Klon ardıcıllığı ilə klonlama və ov tüfəngi ardıcıllığı arasındakı əsas fərq onların davranış metodundadır. Klon sıralama üsulu ilə klonlama xromosomların xəritələşdirilməsini və sekvensiyadan əvvəl klonlamağı nəzərdə tutur, ov tüfəngi ilə klonlama isə ardıcıllaşdırma zamanı həm xromosom xəritələşdirilməsini, həm də klonlaşdırma addımlarını buraxır.
Klon ardıcıllığı ilə klonlama və ov tüfəngi ardıcıllığı ilə klonlama müasir genom ardıcıllığının iki üsuludur. Klon ardıcıllığı ilə klonlama ardıcıllığın daha etibarlı üsuludur. Bununla belə, ov tüfənginin ardıcıllığı ilə klonlama üsulu daha sürətli və daha ucuzdur. Məqalə klon ardıcıllığı ilə klonlama və ov tüfəngi ardıcıllığı arasındakı incə fərqə diqqət yetirir.
Clone Sequencing by Clone nədir?
Klon ardıcıllığı ilə klonlama genom ardıcıllığı üsuludur. DNT parçalanmasından əvvəl hər bir xromosomun xəritələşdirilməsini tələb edir. Xəritəçəkmə aparıldıqdan sonra DNT 150 kilobaza uzunluğunda fraqmentlərə bölünməlidir. Sonra bu fraqmentlər ardıcıllığa hazırdır. Növbəti addım DNT fraqmentlərinin Bakterial Süni Xromosomlara (BAC) və sonra bakteriya hüceyrələrinə daxil edilməsidir. Parçalar artıq bakteriya hüceyrələrinin içərisində olduğundan, bakteriyalar hər dəfə bölündükdə içəriyə daxil edilən DNT parçaları da bölünür və çoxlu eyni nüsxələr əmələ gətirir. Sonra fərdi bakterial klon DNT 500 əsas cüt uzun fraqmentlərə parçalanır. Onlar daha kiçik və üst-üstə düşən fraqmentlərdir. Sonra, ardıcıllıq bu fraqmentlərin məlum DNT ardıcıllığına malik vektora daxil edilməsi ilə baş verir. Vektorun məlum ardıcıllığından başlayaraq ardıcıllıq naməlum ardıcıllığa qədər davam edir.
Ardıcıllığı tamamladıqdan sonra üst-üstə düşən ardıcıllığın sahələrini müəyyən etmək lazımdır. Bundan sonra, ilkin olaraq BAC-lərdə təqdim olunan daha böyük fraqmentləri yaratmaq üçün fraqmentlərin birləşməsi baş verir. Sonra, daha böyük fraqmentlərin xromosoma yığılması genom xəritəsinə uyğun olaraq baş verir.
Şəkil 01: Klon Sıralaması ilə Klonlama
Klon ardıcıllığı ilə klonun əhəmiyyətli üstünlüyü ondan ibarətdir ki, əvvəlcədən hazırlanmış genom xəritəsi daha böyük fraqmentlərin etibarlı yığılmasına kömək edir. Lakin bu ardıcıllaşdırma metodunun dezavantajı genom xəritələrinin yaradılması və klonların yaradılmasının çox vaxt aparmasıdır. Bununla belə, bu, “İnsan Genomu Layihəsi” zamanı üstünlük verilən üsul idi.
Ov tüfəngi ardıcıllığı ilə Klon nədir?
Ov tüfənginin ardıcıllığı ilə klonlama DNT ardıcıllığını təsadüfi olaraq çoxlu kiçik fraqmentlərə parçalayan və üst-üstə düşən bölgələri müşahidə edərək ardıcıllığı yenidən yığan ardıcıllıq üsuludur. Daha böyük məməlilərin genomlarını klonlaşdırmaq və toplamaq çətindir. Bu, onların struktur mürəkkəbliyi və ölçüsü ilə bağlıdır. Klon sıralama metodu ilə klon etibarlı olsa da, mürəkkəb orqanizmlərin genomlarının ardıcıllaşdırılması uzun müddət tələb edir. Buna görə də, ov tüfənginin ardıcıllığı ilə klonlama daha sürətli yerinə yetirilə bilən etibarlı daha ucuz ardıcıllıq üsuluna çevrildi. Beləliklə, müasir elm adamları mürəkkəb genomlarla mübarizə aparmaq üçün bu ardıcıllıq metoduna etibar edirlər.
