Əsas Fərq – RNASE A vs RNASE H
Ribonukleazlar xüsusi olaraq RNT-ni daha kiçik vahidlərə parçalayan nükleazlardır. Onları iki kateqoriyaya bölmək olar; endoribonukleazlar və ekzoribonukleazlar. Endoribonukleaza tək və ya iki zəncirli RNT-ni parçalaya bilən endonükleazdır. Bir RNT polinükleotid zəncirindəki fosfodiester bağlarını parçalayır. Nümunələr RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P və RNase H. Ekzoribonukleaza RNT molekulunun 5' və ya 3' ucundan terminal nukleotidləri çıxararaq RNT-ni deqradasiya edən ekzonükleazadır. Nümunələr RNase R, RNase II, RNase D və RNase PH-dir. RNASE A və RNASE H arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, RNase A, tək zəncirli RNT-ni daha kiçik komponentlərə parçalayan pankreas ribonukleazdır, RNase H isə RNT-DNT hibridindəki RNT-ni daha kiçik hissələrə parçalayan qeyri-spesifik fermentdir. hidrolitik mexanizm.
RNASE A nədir?
RNaz A mədə altı vəzinin ribonukleazıdır ki, o, tək zəncirli RNT-nin 3' ucunda qoşalaşmamış sitozin və urasil qalıqlarını xüsusi olaraq parçalayır. RNase H daha yüksək duz konsentrasiyasında işləyir (0,3M və ya daha yüksək NaCl konsentrasiyası). Hidrolitik reaksiya iki mərhələdən ibarətdir. 2', 3' siklik monofosfat aralıq vasitəsi ilə 3' fosforlanmış məhsul əmələ gətirir. Daha yüksək duz konsentrasiyasında tək zəncirli RNT-yə xas olsa da, o, həmçinin aşağı NaCl konsentrasiyasında (0,3M NaCl-dən aşağı) RNT-DNT hibridində ikiqat zəncirli RNT və RNT-ni deqradasiya edə bilər.
Bruce Merrifield ilk dəfə bu fermenti sintez etdi. RNase A molekulyar tədqiqatlarda çox məşhur bir fermentdir. Mal-qara mədə altı vəzi RNase A RNase A nümunəsidir. Və o, laboratoriyada istifadə edilən ən sərt fermentlərdən biridir. Bu fermentin fəaliyyəti üçün kofaktora ehtiyac yoxdur. Bu, yüksək termostabil fermentdir. RNase A düzgün amin turşusu ardıcıllığının aşkar edildiyi ilk ferment və üçüncü zülaldır. Bu ferment 124 amin turşusu və 12600da molekulyar kütləsi ilə çox kiçikdir. Və onun dörd Histidin qalığı var (Onun 12 və Onun 119 katalitik reaksiyada iştirak edir).
Şəkil 01: RNaz A
RNase A xam nümunəni qaynatmaqla təcrid oluna bilər. Qaynadıqda, bütün digər fermentlər qalan RNase A parçalayır. RNase A heyrətamiz dərəcədə sabit bir fermentdir. Bu ferment ribonukleaz inhibitor protein, ağır metal və uridin vanadat kompleksləri ilə inhibə edir.
RNase H nədir?
RNaz H, hidrolitik reaksiya vasitəsilə RNT-DNT hibridində RNT-ni parçalaya bilən qeyri-spesifik ribonukleaza fermentidir. RNaz H bir RNT-DNT hibridində RNT-nin 3'- O-P bağını parçalayır. Nəhayət, 3'OH və 5' fosfatla sonlandırılmış məhsullar istehsal edir. DNT replikasiyasında yeni DNT zəncirləri əmələ gəldikdən sonra RNT primerini çıxararaq əsas rol oynayır. Laboratoriya şəraitində o, xüsusi olaraq RNT-DNT hibridində RNT-ni parçalayır, lakin DNT və hibridləşməmiş RNT-ni deyil. Və bu ferment adətən cDNA sintezi zamanı ilk tamamlayıcı DNT zəncirinin əmələ gəlməsindən sonra RNT şablonunu məhv etmək üçün istifadə olunur.
Şəkil 02: RNaz H
RNase H, həmçinin nükleaz müdafiə analizlərində istifadə edir. O, həmçinin mRNT-dən poli A quyruğunun çıxarılmasına daxil edilə bilər. RNase H hüceyrənin daxilində və xaricində kodlaşdırılmayan RNT-ni məhv etmək qabiliyyətinə malikdir. Bu protein fəaliyyəti üçün kofaktorlar kimi metal ionları tələb olunur. Xelator (EDTA) RNase H fermentini inhibə etmək üçün istifadə edilə bilər.
