CRISPR və CRISPR Cas9 arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, CRISPR (müntəzəm aralıqlı qısa palindromik təkrarlama) təbii olaraq yaranan prokaryotik immun müdafiə mexanizmidir, CRISPR cas9 isə CRISPR adaptivinin bir hissəsi olan RNT ilə idarə olunan Cas9 nüvəsidir. immun sistemi.
CRISPR bakteriya və arxeyalarda olan antiviral müdafiə immun sistemidir. Bakterial genomda tapılan DNT ardıcıllığı ailəsidir. Bu, əvvəllər onlara yoluxmuş bakteriofaqların DNT fraqmentlərindən əldə edilən spacer ardıcıllıqlarından ibarətdir. Sonrakı viral infeksiyalarda bakteriyalar viral DNT-ni məhv etmək üçün bu ardıcıllıqlardan istifadə edirlər. CRISPR ardıcıllığı qısa palindromik təkrarlara və boşluq ardıcıllığına malikdir. Üstəlik, CRISPR təkrar spacer ardıcıllığı tez-tez Cas zülallarını kodlayan əlaqəli genlərə malikdir. Cas9, RNT ilə idarə olunan endonükleazdır. CRISPR ardıcıllığı ilə birlikdə Cas9 zülalı bakteriyalarda bakteriofaqlara qarşı adaptiv immun sistemi kimi çıxış edir.
CRISPR nədir?
CRISPR Clustered Regularly Interspaced Qısa Palindromik Təkrarlar deməkdir. Bu, bakteriya genomunda olan DNT ardıcıllığının çoxluğudur. Bakteriyalarda təbii müdafiə mexanizmi kimi işləyir və ilk dəfə E. coli-də müəyyən edilmişdir. Bakteriyalarda, xüsusən də bakteriofaqlara qarşı adaptiv immun müdafiə rolunu oynayır. Buna görə də, o, ardıcıllıqla xüsusi mexanizmdir.
Şəkil 01: CRISPR
CRISPR sistemi bir neçə qısa seqmentli DNT təkrar ardıcıllığını ehtiva edir. Bu təkrarlar palindromikdir, 5'-dən 3'-ə qədər oxuyarkən eyni əsas ardıcıllığa malikdir, digəri isə 3'-dən 5'-ə qədər oxuyarkən eyni ardıcıllığı verir. Üstəlik, təkrarlar eynidir. Onlar eyni olmayan qısa "aralıq" DNT ardıcıllıqları arasında yerləşirlər. Lakin bu boşluq DNT ardıcıllığı yad bakteriofaq DNT ilə oxşar və ya uyğun gəlir. CRISPR ilə əlaqəli genlər CRISPR ilə əlaqəli genlər və ya Cas genləri kimi tanınır. Cas genləri helikazlar və ya nukleazlar olan Cas zülallarını kodlayır. Helikazlar DNT-ni açır, nukleazlar isə DNT-ni kəsir. Ümumilikdə, CRISPR nəzərə alındıqda, o, bakteriofaqlara (virusları yoluxduran bakteriyalar) qarşı işləyən bakteriyaların immun sistemidir.
CRISPR Cas9 nədir?
Cas9 və ya CRISPR ilə əlaqəli zülal 9 bakterial RNT ilə idarə olunan endonükleazdır. Buna görə də o, istiqamətləndirici RNT-ni tamamlayan hədəf DNT-ni (xüsusilə bakteriofaq DNT) tanıyan və kəsən bir fermentdir. O, spesifik iplik parçalanmasını həyata keçirir. Cas9 proteini CRISPR ilə əlaqəli gen tərəfindən kodlanır. CRISPR cas9, genomun redaktəsi, transkripsiya pozğunluğu, epigenetik modulyasiya və genom təsviri üçün RNT-proqramlaşdırıla bilən DNT hədəfləmə və redaktə platforması kimi istifadə edilə bilən RNT ilə idarə olunan CRISPR-Cas9 nukleaz sistemidir. Bu CRISPR cas9 sistemi mövcud genom redaktə sistemlərində çox populyardır.
Şəkil 02: CRISPR Cas9
Hazırda CRISPR/Cas9 sistemi transkripsiya repressiyası və ya aktivləşdirmə yolu ilə məməlilərin genomunu dəyişdirmək və ya modifikasiya etmək üçün istifadə olunur. Məməli hüceyrələri təmir mexanizmini qəbul edərək CRISPR/Cas9 vasitəçiliyi ilə DNT qırılmalarına cavab verə bilər. Bu, ya homoloji olmayan son birləşmə metodu (NHEJ) və ya homoloji yönümlü təmir (HDR) istifadə etməklə edilə bilər. Bu təmir mexanizminin hər ikisi cüt telli fasilələr tətbiq etməklə baş verir. Bu, məməlilərin geninin redaktəsi ilə nəticələnir. NHEJ gen mutasiyalarının ablasiyasına səbəb ola bilər və funksiya effektlərinin itkisi yaratmaq üçün istifadə edilə bilər. HDR xüsusi nöqtə mutasiyalarını təqdim etmək və ya müxtəlif uzunluqlu DNT seqmentlərini təqdim etmək üçün istifadə edilə bilər. Hazırda CRISPR/ Cas sistemi terapevtik, biotibbi, kənd təsərrüfatı və tədqiqat tətbiqləri sahələrində istifadə olunur.
CRISPR və CRISPR Cas9 arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Cas9 CRISPR Cas sisteminin bir hissəsidir.
- Crisper ca9 sistemi təbii olaraq bakteriyalarda olan immun sistemidir.
CRISPR və CRISPR Cas9 arasındakı fərq nədir?
CRISPR bakteriofaqlara qarşı təbii müdafiə sistemi kimi işləyən bakterial genomda tapılan DNT ardıcıllıqları toplusudur. O, müntəzəm olaraq interspaceed qısa palindromik təkrarlar, spacers və əlaqəli genlərdən ibarətdir. Bunun əksinə olaraq, cas9, RNT ilə idarə olunan endonükleaza fermenti olan CRISPR ilə əlaqəli protein 9-dur. Virusların DNT cüt zəncirlərini tanıyır və parçalayır. Əslində, o, CRISPR müdafiə sisteminin bir hissəsidir. Beləliklə, CRISPR və CRISPR cas9 arasındakı əsas fərq budur.
Xülasə – CRISPR vs CRISPR Cas9
CRISPR Cas sistemi mikroblara qarşı müdafiə sistemidir. CRISPR palindromik qısa təkrarlardan, spacer ardıcıllıqlardan və əlaqəli genlərdən ibarət DNT ardıcıllığının çoxluğudur. Cas9, RNT ilə idarə olunan endonükleaz olan bir Cas proteinidir. CRISPR və Cas9 zülalı bakteriyalarda bakteriofaq infeksiyalarına qarşı işləyən immun sistemi yaradır. Cas9 zülalı yad viral DNT-ni parçalamağa və onları pozmağa qadirdir. CrRNA viral DNT-ni tanımaq üçün ca9-a rəhbərlik edir. Buna görə də CRISPR cas9 sistemi viruslara qarşı bakteriyalarda olan təbii immun sistemidir. Beləliklə, bu, CRISPR və CRISPR cas9 arasındakı fərqin xülasəsidir.
