Əsas Fərq – Prokaryotik və Eukaryotik RNT Polimeraz
RNT polimeraza bütün canlı orqanizmlərdə baş verən transkripsiya prosesindən məsul olan fermentdir. RNT polimeraza yüksək molekulyar ağırlıqlı bir fermentdir. RNT polimerazanın rəsmi adı DNT-yə yönəlmiş RNT polimerazdır. Transkripsiya zamanı RNT polimeraza ikiqat zəncirli DNT-ni açır ki, bir DNT zəncirindən mRNT molekulunun sintezi prosesi üçün şablon kimi istifadə olunsun. RNT (mRNT, rRNA və tRNA) molekullarının yaradılması zülal sintezində (tərcümə) son dərəcə vacib bir addımdır. Transkripsiya faktorları və transkripsiya vasitəçiliyi ilə əlaqəli komplekslər canlı hüceyrədə transkripsiyaya başlamaq üçün RNT polimeraza fermentinə rəhbərlik edir. RNT polimeraza genin promotor bölgəsinə (DNT) bağlanır və RNT polimeraza ilə katalizləşdirilmiş transkripsiyaya başlayır. Prokaryotik və eukaryotik transkripsiya əsasən RNT polimeraza fermentindəki fərqə görə fərqlənir. Prokaryotik və Eukaryotik RNT Polimeraz arasındakı əsas fərq, prokaryotik transkripsiyanın tək bir çox subunit tipli RNT polimerazası tərəfindən həyata keçirilməsidir. Əksinə, eukaryotik transkripsiya RNT polimeraza I (trankripsiya rRNA), RNT polimeraza II (trankripsiya mRNA) və RNT polimeraza III (tRNA-nı transkripsiya edən) kimi adlandırılan üç fərqli RNT polimeraza növü ilə katalizlənir.
Prokaryotik RNT Polimeraz nədir?
Prokaryotik RNT polimeraza çox alt birlikli ağır fermentdir. E coli-nin RNT polimerazası geniş şəkildə öyrənilir. Bu, molekulyar çəkisi 450 KDa olan mürəkkəb bir fermentdir. Holoenzim iki əsas komponentdən ibarətdir. Onlar əsas ferment və transkripsiya faktorlarıdır. Əsas ferment komponenti β', β, αI, αII və ω kimi beş alt bölməyə malikdir. Transkripsiya faktorları siqma amili (başlanğıc), nusA (uzatma).
Bu amillərdən β´ DNT-ni bağlama funksiyasını yerinə yetirir. Və β faktoru RNT polimerləşməsini həyata keçirən katalitik sahəyə malikdir. α və ω amillərinin funksiyaları hələ kəşf edilməmişdir. Bəziləri deyirlər ki, alfa faktoru (α) zəncirin başlanması və tənzimləyici zülallarla qarşılıqlı əlaqədən məsuldur. Siqma amilinin əsas funksiyası promotorun tanınmasıdır. DNT-dəki promotor siqma faktoru ilə tanındıqdan sonra RNT polimerazanın koenzim komponenti promotor bölgəsi ilə birləşir və RNT polimerləşməsinə başlayır. Transkripsiya başladıqdan sonra siqma faktoru DNT-dən ayrılır. RNT molekulunun uzadılması β alt bölməsi tərəfindən həyata keçirilir. Zəncirin dayandırılması zamanı “rho faktoru” artıq transkripsiya edilmiş RNT molekulunu buraxır.
Şəkil 01: Prokaryotik RNT Polimeraz
Transkripsiya DNT şablonu ilə müəyyən edilmiş yerlərdə başa çatır. NusA faktoru zəncirin uzadılması, eləcə də kəsilməsi funksiyasında iştirak edir. Antibiotik rifampisin bakterial RNT polimerazanın beta alt bölməsi ilə bağlana bilər. Beləliklə, fermentin bakterial RNT polimerləşməsinə başlamasının qarşısını alır. Streptoliydigin kimi tanınan başqa bir antibiotik bakterial RNT polimerləşməsinin uzanma prosesini maneə törədir. Prokaryotların mRNT-si polikistronikdir, yəni birdən çox sistronun (birdən çox gen) kodonlarını ehtiva edir.
Eukaryotik RNT Polimeraz nədir?
Eukaryotik RNT polimerazaları üç müxtəlif növdür. Onlar müxtəlif gen siniflərini transkripsiya edirlər. Həm də müxtəlif şərtlərdə fəaliyyət göstərir. Başlanğıc və sonlandırıcı amillər (siqma və rho faktorları) prokaryotik RNT polimeraz analoqlarından tamamilə fərqlidir. Üç fərqli RNT polimeraza RNT polimeraza I (rRNT-ni transkripsiya edir), RNT polimeraza II (mRNT-ni transkripsiya edir) və RNT polimeraza III (tRNT-ni transkripsiya edir) adlanır. RNT polimeraza I nüvədə yerləşir və ferment öz fəaliyyəti üçün Mg2+ tələb edir. RNT polimeraza II nukleoplazmadadır və fəaliyyəti üçün ATP lazımdır. RNT polimeraza III də nukleoplazmada yerləşir.