RNASE A və RNASE H arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Hər ikisi təbiətdə zülaldır.
- Hər ikisi endoribonükleazdır
- Hər ikisi RNT-ni parçalaya bilər.
- Hər ikisi hidrolitik reaksiyalar həyata keçirir.
- Molekulyar laboratoriyalar bunların hər ikisindən istifadə edir.
RNASE A və RNASE H arasındakı fərq nədir?
RNASE A vs RNASE H |
|
| RNase A daha yüksək duz konsentrasiyasında tək zəncirli RNT-nin qoşalaşmamış sitozin və urasil qalıqlarının 3' ucunu xüsusi olaraq parçalayan pankreas ribonukleazdır. | RNase H hidrolitik reaksiya vasitəsilə RNT-DNT hibridində RNT-ni parçalaya bilən qeyri-spesifik ribonukleaza fermentidir. |
| RNT Parçalanmasının Təbiəti | |
| RNase A yüksək duz konsentrasiyasında xüsusi olaraq tək zəncirli RNT-ni parçalayır. | RNase H RNT-DNT hibridində RNT-ni parçalayır. |
| Fəaliyyət üçün ko-faktorlara ehtiyac | |
| RNase A-nın fəaliyyəti üçün kofaktorlara ehtiyac yoxdur. | RNase H aktivliyi üçün kofaktor kimi metal ionlarına ehtiyac duyur. |
| Protein Fəaliyyətinin İnhibitorları | |
| Ribonukleaza inhibitor zülalı, ağır metal və uridin vanadat kompleksləri RNTaz A fəaliyyətini maneə törədir. | Şelator (EDTA) RNase H fəaliyyətini maneə törədir. |
| DNT Replikasiyasında RNT Primer Silinməsi | |
| RNaz A DNT replikasiyasında RNT primerinin çıxarılması üçün istifadə edilmir. | RNase H DNT replikasiyasında RNT primerinin çıxarılması üçün istifadə olunur |
| Tamamlayıcı DNT (C-DNT) Sintezində DNT Şablonunun Silinməsi | |
| RNase A tamamlayıcı DNT (C-DNT) sintezi zamanı RNT şablonunun çıxarılması üçün istifadə edilmir. | RNase H tamamlayıcı DNT (C-DNT) sintezi zamanı RNT şablonunun çıxarılması üçün istifadə olunur. |
| Oliqoya (dt) hibridləşdirilmiş mRNT-də Poli-A-quyruğun çıxarılması | |
| RNase A oliqoya (dt) hibridləşdirilmiş mRNT-də "poli-A quyruğu"nu çıxarmaq üçün istifadə edilmir. | RNase H oliqoya (dt) hibridləşdirilmiş mRNT-də "poli-A quyruğu"nu çıxarmaq üçün istifadə olunur |
Xülasə – RNASE A vs RNASE H
Ribonukleazlar RNT-ni daha kiçik hissələrə ayırmaq qabiliyyətinə malik olan nukleaza fermentləridir. Onlar iki növdür; endoribonukleazlar və ekzoribonukleazlar. Endoribonukleaza tək və ya iki zəncirli RNT-ni parçalamaq qabiliyyətinə malik olan endonükleazdır. Və bir RNT polinükleotid zəncirindəki fosfodiester bağını parçalayır. RNase A və RNase H iki endoribonukleazdır. RNase A daha yüksək duz konsentrasiyasında tək zəncirli RNT-nin 3' ucunda qoşalaşmamış sitozin və urasil qalıqlarını xüsusi olaraq parçalayan pankreas ribonukleazıdır. RNase H, hidrolitik reaksiya vasitəsilə RNT-DNT hibridində RNT-ni parçalaya bilən qeyri-spesifik ribonukleaza fermentidir. Bu RNase A və RNase H arasındakı fərqdir.
PDF-ni endirin RNASE A vs RNASE H
Bu məqalənin PDF versiyasını yükləyə və sitat qeydinə əsasən onu oflayn məqsədlər üçün istifadə edə bilərsiniz. Lütfən, PDF versiyasını buradan yükləyin RNASE A və RNASE H arasındakı fərq
