Əsas Fərq – CRISPR vs RNAi
Genomun redaktəsi və gen modifikasiyası genetika və molekulyar biologiyada qarşıdan gələn maraq sahələridir. Gen modifikasiyası gen terapiyası tədqiqatları üçün geniş tətbiq edilir və həmçinin genin xüsusiyyətlərini, genin funksionallığını və gendəki mutasiyaların onun funksiyasına necə təsir göstərə biləcəyini müəyyən etmək üçün istifadə olunur. Canlı hüceyrələrin genomunda dəqiq, məqsədyönlü dəyişikliklər etmək üçün səmərəli və etibarlı üsulların işlənib hazırlanması vacibdir. Genləri yüksək dəqiqliklə dəyişdirmək üçün CRISPR və RNAi kimi texnikalardan istifadə edilir. CRISPR və ya Clustered Regularly Interspaced Qısa Palindromik Təkrarlar eukaryotik genlərin redaktəsi və modifikasiyası üçün son vaxtlar istifadə edilən təbii olaraq yaranan prokaryotik immun müdafiə mexanizmidir. RNAi və ya RNT müdaxiləsi, nuklein turşuları ilə vasitəçilik edən və gen ifadəsini tənzimləyən kiçik ikiqat zəncirli RNT təqdim edərək genləri susdurmaq üçün ardıcıllığa xüsusi bir üsuldur. Bu, CRISPR və RNAi arasındakı əsas fərqdir.
CRISPR nədir?
CRISPR sistemi E. coli və archea daxil olmaqla bəzi bakteriyalarda mövcud olan təbii mexanizmdir. Xarici DNT əsaslı işğallara qarşı adaptiv immun müdafiədir. Bu, ardıcıllığa xas mexanizmdir. CRISPR sistemi bir neçə DNT təkrar elementini ehtiva edir. Bu elementlər yad DNT və çoxsaylı Cas genlərindən əldə edilən qısa “aralıq” ardıcıllıqla kəsişib. Cas genlərinin bəziləri nükleazlardır. Beləliklə, tam immun sistemi CRISPR/Cas sistemi adlanır.
Şəkil 01: CRISPR/ Cas sistemi
CRISPR/Cas sistemi dörd addımda işləyir.
- Sistem genetik olaraq istila edən faj və plazmid DNT seqmentlərini (araçıları) CRISPR lokuslarına bağlayır (spacer əldə etmə addımı adlanır).
- crRNA yetişmə mərhələsi – Ev sahibi həm CRISPR təkrar elementlərini, həm də inteqrasiya olunmuş boşluq elementlərini ehtiva edən yetkin CRISPR RNT (crRNA) yaratmaq üçün CRISPR lokuslarını transkripsiya edir və emal edir.
- CrRNA-nın aşkarlanması – Bu, tamamlayıcı baza cütləşməsi ilə asanlaşdırılır. Bu, infeksiya və yoluxucu agent mövcud olduqda vacibdir.
- Hədəf müdaxilə addımı – crRNA yad DNT-ni aşkarlayır, xarici DNT ilə kompleks əmələ gətirir və ev sahibini yad DNT-dən qoruyur.
Hazırda CRISPR/Cas sistemi transkripsiya repressiyası və ya aktivasiya yolu ilə məməlilərin genomunu dəyişdirmək və ya modifikasiya etmək üçün istifadə olunur. Məməli hüceyrələri təmir mexanizmini qəbul edərək CRISPR/Cas9 vasitəçiliyi ilə DNT qırılmalarına cavab verə bilər. Bu, ya qeyri-homoloji son birləşmə metodu (NHEJ) və ya homoloji yönümlü təmir (HDR) istifadə etməklə edilə bilər. Bu təmir mexanizminin hər ikisi cüt telli fasilələr tətbiq etməklə baş verir. Bu, məməli geninin redaktəsi ilə nəticələnir. Beləliklə, hazırda CRISPR/ Cas sistemi terapevtik, biotibbi, kənd təsərrüfatı və tədqiqat tətbiqləri sahələrində istifadə olunur.
RNAi nədir?
