QTL və GWAS arasındakı əsas fərq təhlildə istifadə olunan ardıcıllığın növündən asılıdır. QTL poligenik irsiyyətlə əlaqəli fenotipik əlamətləri təhlil etmək üçün əlaqə gen lokuslarından istifadə edir, GWAS isə müəyyən vəziyyətin tək nukleotid polimorfizmlərini təhlil etmək üçün bütün genom ardıcıllıqlarından istifadə edir.
QTL xəritələri və GWAS müxtəlif əlamətlər üçün genetik analizlərdə mühüm rol oynayır. Bundan əlavə, onlar naməlum etiologiyalı müxtəlif xəstəlik şərtlərinin təhlilində vacibdir. Bundan əlavə, ardıcıllıq hər iki texnikada əsas rol oynayır. Bu üsullar daha yüksək dəqiqlik və dəqiqlik üçün digər yüksək ötürmə qabiliyyəti üsulları ilə birləşdirilə bilər.
QTL nədir?
QTL Kəmiyyət Xüsusiyyət Lokusu deməkdir. Bu fenotipik əlamətlə əlaqəli DNT bölgəsidir. Ümumiyyətlə, QTL poligenik effektlərə səbəb olur. QTL-lərin paylanması dəyişir və QTL-lərin sayı müəyyən fenotipik əlamətin dəyişmə dərəcəsini göstərir. Bundan əlavə, onlar adətən diskret əlamətləri deyil, əsas davamlı əlamətləri kodlayırlar.
QTL bölgələrinin müəyyən edilməsindən sonra xüsusi QTL sahəsinin ardıcıllığı vacibdir. Bundan əlavə, tədqiqatları və tədqiqatları asanlaşdırmaq üçün ümumi QTL bölgələrinin ardıcıllıq məlumatlarının ardıcıllığı və saxlanması bioinformatikanın iştirakı ilə baş verir. Biz bu texnikaya QTL mapping deyirik. Sonradan verilənlər bazası QTL regionu ardıcıllığı ilə qurulur.
Şəkil 01: QTL Skanı
Bundan əlavə, QTL ardıcıllığının tətbiqləri əsasən ardıcıllığın oxşarlığının təyin oluna biləcəyi BLAST alətinə əsaslanır. Orqanizmlər arasındakı əlaqələri çıxarmaqda vacibdir. Bundan əlavə, müəyyən bir poligenik fenotipin mürəkkəbliyini təyin etmək vacibdir. O, həmçinin müəyyən xüsusiyyətin təkamülünü müəyyən edir.
Hazırda QTL analizi DNT mikroarrayları kimi digər yüksək ötürmə qabiliyyəti üsulları ilə birləşdirilir. Bu, fenotipin ifadə analizində vacibdir. Hazırda elm adamları QTL verilənlər bazasını inkişaf etdirməkdə çox maraqlıdırlar, çünki QTL bölgələri müxtəlif növlərin bir çox mühüm əlamətlərinə cavabdehdir.
GWAS nədir?
GWAS Genom Geniş Assosiasiyası Tədqiqatı deməkdir. O, həmçinin bütün genom assosiasiya tədqiqatlarına aiddir. Bu tədqiqatlar əsasən müşahidə tədqiqatlarına diqqət yetirir. Bu, adətən müəyyən bir əlamətlə əlaqəli olan müxtəlif fərdlərin genetik variantlarını təhlil edir. Üstəlik, bütün genom GWAS analizi üçün vacibdir.
Şəkil 02: GWAS
GWAS müxtəlif xəstəlik şərtləri ilə əlaqəli tək nukleotid polimorfizmlərinin təhlilində mühüm vasitədir. Bu həm də geniş populyasiyada müxtəlif tək nukleotid polimorfizmlərinin müqayisəli tədqiqidir. Bundan əlavə, GWAS-ın tədqiqat nümunəsi çox yüksəkdir; deməli, o, həm də kəsişən kohort tədqiqatının formatını alır.
Bundan başqa, miokard infarktı ilə bağlı və miokard infarktı ilə əlaqəli genlərin təhlili ilə bağlı ilk GWAS tədqiqatı aparıldı. Hazırda GWAS etiologiyası naməlum olan mürəkkəb xəstəliklərin genetik fonunun müəyyən edilməsində mühüm rol oynayır.
QTL və GWAS arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Onlar analiz üçün DNT ardıcıllığı məlumatlarına əsaslanırlar.
- Hər ikisi müxtəlif xarakterlərin genetik mənşəyi ilə əlaqələndirilir.
- Bundan başqa, onlar nəticələri çıxarmaq və şərh etmək üçün bioinformatika alətləri tələb edir.
- Böyük populyasiyalar üçün edilir.
QTL və GWAS arasındakı fərq nədir?
QTL əlaqəli gen lokuslarından istifadə edərək poligenik mirasla əlaqəli fenotipik əlamətləri təhlil edir, GWAS isə bütün genom ardıcıllığından istifadə edərək müəyyən bir vəziyyətin tək nukleotid polimorfizmlərini təhlil edir. Beləliklə, bu QTL və GWAS arasındakı əsas fərqdir. QTL xəritələşdirilməsi GWAS ilə müqayisədə nisbətən daha az mürəkkəb texnikadır, çünki bütün genom ardıcıllığını tələb edir.
Aşağıdakı infoqrafika QTL və GWAS arasındakı fərqi cədvəl şəklində ümumiləşdirir.
Xülasə – QTL vs GWAS
QTL xəritəsi və GWAS müxtəlif fenotipik əlamətlərin genetik fonunun müəyyən edilməsində böyük rol oynayır. Onlar həmçinin müxtəlif xəstəliklərin genetik fonunu təhlil etməyə kömək edir. QTL xəritələşdirilməsi davamlı əlamətlərə cavabdeh olan əlaqə genlərinin xəritəsini tərtib edir və həmçinin poligenik miras genlərinin xəritələşdirilməsini əhatə edir. GWAS, digər tərəfdən, tək nukleotid polimorfizmləri üçün bütün genomun təhlili ilə baş verir. Bundan əlavə, bu, daha böyük əhali arasında baş verir. Beləliklə, bu QTL və GWAS arasındakı fərqin xülasəsidir.
