LTR və qeyri-LTR retrotranspozonları arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, LTR retrotranspozonları strukturlarında uzun terminal təkrarlarına malik retrotranspozonlar növüdür, qeyri-LTR retrotranspozonlar isə uzun terminal təkrarları olmayan retrotranspozonlar növüdür. onların strukturunda.
Retrotranspozonlar (I sinif transpozisiya olunan elementlər və ya RNT aralıq məhsulları vasitəsilə transpozonlar) özlərini müxtəlif genomik yerlərə köçürə və yapışdıra bilən genetik komponent növüdür. Onlar bunu RNT transpozisiya aralıq məhsulundan istifadə edərək əks transkripsiya deyilən bir proses vasitəsilə RNT-ni yenidən DNT-yə çevirməklə həyata keçirirlər. LTR və qeyri-LTR retrotranspozonlar kimi iki əsas retrotranspozon növü var
LTR Retrotranspozonları nədir?
LTR retrotranspozonları strukturlarında uzun terminal təkrarları olan retrotranspozonlar növüdür. LTR retrotranspozonunun hər iki ucunda təkrarlanan DNT-nin uzun zəncirləri tapıla bilər. Bunlar uzun terminal təkrarları (LTR) kimi tanınır. Hər LTR bir neçə yüz əsas cüt uzunluğundadır. LTR retrotranspozonlarının uzunluğu adətən 5 kilobazadan çoxdur. Üstəlik, uzun terminal təkrarları arasında retrovirus genləri gag və pol ilə ekvivalent transkripsiya edilə bilən genlər var. Bu genlər üst-üstə düşür ki, nəticədə əldə edilən transkripti normal olaraq funksional gen məhsullarına emal edən proteazı kodlayırlar.
Şəkil 01: LTR Retrotranspozonları
Retrotranspozonların Gag geni virusa bənzər hissəciklər yaratmaq üçün digər retrotranspozonların transkriptləri ilə birləşən məhsul yaradır. Pol geni əks transkriptaza, inteqraza və ribonukleaz H domenləri kimi fermentləri ehtiva edən məhsullar istehsal edir. Əks transkriptaza fermenti retrotranspozon DNT-nin tərs transkripsiyasını həyata keçirir. İnteqraza fermenti retrotranspozon DNT-ni eukaryotik genom DNT-yə inteqrasiya edir. Ribonuklease H domenləri RNT aralıq məhsulları arasında fosfodiester bağlarının parçalanmasında faydalıdır. LTR retrotranspozonları həmçinin transkriptləri tRNT-yə bağlama yerləri ilə kodlayır ki, onlar asanlıqla tərs transkripsiyadan keçə bilsinlər. Bundan əlavə, retrotranspozon eukaryotik genom məlumatını ehtiva etdiyinə görə, o, öz surətlərini eukaryotik hüceyrənin digər genomik yerlərinə daxil edə bilər.
LTR olmayan retrotranspozonlar nədir?
LTR olmayan retrotranspozonlar strukturlarında uzun terminal təkrarları olmayan retrotranspozonlar növüdür. LTR retrotranspozonları kimi, qeyri-LTR retrotranspozonlar da əks transkriptaza, RNT bağlayıcı zülal, nukleaza və bəzən ribonukleaz H domenləri üçün genləri ehtiva edir. Lakin onlar uzun terminal təkrarları yoxdur; əvəzinə, onlar bir-birinin yanında əsasların tərs sırasına malik ola biləcək qısa təkrarlara malikdirlər. RNT-ni bağlayan zülallar RNT transpozisiyasının ara məhsuluna bağlanır və nukleazlar nuklein turşularındakı nukleotidlər arasında fosfodiester bağlarını qırır.
Şəkil 02: LTR və Qeyri-LTR Retrotranspozonlar
Onlar retrotranspozonlar olsalar da, LTR retrotranspozonları kimi RNT ara məhsulundan istifadə edərək tərs transkripsiyanı həyata keçirə bilməzlər. Bunun səbəbi, LTR olmayan retrotranspozonlarda tRNT-ni bağlayan ardıcıllıqların olmamasıdır. Beləliklə, mRNT-yə transkripsiya edilmiş və zülallara çevrilmiş qeyri-LTR retrotranspozon əks transkriptaza kimi fəaliyyət göstərir. Əks transkriptaza, LTR olmayan retrotranspozonun RNT-nin DNT nüsxəsini yaradır və yeni bir yerdə genomuna inteqrasiya oluna bilər. Bundan əlavə, LTR olmayan retrotranspozonlar iki növə bölünür: Xətlər (uzun kəsişmiş nüvə elementləri) və SINE (qısa kəsişmiş nüvə elementləri).
LTR və qeyri-LTR retrotranspozonları arasında hansı oxşarlıqlar var?
- LTR və qeyri-LTR retrotranspozonlar retrotranspozonların iki əsas növüdür.
- Hər iki növdə əks transkriptaza, RNT bağlayan zülal, nukleaza və ribonukleaza H domenləri kimi fermentlər üçün genlər var.
- Onlar insan genomunda tapıla bilər.
- Hər iki növ təkamül baxımından vacibdir.
LTR və Qeyri-LTR Retrotranspozonlar Arasındakı Fərq Nədir?
LTR retrotranspozonlarının strukturunda uzun terminal təkrarları var, qeyri-LTR retrotranspoonların isə strukturunda uzun terminal təkrarları yoxdur. Beləliklə, bu LTR və qeyri-LTR retrotranspozonları arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, LTR retrotranspozonlarında uzun birbaşa təkrarlar var ki, bu da özlərini təkrarlayan əsasların yalnız bir ardıcıllığıdır. Digər tərəfdən, LTR olmayan retrotranspozonların qısa təkrarları var ki, onlar bir-birinin yanında əsasların tərs sırasına malik ola bilər.
Aşağıdakı infoqrafika LTR və qeyri-LTR retrotranspozonlar arasındakı fərqləri yan-yana müqayisə üçün cədvəl şəklində təqdim edir.
Xülasə – LTR və Qeyri-LTR Retrotranspozonlar
LTR və qeyri-LTR retrotranspozonlar retrotranspozonların iki əsas növüdür. LTR retrotranspozonlarının strukturunda uzun terminal təkrarları var, qeyri-LTR retrotranspozonların isə strukturunda uzun terminal təkrarları yoxdur. Beləliklə, LTR və qeyri-LTR retrotranspozonları arasında əsas fərq budur.
