Əsas Fərq – Genotipləşdirmə və Ardıcıllıq
Genotipləşdirmə və ardıcıllıq, orqanizmin əsasən DNT-si olan nuklein turşuları haqqında məlumat əldə etmək üçün həyata keçirilən iki üsuldur. Genotipləşdirmə ilə ardıcıllaşdırma arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, genotipləşdirmə fərdin hansı genetik varianta malik olduğunun markerlərdən istifadə edərək müəyyən edilməsi prosesidir, ardıcıllıq isə DNT-nin verilmiş fraqmentində nukleotid ardıcıllığının düzgün sırasının müəyyən edilməsidir.
Genotipləşdirmə nədir?
Genotipləşdirmə DNT və markerlər ardıcıllığından istifadə edərək fərdin genetik quruluşunun təyin edilməsi və onun irsinin müqayisəsi və identifikasiyasıdır. Genotipləşdirmə orqanizmlərin təkamül biologiyası, populyasiya biologiyası, taksonomiyası, ekologiyası və genetikasında vacibdir. DNT ardıcıllığı, polimeraza zəncirvari reaksiya, məhdudlaşdırma fraqmentinin uzunluğu polimorfizmi (RFLP), təsadüfi gücləndirilmiş polimorf aşkarlama, gücləndirilmiş fraqment uzunluğu polimorfizmi (AFLP), DNT mikroarrayları və s. daxil olmaqla müxtəlif üsullarla həyata keçirilə bilər.
Genotipləşdirmə DNT ardıcıllığının xüsusi kiçik fraqmentlərinin ardıcıllığını və genetik markerlərdən istifadə edərək digər fərdlərlə genetik tərkibin əlaqəsinin tapılmasını nəzərdə tutur. Fərdlər və ya spesifik allellər arasında tək nukleotid polimorfizmlərini (SNP) təyin edir. Genotipləmə insan da daxil olmaqla, çoxlu orqanizmlərə şamil edilir. O, həmçinin viruslar, göbələklər və s. kimi mikroorqanizmlərə şamil edilir və istinad profilləri ilə onların genetik variantlarını müəyyən etmək üçün istifadə edilə bilər. Molekulyar epidemiologiya və məhkəmə mikrobiologiyasında patogenlərə, xüsusən də mikroorqanizmlərə nəzarət genotipləşdirmədən əldə edilən məlumatlarla həyata keçirilir. Genotipləmə damazlıq analizində çox vacibdir. İnsanlar analıq və atalığı təsdiqləmək üçün genotiplənirlər. Genotip spesifik xüsusiyyətlərə qərar verən genlərin dominant və resessiv allellərini aşkar edəcək.
Şəkil_1: RFLP Genotipləmə
Ardıcıllıq nədir?
Sequencing DNT və ya RNT-nin verilmiş fraqmentində nukleotidin düzgün sırasının müəyyən edilməsi prosesidir. Bir orqanizmin böyüməsi və inkişafı üçün lazım olan faktiki olaraq bütün məlumatlar onun genomunda kodlanır. Bir neçə yüz nukleotid uzunluğunda nuklein turşularının fraqmentlərini istehsal etmək və ayırmaq üçün texnikanın mövcudluğu DNT və ya RNT-nin müəyyən bir fraqmentinin dəqiq nukleotid ardıcıllığını təyin etmək prosedurlarının inkişafına səbəb oldu. Bu gün müxtəlif növ ardıcıllıq üsulları mövcuddur. Bu ardıcıllaşdırma üsulları orqanizmin bütün genomunu təmsil edən genom kitabxanalarının qurulması texnologiyaları ilə birlikdə gen strukturlarının, gen funksiyalarının, gen yerlərinin, gen ifadələrinin dərin təhlilini apararaq, həmin orqanizmin bütün genomunun ardıcıllığını asanlaşdırır. gen xəritəsi, gen tənzimləmə bölgələri və s.
Bir çox virusların, bir neçə bakteriyanın, arxebakteriyaların, mayaların və bəzi digər orqanizmlərin ümumi genomları ardıcıllıqla tərtib edilmiş və xəritələşdirilmişdir. İnsan genomu layihəsi bütün insan genomunun ardıcıllığını və xəritəsini tərtib etməyə və onun ilk layihəsini 2003-cü ildə dərc etməyə imkan verdi. Bu, biologiyanın inkişafında mühüm mərhələdir. İnsan genomu ardıcıllığı indi tibb sektorunda nadir xəstəliklərin genetik səbəblərini müəyyən etmək, yeni doğulmuş uşaqlarda xəstəlik riskini yoxlamaq, müxtəlif xərçəng növlərinin genetik detallarını müəyyən etmək, yeni terapevtiklər hazırlamaq və yeni diaqnostika vasitələri hazırlamaq və s. üçün istifadə olunur.
Bitki dünyasında düyü genomu və Arabidopsis genomları ardıcıllıqla müəyyən edilmişdir. Bu ardıcıllıqlar haqqında bilik, şübhəsiz ki, hüceyrələrin və orqanizmlərin necə fəaliyyət göstərdiyinə dair anlayışımızda inqilab edəcək.
Şəkil_2: Sanger ardıcıllığının avtoradioqrafı
Genotipləşdirmə və Ardıcıllıq arasındakı fərq nədir?
Genotipləşdirmə vs Ardıcıllıq |
|
| Genotipləşdirmə fərdin genetik tərkibinin müəyyən edilməsi və həmin orqanizmin qrupunun və ya taksonomiyasının yoxlanılması prosesidir. | Sequencing verilmiş DNT və ya RNT fraqmentinin nukleotidlərinin dəqiq sırasının müəyyən edilməsi prosesidir. |
| Texnikalar | |
| RFLP, Gen ardıcıllığı, PCR, DNT mikroarrayları, AFLP və s. | Sanger ardıcıllığı, Gilbert ardıcıllığı, Pyrosequencing, Next Generation Sequencing, Ov tüfəngi ardıcıllığı və s. |
| Əsas Narahatlıqlar | |
| Bu, daha çox genotip fərqlərinin faktiki fenotip fərqlərini verib-verməməsi ilə bağlıdır. | Bu, daha çox nukleotidlərin sırası və onun digər orqanizmlərlə fərqləri və dəyişiklikləri ilə əlaqədardır. |
Xülasə – Genotipləşdirmə və Ardıcıllıq
Genotipləşdirmə və ardıcıllıq orqanizmlərin genetik məlumatlarını öyrənmək üçün faydalıdır. Genotipləşdirmə fərdlər arasında genotip dəyişikliklərinin müəyyən edilməsi və onların kateqoriyalarının tapılması prosesidir. Ardıcıllıq DNT-nin maraqlı fraqmentində və ya bölgəsində nukleotidlərin düzgün sırasını təyin etmək prosesidir. Hər iki texnika genlər və genomlar haqqında mühüm məlumat verir.