Şəkil 02: Ov tüfənginin ardıcıllığı ilə klonlama
Ov tüfəngi ardıcıllığı üsulu ilə klonlama zamanı heç bir adi genom xəritəsi və klonlama addımları baş vermir. Əvvəlcə bütün genom 20 kilobazdan 300 kilobaza qədər müxtəlif ölçülərə parçalanır. Sonra, ardıcıllıq baş verir. Sonra, mürəkkəb kompüter proqramından istifadə edərək, üst-üstə düşən bölgələrə baxaraq fraqmentləri yığmaq lazımdır.
Ov tüfəngi ardıcıllığı ilə klonlama mövcud genom ardıcıllıqlarının dəqiqliyini yaxşılaşdırmağa kömək edir. Bu metodun əsas üstünlüyü ondan ibarətdir ki, o, klon sıralama üsulu ilə klonla müqayisədə çox daha sürətli və daha ucuzdur. Lakin bu proses genetik xəritənin istifadəsini nəzərdə tutmur. Beləliklə, montaj zamanı səhvlərin baş vermə ehtimalı daha yüksəkdir. Beləliklə, bu, ov tüfənginin ardıcıllığı metodu ilə klonlamada əsas çatışmazlıqdır.
Klon ardıcıllığı ilə klonlama və ov tüfəngi ardıcıllığı arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Həm klon ardıcıllığı ilə klonlama, həm də ov tüfəngi ardıcıllığı genom ardıcıllığının iki üsuludur.
- Hər iki ardıcıllıq texnikası zamanı üst-üstə düşən bölgələri müəyyən etməklə parçalanmış fraqmentlərin yığılması baş verir.
- Həmçinin, DNT-nin daha kiçik fraqmentlərə parçalanması həm klon, həm də ov tüfənginin ardıcıllığı üçün lazımdır.
Klon ardıcıllığı ilə klonlama ilə ov tüfəngi ardıcıllığı arasındakı fərq nədir?
Klon sıralama texnikası ilə klonlama iki əsas addımı əhatə edir: xromosomların xəritələşdirilməsi və klonlaşdırma. Bunun əksinə olaraq, ov tüfəngi ilə klonlama bu iki addımı izləmir; təsadüfi olaraq DNT ardıcıllığını bir çox kiçik fraqmentlərə parçalayır və üst-üstə düşən bölgələri müşahidə edərək ardıcıllığı yenidən birləşdirir. Beləliklə, bu, klon ardıcıllığı ilə klonlama və ov tüfəngi ardıcıllığı arasındakı əsas fərqdir. Bu faktora görə, klon ardıcıllığı ilə klonlama bahalı və vaxt aparan prosesdir, ov tüfəngi ilə klonlama isə daha sürətli və daha ucuzdur.
Lakin montaj zamanı xətaların klon ardıcıllığı ilə klonlama zamanı baş vermə ehtimalı azdır. Beləliklə, yüksək etibarlılığa malikdir. Bununla belə, ov tüfənginin ardıcıllığı ilə klonlama nisbətən daha az etibarlı bir texnikadır. Beləliklə, bu həm də klon ardıcıllığı ilə klonlama və ov tüfəngi ardıcıllığı arasında əhəmiyyətli fərqdir.
Aşağıdakı info-qrafik klon sıralaması ilə klonlama və ov tüfəngi ardıcıllığı arasındakı fərqlə bağlı daha çox məlumat təqdim edir.
Xülasə – Klon Sıralaması ilə Klonlama və Ov Tüfəngi Sıralaması
Klon ardıcıllığı ilə klon və ov tüfəngi ardıcıllığı arasındakı fərqi ümumiləşdirərkən, klon ardıcıllığı və ov tüfəngi ardıcıllığı ilə klon genom ardıcıllığının iki üsuludur. Bununla birlikdə, klon ardıcıllığı texnikası ilə klonlama həm genom xəritələşdirilməsini, həm də klonlaşdırma proseslərini əhatə edir, ov tüfəngi ilə klonlama isə bunu etmir. Beləliklə, bu, klon ardıcıllığı ilə klonlama və ov tüfəngi ardıcıllığı arasındakı əsas fərqdir. Genom xəritələşdirilməsi klon ardıcıllığı ilə klon zamanı baş verdiyindən, ardıcıllıqların yığılması zamanı səhvlərin baş vermə ehtimalı azdır. Lakin, ov tüfənginin ardıcıllığı ilə klonlama çox daha sürətli və daha ucuz bir prosesdir. Bununla belə, nisbətən az etibarlıdır. "İnsan Genomu Layihəsi" zamanı klon ardıcıllığı ilə klonlama üstünlük verilən ardıcıllıq üsulu idi. Lakin, müasir molekulyar bioloq daha çox ov tüfənginin ardıcıllığı ilə klonlamaya əsaslanır.
