Bağlayıcı ilə adapter arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, bağlayıcının birləşən ucları yoxdur, adapterin isə bir birləşdirici ucu var.
DNT-nin bağlanması iki DNT molekulunun fosfodiester bağlarının əmələ gəlməsi prosesidir. DNT liqaz adlı ferment bu reaksiyanı kataliz edir. Bu, rekombinant DNT texnologiyası və DNT klonlaşdırılması kimi müasir molekulyar bioloji sahələrdə kritik addımlardan biridir. Bağlamanın effektivliyi bağlanacaq DNT molekullarının uclarından asılıdır. Yapışqan uclar və küt uclar kimi iki növ DNT ucları var. Liqasiya səmərəliliyi küt uclara nisbətən yapışqan uclarla yüksəkdir. Hədəf DNT molekullarının küt ucları varsa, adapter və ya bağlayıcı adlanan molekullar faydalı olacaq. Adapterlər və bağlayıcılar DNT-nin bağlanmasına kömək edən kimyəvi olaraq sintez edilmiş oliqonukleotid molekullarıdır. Onların daxili məhdudiyyət saytları da var. Adapterin bir yapışqan və bir küt ucu, bağlayıcının isə iki küt ucu var.
Bağlayıcı nədir?
Bağlayıcı kimyəvi cəhətdən sintez edilmiş ikiqat zəncirli oliqonukleotid ardıcıllığıdır. Bağlayıcının iki küt ucu var. Bağlayıcı vektorlara küt ucları olan DNT molekullarını bağlamaq üçün istifadə olunur. O, bir və ya daha çox daxili məhdudiyyət saytını ehtiva edir. Bu məhdudiyyət saytları məhdudlaşdırıcı fermentlər üçün tanınma yeri kimi işləyir.
Şəkil 01: Bağlayıcı
Liqasiyadan sonra DNT birləşdirici uclar yaratmaq üçün yenidən məhdudlaşdırıcı fermentlərlə məhdudlaşdırılır. EcoRI-bağlayıcıları və sal-I əlaqələndiriciləri çox istifadə olunan əlaqələndiricilərdir.
Adaptor nədir?
Adapter iki DNT molekulunu bir-biri ilə əlaqələndirmək üçün istifadə edilən ikiqat zəncirli oliqonukleotid ardıcıllığıdır. Bir küt ucu və bir yapışqan və ya yapışqan ucu olan qısa ardıcıllıqdır. Buna görə də, o, bir ucunda DNT liqasiyasının effektivliyini artıran tək zəncirli quyruqdan ibarətdir.
Şəkil 02: Adaptorla DNT liqasiyası
Bundan başqa, adapterdə daxili məhdudiyyət saytları var. Buna görə də, bağlamadan sonra yeni çıxıntılı terminal yaratmaq üçün DNT müvafiq məhdudlaşdırıcı fermentlərlə məhdudlaşdırıla bilər. Adapterlərin bir dezavantajı odur ki, iki adapter özü ilə əsas cütləşərək dimmerlər yarada bilər. Onları qələvi fosfataza adlı fermentlə müalicə etməklə bunun qarşısını almaq olar.
Bağlayıcı və Adaptor arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Həm bağlayıcı, həm də adapter ikiqatlı qısa oliqonukleotid ardıcıllığıdır.
- Onlarda daxili məhdudiyyət saytları var.
- Bundan başqa, onlar kimyəvi yolla sintez edilmiş DNT molekullarıdır və sintetik molekullardır.
- Onlar iki DNT molekulunu birləşdirə bilər.
- Bağlayıcılar və adaptorlar bağlandıqdan sonra yapışqan uclar əmələ gətirmək üçün DNT yenidən məhdudlaşdırıcı fermentlərlə məhdudlaşdırılır.
Bağlayıcı və Adaptor Arasındakı Fərq Nədir?
Bağlayıcı kimyəvi cəhətdən sintez edilmiş iki küt ucu olan qısa oliqonukleotid dupleksidir. Adapter bir yapışqan ucu və bir küt ucu olan kimyəvi cəhətdən sintez edilmiş qısa oliqonukleotid dupleksidir. Beləliklə, bağlayıcı və adaptor arasındakı əsas fərq budur. Üstəlik, adapterlər dimerlər yarada bilər, bağlayıcılar isə dimerlər əmələ gətirmir. Beləliklə, bu, bağlayıcı və adaptor arasında daha bir əhəmiyyətli fərqdir.
Aşağıda cədvəl şəklində əlaqələndirici və adapter arasındakı fərqlərin xülasəsi verilmişdir.
Xülasə – Bağlayıcı və Adaptor
Bağlayıcı və adapter küt uçlu DNT-nin bağlanmasında faydalı olan iki növ kimyəvi sintez edilmiş oliqonukleotidlərdir. Bağlayıcının iki küt ucu, adapterin isə bir küt və bir yapışqan ucu var. Beləliklə, bağlayıcı və adaptor arasındakı əsas fərq budur. Onlar daxili məhdudlaşdırma yerləri olan ikiqat zəncirli molekullardır. Onlar rekombinant DNT texnologiyasında və DNT klonlanmasında geniş istifadə olunur.