Bu RNT polimerazaları üçün promotorlar fərqlidir. RNT polimeraza Mən DNT-də -45-dən +25-ə qədər bölgə arasında yuxarı axındakı promotorları tanıyıram. RNT polimeraza II DNT-də (TATA qutusu, CAAT qutusu və GC qutusu) kimi -25 ilə -100 bölgə arasında yuxarı axındakı promotorları tanıyır. RNT polimeraza III aşağı axının daxili promotorlarını tanıyır.
Şəkil 02: Eukaryotik RNT Polimeraz
Eukaryotik RNT polimerazaları 500 kDa və ya daha çox olan çox subunitli zülallardan ibarət böyük kompleksdir. TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH, TFIIJ kimi başlanğıc prosesi və uzanma prosesi üçün fərqli transkripsiya faktorlarına malikdirlər. RNT polimerləşməsi Sal qutusunu tanıdıqdan sonra RNT polimeraza I tərəfindən dayandırılır. RNT polimerazası II tərəfindən RNT polimerləşməsinin dayandırılması polyA quyruğu kimi tanınan aşağı axın siqnallarını tanıdıqdan sonra baş verir. Və RNT polimeraza III şablondakı deoksiadenilat qalıqlarını tanıyır və transkripsiyanı dayandırır. Eukaryotik mRNT həmişə monosistronikdir.
Prokaryotik və Eukaryotik RNT Polimeraz arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Hər ikisi RNT sintezində iştirak edir.
- Hər ikisi şablon olaraq DNT-dən istifadə edir.
- Hər ikisi böyük zülallardır.
- Hər ikisinin də transkripsiyanı başlatan siqma faktoru var.
- Hər ikisində RNT polimerləşməsinin mərhələlərini (başlama və uzanma) tənzimləyən transkripsiya faktorları var.
Prokaryotik və Eukaryotik RNT Polimeraza Arasındakı Fərq Nədir?
Prokaryotik vs Eukaryotik RNT Polimeraz |
|
| Prokaryotik RNT polimeraza prokaryotik transkripsiyadan məsul olan tək çox subunit tipli fermentdir. | Eukaryotik RNT polimerazaları eukaryotik transkripsiyanı həyata keçirən müxtəlif növ fermentlərdir. |
| Molekulyar Çəki | |
| Prokaryotik RNT polimerazanın molekulyar çəkisi təxminən 400 KDa-dır. | Eukaryotik RNT polimerazalarının molekulyar çəkisi 500kD-dən çoxdur. |
| Transkripsiya Faktorları | |
| Prokaryotik RNT polimeraza siqma faktoru və nusA kimi transkripsiya faktorlarına malikdir. | Eukaryotik RNT polimerazaları başlanğıc və uzanma üçün müxtəlif transkripsiya faktorlarına malikdir, məsələn; TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH, TFIIJ |
| Xitam Faktoru | |
| Prokaryotik RNT polimerazının dayandırılması üçün "rho faktoru" var. | Eukaryotik RNT polimerazaları sal qutusu, poli A quyruğu, deoksiadenilat qalıqları kimi müxtəlif sonlanma ardıcıllığına malikdir. |
| Promouterlər | |
| Prokaryotik RNT polimeraza TATA qutusu kimi tanınan DNT-nin -10-dan -35-ə qədər bölgəsində promotoru tanıyır. | Eukaryotik RNT polimerazaları müxtəlif promotorları tanıyır1. |
| mRNT-nin təbiəti | |
| Prokaryotik RNT polimeraza polikistronik mRNT istehsal edir. | Eukaryotik RNT polimeraza II monosistronik mRNT istehsal edir. |
1 RNT polimeraza I DNT-də -45-dən +25-ə qədər bölgə arasında yuxarı axındakı promotorları tanıyır. RNT polimeraza II DNT-də (TATA qutusu, CAAT qutusu və GC qutusu) kimi -25 ilə -100 bölgə arasında yuxarı axındakı promotorları tanıyır. RNT polimeraza III aşağı axının daxili promotorlarını tanıyır.
Xülasə – Prokaryotik və Eukaryotik RNT Polimeraz
RNT polimeraza canlı hüceyrədə transkripsiya kimi tanınan RNT polimerləşməsindən məsul olan fermentdir. Şablon kimi DNT istifadə etdiyi üçün RNT polimeraza DNT yönümlü RNT polimeraza kimi də adlandırılır. Transkripsiyada RNT polimeraza normal olaraq ikiqat zəncirli DNT-ni açır ki, bir DNT zəncirindən RNT molekulunun sintezi prosesi üçün şablon kimi istifadə olunsun. RNT polimeraza mRNT, rRNT və tRNT yarada bilər. Transkripsiya faktorları və transkripsiya vasitəçiliyi kompleksi transkripsiya prosesində RNT polimerazına rəhbərlik edir. Transkripsiya üç addımdan ibarətdir; başlanğıc, uzanma və sonlanma. Bunu Prokaryotik və Eukaryotik RNT Polimeraz arasındakı fərq kimi vurğulamaq olar.
Prokaryotik vs Eukaryotik RNT Polimerazın PDF Versiyasını endirin
Bu məqalənin PDF versiyasını yükləyə və sitat qeydinə əsasən onu oflayn məqsədlər üçün istifadə edə bilərsiniz. Zəhmət olmasa PDF versiyasını buradan yükləyin Prokaryotik və Eukaryotik RNT Polimeraz arasındakı fərq
