Əsas Fərq – Alpha Helix vs Beta Qatlı Vərəq
Alfa spiralları və beta qatlı təbəqələr polipeptid zəncirində ən çox tapılan iki ikinci dərəcəli strukturdur. Bu iki struktur komponent bir polipeptid zəncirinin qatlanması prosesində ilk əsas addımlardır. Alpha Helix və Beta Pleated Sheet arasındakı əsas fərq onların strukturundadır; onların müəyyən bir işi görmək üçün iki fərqli forması var.
Alpha Helix nədir?
Alfa spiral polipeptid zəncirində amin turşusu qalıqlarından ibarət sağ əlli sarmaldır. Amin turşusu qalıqlarının diapazonu 4 ilə 40 qalıq arasında dəyişə bilər. Üst sargıdakı C=O qrupunun oksigeni ilə alt bobinin N-H qrupunun hidrogeni arasında yaranan hidrogen bağları sarğı bir yerdə saxlamağa kömək edir. Zəncirdəki hər dörd amin turşusu qalığı üçün yuxarıdakı şəkildə hidrogen bağı yaranır. Bu vahid nümunə ona rulonun qalınlığı kimi müəyyən xüsusiyyətlər verir və spiral oxu boyunca hər tam dönüşün uzunluğunu diktə edir. Alfa sarmal strukturunun sabitliyi bir neçə amildən asılıdır.
O atomları qırmızı, N atomları mavi, hidrogen bağları yaşıl nöqtəli xətlər şəklində
Beta Qatlı Vərəq nədir?
Beta təbəqə kimi də tanınan Beta qatlı təbəqə, zülallarda ikinci dərəcəli strukturun ikinci forması hesab olunur. O, şəkildə göstərildiyi kimi bükülmüş, bükülmüş vərəq yaratmaq üçün ən azı iki və ya üç onurğa hidrogen bağı ilə yanal birləşən beta telləri ehtiva edir. Beta zəncir polipeptid zəncirinin uzanmasıdır; uzunluğu ümumən 3-10 amin turşusuna bərabərdir, o cümlədən geniş təsdiqdə onurğa sütunu.
4-zəncirli antiparalel β vərəq fraqmenti katalaza fermentinin kristal strukturundan.
a) bitişik tellərdə peptid NH və CO qrupları arasında antiparalel hidrogen bağlarını (nöqtəli) göstərir. Oklar zəncirin istiqamətini, elektron sıxlığı konturları isə H olmayan atomları göstərir. O atomları qırmızı toplardır, N atomları mavidir və sadəlik üçün H atomları buraxılmışdır; yan zəncirlər yalnız birinci yan zəncir C atomunda göstərilir (yaşıl)
b) Mərkəzi iki β telinin kənardan görünüşü
Beta qatlı təbəqələrdə polipeptid zəncirləri bir-biri ilə yanaşı axır. Quruluşun dalğavari görünüşünə görə "qətəli təbəqə" adını alır. Onlar hidrogen bağları ilə bir-birinə bağlıdır. Bu struktur polipeptid zəncirini uzatmaqla daha çox hidrogen bağı yaratmağa imkan verir.
Alpha Helix və Beta Pleated Sheet arasındakı fərq nədir?
Alpha Helix və Beta Qatlı Vərəqin Strukturu
Alpha Helix:
Bu quruluşda polipeptid onurğa sümüyü spiral quruluş kimi xəyali ox ətrafında sıx şəkildə bağlıdır. O, həmçinin peptid zəncirinin helikoid düzülüşü kimi tanınır.
Alfa spiral quruluşunun əmələ gəlməsi polipeptid zəncirləri spiral şəklində büküldükdə baş verir. Bu, zəncirdəki bütün amin turşularının bir-biri ilə hidrogen bağı (oksigen molekulu ilə hidrogen molekulu arasında bağlanma) yaratmasına imkan verir. Hidrogen bağları spiralın spiral formasını saxlamağa imkan verir və sıx bir rulon verir. Bu spiral forma alfa spiralını çox güclü edir.
Hidrogen bağları sarı nöqtələrlə göstərilir.
Beta Qatlı Vərəq:
İki və ya daha çox polipeptid zəncirinin (zəncirlərinin) fraqmentləri bir-biri ilə üst-üstə düşərək bir-biri ilə bir sıra hidrogen bağları meydana gətirdikdə, aşağıdakı strukturlar tapıla bilər. Bu iki şəkildə baş verə bilər; paralel düzülmə və antiparalel düzülmə.
Struktur nümunələri:
Alpha Helix: Əl və ya ayaq dırnaqları alfa spiral quruluşuna nümunə kimi götürülə bilər.
Beta Qatlı Vərəq: Lələklərin quruluşu beta qatlı təbəqənin quruluşuna bənzəyir.
Strukturun xüsusiyyətləri:
Alpha Helix: Alfa spiral quruluşunda hər döngədə 3,6 amin turşusu var. Bütün peptid bağları trans və planardır və peptid bağlarındakı N-H qrupları eyni istiqamətə yönəlir, bu da təxminən spiral oxuna paraleldir. Bütün peptid bağlarının C=O qrupları əks istiqamətə işarə edir və onlar spiral oxuna paraleldirlər. Hər bir peptid bağının C=O qrupu, hidrogen bağı meydana gətirən peptid bağının N-H qrupuna bağlanır. Bütün R- qrupları sarmaldan xaricə yönəldilmişdir.
Beta qatlı vərəq: Beta qatlı təbəqədəki hər bir peptid bağı planardır və trans-konformasiyaya malikdir. Qonşu zəncirlərdən C=O və N-H peptid bağları qrupları eyni müstəvidədir və aralarında hidrogen bağı əmələ gətirərək bir-birinə yönəlir. İstənilən zəncirdəki bütün R- qrupları alternativ olaraq vərəqin müstəvisinin üstündə və altında ola bilər.
Təriflər:
İkinci struktur: Onurğa amid və karbonil qrupları arasında hidrogen bağlanması səbəbindən qatlanan zülal formasıdır.
