Əsas fərq – Yığma geli ilə Ayırıcı gel
Yığma geli və ayırıcı gel terminləri SDS-PAGE texnikasının izahında istifadə olunur. SDS-PAGE və ya natrium dodesil sulfat-poliakrilamid gel elektroforezi zülal molekullarını molekulyar çəkilərinə əsasən ayırmaq üçün istifadə edilən laboratoriya üsuludur. Texnikanın arxasında duran nəzəriyyə, fərqli molekulyar çəkilərə malik zülalların fərqli miqrasiya nisbətləri göstərməsidir; aşağı molekulyar ağırlıqlı molekullar daha sürətli, yüksək molekulyar ağırlıqlı molekullar isə yavaş miqrasiya edir. Miqrasiya üçün vasitə geldir. İstifləmə geli və ayırıcı gel adlanan iki növ gel var. Yığma geli ilə ayırıcı gel arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, yığma gelin pH 6,8, ayırıcı gelin pH isə 8,8-dir.
Yığma Gel nədir?
Yığınlayıcı gel SDS-PAGE texnikasında daha konsentratlaşdırılmış həlledici gelin (ayırıcı gel) üstünə yerləşdirilən aşağı konsentrasiyalı poliakrilamid geldir. Yığma geli elektroforezin həllini yaxşılaşdırmaq üçün istifadə olunur. Nümunədəki zülallara təsir edən yığma gel və həlledici gel konsentrasiyaları arasındakı fərq səbəbindən ayırdetmə artır. İstifləmə gelində poliakrilamidin konsentrasiyası aşağı olduğundan, məsamələrin ölçüsü daha yüksəkdir. Bu, həmçinin ayrılığın artmasına kömək edir.
İstifadə üçün gel təxminən 7% poliakrilamiddən ibarət böyük məsamələri olan boş poliakrilamid geldir. Bu məsamələr böyük protein molekulları üçün əhəmiyyətli bir maneə rolunu oynamır. Beləliklə, bu gel həmin zülalların hərəkətliliyinə bir qədər təsir edir. Bu, zülalları iki gel arasında cəmləyərək onların hərəkətliliyinə və ölçüsünə görə ayrılır.
Şəkil 01: SDS-PAGE Akrilamid Gel
Yığma gelinin pH-ı 6,8-dir. Onun pH 2 pH vahidi ilə həll olunan geldən daha turşudur. Bu pH daha aşağı ion gücü, buna görə də daha yüksək elektrik müqaviməti deməkdir. Bu, geldə mövcud olan digər yüklü hissəciklərə nisbətən zülalların hərəkətliliyinə səbəb olur.
Ayırıcı Gel nədir?
SDS-PAGEtechnique-nin ayırıcı gel və ya həlledici geli aşağı konsentrasiyalı yığma gelin üstünə yerləşdirilən yüksək konsentrasiyalı poliakrilamid geldir. Ayırıcı gel yüksək miqdarda poliakrilamid (10%) ehtiva edir. Bu gelin pH səviyyəsi pH=8.8 olaraq saxlanılır, bu, yığma geldən daha yüksək pH səviyyəsidir.
Şəkil 02: Gel Elektroforez Aparatı
Zülal molekulları ayırıcı gelə çatdıqda, bu molekulların miqrasiyası yavaşlayır, çünki ayırıcı gel zülal molekullarının hərəkəti üçün əhəmiyyətli maneə rolunu oynaya bilən kiçik məsamə ölçüsünə malik yüksək konsentrasiyalı geldir.. Bu yavaşlama digər zülalların yavaş-yavaş miqrasiya etməsinə imkan verir və nəticədə iki gel arasında dar, konsentrasiyalı zolaq yaranır.
Yığma geli ilə ayırıcı gel arasında nə əlaqə var?
Həm yığma geli, həm də ayırıcı gel eyni aparatda istifadə olunur
Yığma geli ilə ayırıcı gel arasındakı fərq nədir?
Yığıcı Gel vs Ayırıcı Gel |
|
| Yığınlayıcı gel SDS-PAGE texnikasında daha konsentratlaşdırılmış həlledici gelin (ayırıcı gel) üstünə yerləşdirilən aşağı konsentrasiyalı poliakrilamid geldir. | Ayırıcı gel və ya SDS-PAGE texnikasının həlledici geli aşağı konsentrasiyalı yığma gelin üstünə yerləşdirilən yüksək konsentrasiyalı poliakrilamid geldir. |
| Yerləşdirmə | |
| Yığınlayıcı gel həlledici (ayırıcı) gelə yerləşdirilir. | Ayırıcı gel gel elektroforezi üçün istifadə edilən qabın altına yerləşdirilir. |
| Konsentrasiya | |
| Yığma gelinin konsentrasiyası yüksəkdir. | Ayırıcı gelin konsentrasiyası aşağıdır. |
| Poliakrilamid Tərkibi | |
| Yığma geli təxminən 7% poliakrilamiddən ibarətdir. | Ayırıcı gel təxminən 10% poliakrilamid ehtiva edir. |
| pH | |
| Yığma gelinin pH-ı 6.8-dir. | Ayırıcı gelin pH-ı 8.8-dir. |
| Məsamə ölçüsü | |
| Böyük məsamə ölçüləri yığma geldə mövcuddur. | Ayırıcı geldə kiçik məsamə ölçüləri mövcuddur. |
| Qətiyyət | |
| Yığma geli daha yaxşı ayırdetmə verir. | Ayırıcı gel zəif həll edir. |
Xülasə – Yığma Gel və Ayırıcı Gel
Yığınlayıcı gel və ayırıcı gel verilmiş nümunədə zülal molekullarının daha yaxşı ayrılması üçün istifadə edilən iki növ poliakrilamid geldir. Yığma geli ilə ayırıcı gel arasındakı fərq ondan ibarətdir ki, yığma gelin pH 6,8, ayırıcı gelin pH isə 8,8-dir.
