FISH və CGH arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, FISH flüoresan etiketli zondlardan istifadə edərək xromosomda spesifik DNT ardıcıllığını aşkar edən molekulyar texnikadır, CGH isə genomik DNT-də dəyişiklikləri aşkar edən başqa bir molekulyar sitogenetik texnikadır.
Sitogenetik analiz tibbdə anevloidlər, delesiyalar, dublikasiyalar və yenidən təşkillər kimi xromosom anomaliyalarının aşkar edilməsində mühüm rol oynayır. Xromosom anomaliyaları sonda xərçəng, sonsuzluq, Daun sindromu, Klaynfelter sindromu kimi genetik xəstəliklərə gətirib çıxarır. sindrom, leykoz və s. Yuxarıda qeyd olunan qüsur və xəstəlikləri aşkar etmək üçün müxtəlif molekulyar sitogenetik üsullar mövcuddur. Onların arasında FISH (flüoresan in situ hibridləşdirmə) və CGH (müqayisəli genomik hibridləşmə) iki güclü hibridləşdirmə üsuludur. Bununla belə, hər iki metodun müsbət və mənfi tərəfləri var.
BALIQ nədir?
FISH, toxumanın bir hissəsi və ya bölməsində, bütün toxuma və ya hüceyrələrdə həyata keçirilən nuklein turşusunun hibridləşdirilməsi üsuludur. Prob əsaslı bir üsuldur. Texnika Watson Crick-in tamamlayıcı baza cütləşməsi nəzəriyyəsindən asılıdır, nəticədə ya DNT – DNT hibridləri, ya da DNT – RNT hibridləri yaranır ki, bu da mutasiyaya uğramış genləri aşkar edə və ya maraq doğuran geni müəyyən edə bilər. Bundan əlavə, bu texnika maraq doğuran gen ardıcıllıqlarını tamamlayan zondlar kimi nick-translyasiyadan istifadə edilməklə hazırlanmış tək zəncirli DNT sekanslarından, ikiqat zəncirli DNT sekanslarından, tək zəncirli RNT ardıcıllıqlarından və ya sintetik oliqonukleotidlərdən istifadə edir. Bundan əlavə, bu texnikanın ən mühüm xüsusiyyəti zondların flüoresan boyalarla etiketlənməsidir. Beləliklə, zondlar xromosomun tamamlayıcı hissələri ilə birləşir və aşkarlanmasını asanlaşdırır.
Üstəlik, FISH çox həssas və spesifik üsuldur. Beləliklə, hematoloji bədxassəli şişlərin və bərk şişlərin həm tədqiqatında, həm də diaqnostikasında ümumi bir üsuldur. Lakin, FISH aşağı qətnamə göstərir. O, həmçinin zond ardıcıllığını tərtib etmək üçün hədəf anormallığı haqqında əvvəlcədən məlumat tələb edir.
Şəkil 01: BALIQ
BALIQ-ın bir çox tətbiqi var, əsasən yoluxucu xəstəliklərin molekulyar diaqnostikasında patogenlərin varlığını müəyyən etmək və patogeni molekulyar diaqnostika vasitəsilə təsdiqləmək üçün. Üstəlik, FISH inkişaf biologiyası, karyotipləşdirmə və filogenetik analiz və xromosomların fiziki xəritələşdirilməsi sahələrində çox istifadə edilən bir texnikadır.
CGH nədir?
Müqayisəli genomik hibridləşmə (CGH) genomik DNT ardıcıllığında dəyişiklikləri aşkar edə bilən başqa bir DNT əsaslı molekulyar sitogenetik texnikadır. Metod genomik DNT ardıcıllığında dəyişiklikləri və ya dəyişiklikləri aşkar etmək üçün xromosom və gen modifikasiyalarını təhlil edə bilən qabaqcıl üsuldur. Bundan əlavə, CGH eksperimental nümunədən və istinad nümunəsindən DNT-nin təcrid olunmasını və parçalanmasını tələb edir. Sonra nümunələr iki fərqli flüoresan boya (adətən qırmızı və yaşıl) istifadə edərək etiketlənməlidir. Daha sonra hər iki nümunə qarışdırılır və rəqabətli hibridləşdirməyə icazə verilir. Son addım nümunələrin DNT-də gen duplikasiyası, gen itkisi və s. kimi dəyişikliklərə görə təhlilidir. Xüsusilə, test nümunəsi ilə nəzarət nümunəsi arasında DNT surətinin sayı fərqlərini ölçür.
Şəkil 02: CGH
CGH-nin başqa bir versiyası artıq mövcuddur; normal CGH-dən daha inkişaf etmiş bir üsuldur. Bu massiv əsaslı CGH və ya aCGH adlanan bir texnikadır. aCGH bir eksperimentdə minlərlə ardıcıllıqda gen və ya ardıcıl silmələrin dəqiq müəyyən edilməsinə imkan verir.
FISH və CGH arasında hansı oxşarlıqlar var?
- FISH və CGH iki molekulyar texnikadır.
- Həm FISH, həm də CGH nuklein turşusunun hibridləşməsinə əsaslanır.
- Həmçinin, hər iki texnika xüsusi DNT hədəflərini aşkar etmək üçün nəzərdə tutulmuş zondlara ehtiyac duyur.
- Biz onları genetik xəstəliklərin pre-natal və post-natal diaqnostikasında istifadə edirik.
- Bundan başqa, həm FISH, həm də CGH genomik dəyişiklikləri öyrənmək üçün çox güclü vasitədir.
- Onlar zondları etiketləmək üçün flüoresan boyalardan istifadə edirlər.
FISH və CGH Arasındakı Fərq Nədir?
FISH spesifik DNT ardıcıllıqlarını aşkar etmək üçün flüoresan zondlardan istifadə edən in situ hibridləşdirmə prosedurudur, CGH isə genomik DNT ardıcıllığının dəyişmələrini aşkar edən molekulyar hibridləşdirmə üsuludur. Beləliklə, bu, FISH və CGH arasındakı əsas fərqdir.
Bundan başqa, FISH zond ardıcıllığını dizayn etmək üçün hədəf anormallığı haqqında əvvəlcədən məlumat tələb edir, CGH isə əvvəlcədən bilik tələb etmir. Həmçinin, FISH və CGH arasındakı digər fərq ondan ibarətdir ki, FISH məhdud, aCGH isə yüksək ayırdetmə qabiliyyəti göstərir.
Aşağıdakı infoqrafika FISH və CGH arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
Xülasə – FISH vs CGH
FISH və CGH maraq doğuran gen ardıcıllığının aşkarlanmasını asanlaşdıran iki molekulyar sitogenetik üsuldur. FISH flüoresan etiketli zondlardan istifadə edərək xromosomda xüsusi DNT ardıcıllığının aşkarlanmasını asanlaşdırır, CGH isə genomik DNT-də dəyişikliklərin aşkarlanmasını asanlaşdırır. Beləliklə, bu, FISH və CGH arasındakı əsas fərqdir.
