Əsas Fərq – Əsas Eksizyon Təmiri ilə Nukleotid Eksizyon Təmiri
DNT müxtəlif daxili və xarici faktorlar səbəbindən tez-tez zədələnir. Hüceyrəni bərpa edən sistemlər isə mutasiyaya çevrilməmişdən və ya sonrakı nəsillərə keçməmişdən əvvəl zədələri dərhal və davamlı olaraq düzəldirlər. Hüceyrələrdə üç növ eksizyon təmiri sistemi var: nukleotidlərin eksizyon təmiri (NER), əsas eksizyon təmiri (BER) və tək zəncirli DNT zədələrini təmir etmək üçün DNT uyğunsuzluğunun təmiri (MMR). Baza eksizyon təmiri ilə nukleotid eksizyon təmiri arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, baza eksizyon təmiri hüceyrələrdə endogen səbəb olan tək nükleotid zədələrini təmir etmək üçün işləyən sadə bir təmir sistemidir, nukleotid eksizyonunun təmiri isə hüceyrələrdə nisbətən təmir etmək üçün işləyən mürəkkəb bir təmir sistemidir. daha böyük, zədələnmiş bölgələrə ekzogen səbəb oldu.
Baza Eksizyon Təmiri nədir?
Əsas eksizyon təmiri hüceyrələrin malik olduğu DNT təmir sisteminin ən sadə versiyasıdır. DNT-dəki kiçik zədələri bərpa etmək üçün istifadə olunur. DNT əsasları deaminasiya və ya alkilləşmə nəticəsində dəyişdirilir. Baza zədələnmələri olduqda, DNT qlikosilaz əsas eksizyonun bərpa sistemini tanıyır və aktivləşdirir və AP endonükleaza, DNT polimeraza və DNT liqaz fermentlərinin köməyi ilə onu bərpa edir. BER sisteminə aşağıdakı addımlar daxildir.
- Abazik sahə yaratmaq üçün yanlış və ya zədələnmiş bazanın DNT qlikosilazı tərəfindən tanınması və çıxarılması (baz itkisi yerləri – apiurinik və ya apirimidinik yerlər).
- Apurinik/apirimidinik endonukleaza ilə abasik sahənin kəsilməsi
- Qalan şəkər parçasının liaz və ya fosfodiesteraza ilə çıxarılması
- Boşluğu DNT polimeraza ilə doldurur
- Nikin DNT liqazı ilə bağlanması
Şəkil 01: Əsas eksizyonun təmiri yolu
Nükleotid Eksizyon Təmiri nədir?
Nucleotide Excision Repair (NER) hüceyrələrdə mühüm DNT eksizyonu təmir sistemidir. Uzunluğu 30 bazaya qədər zədələnmiş nahiyələri təmir edib əvəz edə bilir və zədələnməmiş şablon ipi ilə idarə olunur. Ümumi DNT zədələnmələri ultrabənövşəyi radiasiya səbəbiylə meydana gəlir və NER mutasiyaya çevrilməzdən və gələcək nəsillərə keçməzdən və ya xəstəliklərə səbəb olmadan dərhal bu zədələri təmir edərək DNT-ni qoruyur. NER xüsusi olaraq ətraf mühit və kimyəvi kanserogenlər kimi ekzogen amillərin dolayı səbəb olduğu mutasiyalardan qorunma təmin edir. NER demək olar ki, bütün orqanizmlərdə müşahidə olunur və DNT spiralında əhəmiyyətli təhriflərə səbəb olan zərərləri tanıyır.
NER prosesi XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB və s. kimi bir çox zülalın hərəkətini əhatə edir və bir neçə kəsmə və yapışdırmaya bənzər mexanizmlər vasitəsilə davam edir. Bu zülallar təmir prosesinin tamamlanması üçün vacibdir və NER zülallarından birində qüsur həyati əhəmiyyət kəsb edir və nadir resessiv sindromlara səbəb ola bilər: xeroderma pigmentosum (XP), Kokain sindromu (CS) və kövrək saç pozğunluğunun fotosensitiv forması. trichotiodistrofiya (TTD).
Şəkil 02: Nukleotid Eksizyon Təmiri
Baza Eksizyon Təmiri ilə Nukleotid Eksizyon Təmiri arasında fərq nədir?
Baza Eksizyon Təmiri vs Nukleotid Eksizyon Təmiri |
|
| Əsas eksizyon təmiri (BER) hüceyrələrdə baş verən DNT təmir sistemidir. | Nükleotid eksizyon təmiri (NER) hüceyrələrdə tapılan DNT təmir sisteminin başqa bir növüdür. |
| DNT əlavələrinin tanınması | |
| BER kiçik DNT əlavələrinə ziyan vurur. | NER böyük DNT əlavələrini təmir edir. |
| DNT Zərərləri | |
| BER DNT spiralında əhəmiyyətli təhriflərə səbəb olmayan zərərləri tanıyır. | NER DNT spiralında əhəmiyyətli təhriflərə səbəb olan zərərləri tanıyır. |
| DNT Zərərlərinin Səbəbləri | |
| BER endogen mutagenlərin vurduğu zərərləri bərpa edir. | NER ekzogen mutagenlərin vurduğu zərərləri bərpa edir. |
| Mürəkkəblik | |
| BER ən az mürəkkəb təmir sistemidir | BER-dən daha mürəkkəbdir. |
| Zülallara ehtiyac | |
| BER digər zülallara ehtiyac duymur. | NER zədələnmiş və zədələnməmiş bölgələri ayırd etmək üçün bir neçə gen məhsulunu, xüsusən də zülalları tələb edir. |
| Uyğunluq | |
| BER tək əsas zədələri düzəltmək üçün uyğundur. | NER zədələnmiş bölgələri əvəz etmək üçün uyğundur. |
Xülasə – Əsas Eksizyon Təmiri ilə Nukleotid Eksizyon Təmiri
NER və BER hüceyrələrdə tapılan iki növ DNT eksizyonu təmir prosesidir. BER endogen yolla dəyən kiçik zədələri, NER isə əsasən ekzogen səbəb olan 30 əsas cüt uzunluğuna qədər zədələnmiş bölgələri təmir edə bilir. BER tanınan substrat növlərinə və ilkin parçalanma hadisəsinə görə NER-dən fərqlənir. BER həmçinin DNT spiralındakı əhəmiyyətli təhriflərin səbəb olmadığı zədələri tanıya bilər, NER isə DNT spiralının əhəmiyyətli təhriflərini tanıyır. Bu, əsas eksizyon təmiri ilə nukleotid eksiziyası arasındakı fərqdir.
