Sinif I və II transpozisiya elementləri arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, sinif I köçürülə bilən elementlər retrotranspozonlar, II sinif köçürülə bilən elementlər isə DNT transpozonlarıdır.
Köçürülə bilən element genom daxilində yerini dəyişə bilən DNT ardıcıllığıdır. Bəzən mutasiyaları yaradır və geri qaytarır. O, həmçinin hüceyrənin genetik şəxsiyyətini və genom ölçüsünü dəyişə bilər. Bu proses çox vaxt eyni genetik materialın təkrarlanması ilə nəticələnir. Köçürülə bilən elementi ilk dəfə Barbara McClintock kəşf etdi və o, 1983-cü ildə kəşfinə görə Nobel mükafatını qazandı. Köçürülə bilən elementlər transpozisiya mexanizminə görə iki sinfə təsnif edilə bilər: sinif I və sinif II köçürülə bilən elementlər.
Sinif I Transpozisiya Elementləri nədir?
Sinif I yer dəyişdirilə bilən elementlər retrotranspozonlardır. Retrotranspozon, əks transkripsiya deyilən bir proses vasitəsilə RNT-ni yenidən DNT-yə çevirərək özünü müxtəlif genomik yerlərə köçürən və yapışdıran bir genetik komponent növüdür. Bu proses əks transkriptaza fermenti tərəfindən kataliz edilir. Retrotranspozon adətən RNT transpozisiya ara məhsulundan istifadə edir. I sinif transpozisiya elementləri adətən iki mərhələdə kopyalanır. Birincisi, onlar DNT-dən RNT-yə köçürülür. Sonra istehsal olunan RNT DNT-yə əks transkripsiya edilir. Daha sonra bu kopyalanan DNT yeni bir mövqedə yenidən genomun içərisinə daxil edilir. Retrotranspozonların xüsusiyyətləri HİV kimi retroviruslara çox oxşardır.
Şəkil 01: Sinif I Transpozisiya Elementi
Retrotranspozonlar üç növə bölünə bilər.
- Tərs transkriptazı kodlayan uzun terminal təkrarlı retrotranspozonlar (LTR),
- Tərs transkriptazı kodlayan, lakin LTR-ləri olmayan və RNT polimeraza II,ilə transkripsiya edilən uzun kəsişmiş nüvə elementləri (HƏT) olan retrotranspozonlar
- Tərs transkriptaza üçün kodlaşdırılmayan və RNT polimeraza III ilə transkripsiya edilən qısa kəsişmiş nüvə elementləri (SINE) olan retrotranspozonlar.
Bundan başqa, retrotranspozonlarla oxşar mexanizm sayəsində retrovirus da köçürülə bilən elementlər hesab edilə bilər.
Sinif II Transpozisiya Elementləri nədir?
Sinif II köçürülə bilən elementlər DNT transpozonlarıdır. Sinif II transpozisiya elementləri RNT aralıq məhsulunu ehtiva etməyən kəsib yapışdırıb köçürmə mexanizminə malikdir. Transpozisiya bir neçə transpozaza fermenti tərəfindən katalizlənir. Bu fermentlər DNT-yə spesifik və ya qeyri-spesifik olaraq bağlana bilər. Transposaz, yapışqan ucları əmələ gətirən DNT-nin hədəf yerində pilləli bir kəsik edir. Sonra bunlar DNT transpozon liqatlarını digər hədəf ərazilərə kəsdi.
Şəkil 02: Sinif II Transpozisiya Elementləri
Adətən, DNT polimeraza yapışqan uclardan yaranan boşluqları doldurur və DNT liqaza şəkər-fosfat onurğasını bağlayır. Bundan əlavə, bu köçürmə hədəf saytın təkrarlanması ilə nəticələnir. DNT transpozonlarının daxil olduğu yerlər qısa, birbaşa təkrarlar və ardınca tərs təkrarlarla müəyyən edilə bilər. Lakin bütün DNT transpozonları kəsib yapışdırıb transpozisiya mexanizmini göstərmir. Məsələn, bəzi transpozonlar replikativ transpozisiya göstərir ki, burada transpozonlar özlərini yeni hədəf əraziyə təkrarlayır.
Sinif I və II Transpozisiya Elementləri Arasındakı Oxşarlıqlar
- Sinif I və II transpozisiya elementləri mobil genetik elementlər və ya tullanan genlərdir.
- Hər ikisi genomdakı mövqeyini dəyişə bilər.
- Onlar DNT ardıcıllığından ibarətdir.
- Onlar eqoist genetik elementlərdir.
- Onlar genomik funksiya və təkamüldə çox vacibdir.
Sinif I və II Transpozisiya Elementləri Arasındakı Fərq
Sinif I transpozisiya elementləri retrotranspozonlar, II sinif transpozisiya elementləri isə DNT transpozonlarıdır. Beləliklə, bu, I sinif və II sinif dəyişdirilə bilən elementlər arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, I sinif transpozisiya elementləri transpozisiya mexanizmində RNT aralıq maddələrindən istifadə edir. Digər tərəfdən, II sinif transpozisiya elementləri transpozisiya mexanizmində DNT aralıq maddələrindən istifadə edir.
Aşağıdakı infoqrafika yan-yana müqayisə üçün I və II sinif köçürülə bilən elementlər arasındakı fərqləri cədvəl şəklində tərtib edir.
Xülasə – Sinif I və II Sinif Transpozisiya Elementləri
Transpozisiya edilə bilən elementlər mobil genetik elementlər və ya tullanan genlər kimi tanınır. Bunlar DNT ardıcıllığıdır. Transpozisiya edilən elementlər transpozisiya mexanizminə görə sinif I və II sinif köçürülə bilən elementlər kimi iki sinfə bölünür. I sinif transpozisiya olunan elementlər retrotranspozonlar, II sinif transpozisiya olunan elementlər isə DNT transpozonlarıdır. Beləliklə, bu, sinif I və sinif II köçürülə bilən elementlər arasındakı əsas fərqdir.