ORF və ekson arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, ORF və ya açıq oxu çərçivəsi DNT ardıcıllığının bir uzantısıdır və tərcümənin başlanğıc yerindən (başlanğıc kodonu) başlayır və ekzon olduğu halda tərcümənin dayandırılması yeri (stop kodonu) ilə bitir. amin turşularını kodlayan gen daxilində nukleotid ardıcıllığı.
Açıq oxu çərçivəsi oxu çərçivəsinin bir hissəsidir. Oxu çərçivələri zülal yaratmaq üçün ribosomlar tərəfindən oxunur. ORF tam funksional zülal verən kodonların davamlı uzanmasıdır. Başlanğıc kodonu ilə başlayır və dayanma kodonu ilə bitir. ORF-nin daxilində kodlaşdırma ardıcıllığını pozan heç bir stop kodonu yoxdur. Tərcümə başlanğıc kodonundan başlayır və dayanma kodonunda bitir. Ekson bir genin nukleotid ardıcıllığıdır. Zülalın amin turşularını kodlayır. Buna görə də, ekzonlar genin kodlaşdıran bölgələridir.
ORF nədir?
Açıq oxu çərçivəsi və ya ORF başlanğıc kodonu ilə başlayan və dayanma kodonu ilə bitən nukleotid ardıcıllığının davamlı uzanmasıdır. Sadə sözlə, ORF başlanğıc və dayanma kodonları arasında yerləşən nukleotid ardıcıllığının bölgəsinə aiddir. Arada ORF-ni kəsən heç bir dayanma kodonu yoxdur. Başlanğıc və dayanma kodonu arasındakı nukleotid ardıcıllığı amin turşularını kodlayır. Ümumiyyətlə, başlanğıc kodonu ATG, dayanma kodonları isə TAG, TAA və TGA-dır. ORF transkripsiya və tərcümə zamanı funksional zülal verir. Buna görə də, ORF bir başlanğıc kodonu, orta bölgədəki bir neçə kodon və dayanma kodonu ehtiva edir. Maraqlıdır ki, ORF üçə bölünə bilən uzunluğa malikdir.
Şəkil 01: ORF
Prokaryotlarda intronlar olmadığı üçün ORF birbaşa mRNT-yə transkripsiya edən genin kodlaşdırma bölgəsidir. Eukariotlarda, intronlar olduğundan, ORF emaldan və ya RNT-nin birləşdirilməsindən sonra nəticələnən kodon ardıcıllığıdır. ORF, uzun ORF-lərin genin bir hissəsi ola biləcəyi üçün gen proqnozlaşdırılmasına kömək edən bir sübutdur.
Ekson nədir?
Eksonlar zülallara çevrilən genlərin kodlaşdırıcı nukleotid ardıcıllığıdır. Onlar intronun hər iki tərəfindədirlər. Əvvəlcədən mRNT-dən kodlaşdırılmayan ardıcıllıqları çıxardıqdan sonra yetkin mRNT molekulu yalnız ekzon ardıcıllıqlarından ibarətdir. Sonra son RNT molekulunun (yetkin mRNT) nukleotid ardıcıllığı xüsusi zülalın amin turşusu ardıcıllığına çevrilir.
Şəkil 02: Eksonlar
Demək olar ki, bütün genlər onu əsas DNT və ya RNT zəncirindən gen kimi fərqləndirən ilkin nukleotid ardıcıllığına malikdir və bu, Açıq Oxu Çərçivəsi (ORF. Bəzi genlərdə iki ORF bütün geni və ekzonları qeyd edir. kodlaşdırma ardıcıllığı daxilində yerləşir. Eksonların həmişə genlərdə ifadə edildiyi səslənsə də, intron ardıcıllığının eksonla müdaxilə edərək mutasiyalara səbəb olduğu hallar var və bu proses eksonizasiya kimi tanınır.
ORF və Exon arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Həm ORF, həm də ekzon nukleotid ardıcıllığıdır.
- Uzun ORF və ekzonlar genin hissələridir.
- Hər ikisinin kodlaşdırma ardıcıllığı var.
ORF və Exon arasındakı fərq nədir?
ORF və ekzon nukleotid ardıcıllığıdır. ORF başlanğıc kodonu və dayanma kodonu arasında yerləşən DNT ardıcıllığının hər hansı bir uzantısına aiddir. Bunun əksinə olaraq, ekzon amin turşularını kodlayan genin kodlaşdırıcı nukleotid ardıcıllığıdır. Beləliklə, bu ORF və ekson arasındakı əsas fərqdir. Ekzonlar bir genin hissələridir, uzun ORF isə genin bir hissəsi ola bilər. Üstəlik, ekzonun hər iki tərəfində intronlar var, ORF isə intronlar daxil deyil.
Aşağıda infoqrafika ORF və ekson arasındakı fərqi cədvəl şəklində ümumiləşdirir.
Xülasə – ORF vs Exon
Açıq oxu çərçivəsi (ORF) oxu çərçivəsinin bir hissəsidir. Bu, başlanğıc kodonu ilə başlayan və dayanma kodonu ilə bitən DNT ardıcıllığının davamlı uzanmasıdır. Ekson bir genin nukleotid ardıcıllığıdır. mRNT ardıcıllığının bir hissəsini kodlayır. Buna görə də, ekzonlar zülalda ifadə olunan gen ardıcıllığının hissələridir. Beləliklə, bu, ORF və ekson arasındakı fərqi ümumiləşdirir.