istifadə olunan kommersiya baxımından sintez edilmiş qısa DNT ardıcıllığıdır, promotor isə RNT üçün təhlükəsiz ilkin bağlanma yerini təmin edən xüsusi DNT ardıcıllığıdır. transkripsiyaya başlamaq üçün polimeraza və transkripsiya faktorları.
Primer və promotor iki növ DNT ardıcıllığıdır. Primer polimeraza zəncirvari reaksiya (PZR) üçün lazım olan kiçik DNT parçasıdır. DNT zəncirinin yan ucunu tamamlayan qısa nukleotid ardıcıllığına malikdir. İki növ primer var və onlar yeni DNT zəncirlərinin sintezi üçün başlanğıc nöqtəsi kimi işləyirlər. Bunun əksinə olaraq, bir promotor genin transkripsiya başlanğıc sahəsinin yuxarı hissəsində yerləşən xüsusi bir DNT ardıcıllığıdır. DNT transkripsiyasına nəzarət etmək üçün RNT polimeraza və transkripsiya faktorları kimi transkripsiya mexanizmi komponentləri ilə birbaşa qarşılıqlı əlaqədə olur. Buna görə də, RNT polimeraza və digər transkripsiya faktorları promotor ardıcıllığına bağlanır və transkripsiyaya başlayır.
Astar nədir?
Primerlər hədəf DNT ardıcıllığının gücləndirilməsi üçün nəzərdə tutulmuş qısa DNT ardıcıllıqlarıdır. Struktur olaraq, onlar DNT cüt zəncirlərinin yan uclarını tamamlayan qısa nukleotid ardıcıllığına malikdirlər. Onlar adətən təxminən 20 nukleotid uzunluğunda olurlar. PCR zamanı Taq polimeraza nukleotidlərin əvvəlcədən mövcud olan nukleotid ardıcıllığına əlavə edilməsini katalizləşdirir. Beləliklə, primerlər yeni tellərin sintezi üçün başlanğıc nöqtələri kimi xidmət edir. Taq polimeraza yalnız 5'-3' istiqamətdə işləyir. Beləliklə, DNT sintezi də eyni 5'-dən 3' istiqamətində baş verir. DNT iki zəncirli olduğundan, PCR-də iki növ primer lazımdır. Onlar DNT sintezi zamanı primerin uzanma istiqamətinə əsaslanaraq irəli primer və tərs primer kimi tanınır.
Şəkil 01: Astarlar
İrəli primer antisens DNT zəncirlə bağlanır və genin + zəncirinin 5'-dən 3' istiqamətinə sintezinə başlayır. Antisens zəncirinin 3' yan ucunu tamamlayan qısa bir nukleotid ardıcıllığına malikdir. Ters primer sensual zəncirlə bağlanır və kodlaşdırma zəncirinin tamamlayıcı zəncirinin sintezinə başlayır, bu da genin 5'-dən 3' istiqamətinə bir zəncirdir. Beləliklə, tərs astar kodlaşdırma telinin 3' ucuna əlavə olaraq hazırlanmışdır. Həm tərs, həm də irəli primerlər hədəflənmiş və ya maraqlanan DNT-nin müəyyən bölgələrinin milyonlarla milyardlarla nüsxələrinin istehsalı üçün vacibdir.
Promouter nədir?
Promotor, genin transkripsiya başlama yerinin yuxarı hissəsində və ya 5′ sonunda yerləşən DNT ardıcıllığıdır. O, genin transkripsiyasını başlatmaq üçün RNT polimeraza və müəyyən tənzimləyici elementlər üçün bağlanma yeri təmin edir. Bu, geni işə salmaq və ya söndürmək üçün lazım olan tənzimləyici ardıcıllıqdır. Promotorda xüsusi bir nukleotid ardıcıllığı var. 100-1000 baza cütü ola bilər. Promoter transkripsiyanın istiqamətini göstərir. Üstəlik, transkripsiya edilməli olan hiss telini göstərir.
Şəkil 02: Genin Promotoru
Əsas promotor, proksimal promotor və distal promotor kimi üç növ promotor elementi var. Əsas promotor transkripsiyaya başlamaq üçün lazım olan promotorun minimal hissəsidir. O, başlanğıc kodonun ən proksimalında yerləşir. TATA qutusu, bir çox eukaryotik nüvə promouterində olan qorunan bölgədir. Transkripsiya başlanğıc yerindən 25-dən 35-ə qədər baza cütü tapılır. Proksimal promotor əsas promotordan daha yuxarıda tapılır. Ümumiyyətlə, o, başlanğıc kodonundan 250 əsas cüt yuxarıda yerləşir və əsas tənzimləyici elementləri ehtiva edir. Distal promotor proksimal promotorun yuxarı hissəsində yerləşir və o, əlavə tənzimləyici elementləri ehtiva edir. Bakterial promotorların promotorlarında iki qısa ardıcıllıq elementi var. TATAAT bakterial promotorun -10-da yerləşən konsensus ardıcıllığıdır, TTGACA isə -35-də konsensus ardıcıllığıdır. Onlar -10 element və -35 element kimi tanınır.
Primer və Promoter Arasındakı oxşarlıqlar nələrdir?
- Primer və promotor iki növ DNT ardıcıllığıdır.
- Onlar nukleotid ardıcıllığından ibarətdir.
- Həm primer, həm də promotor gen ifadəsi üçün vacibdir.
Praymer və Promoter Arasındakı Fərq Nədir?
Primer hədəf DNT-nin gücləndirilməsi üçün nəzərdə tutulmuş qısa nukleotid ardıcıllığıdır. Bunun əksinə olaraq, promotor, genin transkripsiya başlanğıc sahəsinin yuxarı hissəsində tapılan xüsusi tənzimləyici DNT ardıcıllığıdır. Beləliklə, bu, primer və promouter arasındakı əsas fərqdir. Primerlərin uzunluğu təxminən 20 əsas cütdür, promotorun isə 100-1000 baza cütü ola bilər. Funksional olaraq, primerlər yeni zəncir sintezi üçün başlanğıc ardıcıllıq kimi xidmət edir, promotorlar isə RNT polimeraza və digər transkripsiya faktorları üçün bağlama yerləri təmin etməklə gen transkripsiyasına nəzarət edirlər.
Bundan başqa, promotor transkripsiyanın istiqaməti kimi müəyyən edilir və genin hiss zəncirini göstərir. Struktur olaraq, primer qısa, tək zəncirli DNT ardıcıllığı, promotor isə uzun cüt zəncirli DNT ardıcıllığıdır.
Aşağıdakı info-qrafikdə primer və promouter arasındakı fərqlə bağlı daha çox müqayisələr var.
Xülasə – Primer və Promoter
Primerlər hədəf DNT cüt zəncirinin yan uclarını tamamlayan qısa nukleotid ardıcıllıqlarıdır. PCR-də iki növ primer istifadə olunur. Onlar yeni tellərin sintezi üçün başlanğıc ardıcıllıq kimi xidmət edir. Astarlar kommersiya məqsədi ilə hazırlanmışdır və onlar temperaturda sabit ardıcıllıqlardır. Digər tərəfdən, promotor, transkripsiyanın başlanğıc sahəsinin yuxarı hissəsində yerləşən genin tənzimləyici ardıcıllığıdır. Promotorlar genlərin transkripsiyasına nəzarət edirlər. Onlar transkripsiyaya başlamaq üçün RNT polimeraza və transkripsiya faktorları üçün bağlama yerləri təmin edirlər. Beləliklə, bu, primer və promouter arasındakı fərqin xülasəsidir.