RNT müdaxiləsi gen ifadəsini tənzimləmək üçün istifadə edilən ikiqat zəncirli RNT vasitəçiliyi üsuludur. İştirak edən əsas birləşmə kiçik müdaxilə edən RNT-lərdir (siRNA). siRNA-lar iki nükleotidin 3' çıxıntısı və 5' fosfat qrupu olan ikiqat zəncirli RNT-lərin xüsusi növüdür. RNT ilə bağlı susdurucu kompleks (RISC) RNT müdaxiləsi zamanı əmələ gəlir ki, bu da siRNA ilə əlaqəli genin deqradasiyası ilə nəticələnir.
Şəkil 02: RNAi
RNAi-nin proseduru aşağıdakı kimidir.
- İkiqat zəncirli RNT ~21 nukleotid uzunluğunda siRNA yaratmaq üçün Dicer adlı RNase III tipli endoribonükleaza tərəfindən sitoplazmada emal ediləcək
- İkiqat zəncirli RNT bağlayan zülalların (dsRNABP) köməyi ilə siRNA ilə bağlı Dicerin Argonaute-ə köçürülməsi.
- Argonaute-nin dupleksin bir zolağına bağlanması (bələdçi ip). Bu, digər ipi sıxışdıracaq. Bu, RISC adlanan bütöv bir protein – RNT kompleksi ilə nəticələnir.
- RISC kompleksinin Arqonaute ilə əlaqəli təkzəncirli bələdçi RNT ilə cütləşməsi.
- Homolog RNT hədəfinin bələdçi RNT ilə qoşalaşması.
- Hədəf RNT-nin deqradasiyası ilə nəticələnən Arqonavtun aktivləşməsi
CRISPR və RNAi arasındakı oxşarlıq nədir?
Hər ikisi gen ifadəsini dəyişdirən tədqiqat alətləri kimi istifadə olunur
CRISPR və RNAi arasındakı fərq nədir?
CRISPR vs RNAi |
|
| CRISPR bu yaxınlarda eukaryotik genlərin redaktəsi və modifikasiyası üçün istifadə edilən immun müdafiə mexanizmidir. | RNAi kiçik cüt zəncirli daxil etməklə genləri susdurmaq üçün ardıcıllığa xas üsuldur |
| Hədəf Ardıcıllığı | |
| Sintetik RNT (bələdçi RNT) CRISPR-nin hədəfləmə ardıcıllığıdır. | siRNA RNTi-nin hədəfləmə ardıcıllığıdır. |
| Gen Bastırmada Effektivlik | |
| CRISPR-də aşağı | RNAi-də yüksək |
| Effektlər | |
| CRISPR-də genlərin yıxılması baş verir. | Nokaut / susdurma RNAi-də baş verir. |
Xülasə – CRISPR vs RNAi
CRISPR və ya Clustered Regularly Interspaced Qısa Palindromik Təkrarlar eukaryotik genlərin redaktəsi və modifikasiyası üçün bu yaxınlarda istifadə edilən təbii prokaryotik immun müdafiə mexanizmidir. RNAi və ya RNT müdaxiləsi, nuklein turşuları ilə vasitəçilik edən və gen ifadəsini tənzimləyən kiçik cüt zəncirli RNT təqdim edərək genləri susdurmaq üçün ardıcıllığa xüsusi bir üsuldur. Bu, CRISPR və RNAi arasındakı əsas fərq kimi qəbul edilə bilər. Hər iki üsul, CRISPR/Cas və RNAi, gen manipulyasiyaları üçün güclü alətlərdir, baxmayaraq ki, CRISPR/Cas, şübhəsiz ki, RNAi-dən daha üstündür, çünki o, həm əlavələr, həm də silinmələr üçün istifadə edilə bilər. Spesifiklik CRISPR/ Cas sistemində də yüksəkdir.
CRISPR vs RNAi-nin PDF Versiyasını endirin
Bu məqalənin PDF versiyasını yükləyə və sitat qeydinə əsasən onu oflayn məqsədlər üçün istifadə edə bilərsiniz. Zəhmət olmasa PDF versiyasını buradan endirin CRISPR və RNAi arasındakı fərq
