Namizəd gen ilə GWAS arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, namizəd gen yanaşması az sayda əvvəlcədən müəyyən edilmiş maraq doğuran genlər daxilində genetik variasiyanı araşdırır, GWAS isə müəyyən bir xəstəlik vəziyyətinin arxasında ümumi genetik variasiya üçün bütün genomu araşdırır.
Namizəd gen yanaşması və genom boyu assosiasiya tədqiqatları (GWAS) xəstəliklərə genetik həssaslığı aşkar etmək üçün vacib olan iki üsuldur. Namizəd gen yanaşması əvvəlcədən müəyyən edilmiş az sayda genlərə əsaslanır, GWAS isə bütün genomun sınaqdan keçirilməsinə əsaslanır. Beləliklə, namizəd gen yanaşması, GWAS-dan fərqli olaraq, xəstəliyə aid olan genlər haqqında əvvəlcədən məlumat tələb edir.
Namizəd Gen nədir?
Namizəd gen yanaşması əvvəlcədən müəyyən edilmiş maraq doğuran genlər daxilində genetik variasiya ilə fenotiplər və ya xəstəlik halları arasındakı əlaqəni araşdıran üsullardan biridir. Bu yanaşmada, genin sözügedən əlamət və ya xəstəliyə bioloji funksional təsiri haqqında əvvəlcədən biliyə sahib olmaq lazımdır. Bu biliyə əsaslanaraq, az sayda gen seçilir və genetik variasiya üçün təhlil edilir.
Şəkil 01: Namizəd Gen Yanaşı
Genlərin seçimi bu yanaşmada sözügedən xəstəliyə bioloji, fizioloji və funksional uyğunluq əsasında aparılır. Bu yanaşma tez-tez hal-nəzarət tədqiqatı kimi tərtib edilir.
GWAS nədir?
GWAS Genom-Wide Association Study deməkdir. Bu, həmçinin bütün genom assosiasiya tədqiqatlarına aiddir. Bu tədqiqatlar əsasən müşahidə tədqiqatlarına diqqət yetirir. Onlar adətən müəyyən bir əlamətlə əlaqəli müxtəlif şəxslərin genetik variantlarını təhlil edirlər. Bütün genom GWAS analizi üçün vacibdir.
GWAS müxtəlif xəstəlik şərtləri ilə əlaqəli tək nukleotid polimorfizmlərinin təhlilində mühüm vasitədir. Geniş populyasiyada fərqli tək nukleotid polimorfizmlərinin müqayisəli tədqiqidir. GWAS-ın tədqiqat nümunəsi çox yüksəkdir; deməli, o, həm də kəsişən kohort tədqiqatının formatını alır.
Şəkil 02: GWAS
İlk GWAS tədqiqatı miokard infarktı ilə bağlı və miokard infarktı ilə əlaqəli genlərin təhlili ilə bağlı aparılıb. Hazırda GWAS etiologiyası naməlum olan mürəkkəb xəstəliklərin genetik fonunun müəyyən edilməsində mühüm rol oynayır.
Namizəd Gen və GWAS arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Həm namizəd gen yanaşması, həm də GWAS xəstəliyin genotipi və fenotipi arasındakı genetik əlaqəni təhlil edən üsullardır.
- Hər iki yanaşma xəstəliyə həssaslığın genetik əsasını anlamağa kömək edir.
Namizəd Gen və GWAS arasındakı fərq nədir?
Namizəd gen yanaşması namizəd genlərə və ya əvvəlcədən təyin edilmiş genlərə, GWAS isə bütün genomlara əsaslanır. Beləliklə, bu, namizəd geni ilə GWAS arasındakı əsas fərqdir. Həmçinin, namizəd gen yanaşmasında genlərin seçimi GWAS-da lazım olmadığı halda zəruridir.
Bundan başqa, namizəd gen yanaşması xəstəliyə aid genlər haqqında qabaqcadan bilik tələb edir, halbuki GWAS üçün bu lazım deyil.
Aşağıdakı infoqrafika namizəd gen və GWAS arasındakı fərqlə bağlı daha ətraflı müqayisə təqdim edir.
Xülasə – Namizəd Gen və GWAS
Namizəd geni və GWAS iki gen assosiasiyası tədqiqatıdır. Namizəd gen yanaşması əvvəlcədən müəyyən edilmiş az sayda gen daxilində xəstəliklə əlaqəli genetik variasiyaya diqqət yetirir. Bunun əksinə olaraq, GWAS bütün genom daxilində xəstəliklə əlaqəli genetik dəyişkənliyi araşdırır. Beləliklə, bu, namizəd geni ilə GWAS arasındakı əsas fərqdir. Hər iki üsul xəstəliyə həssaslığın genetik əsasını anlamaqda vacibdir.
