Əsas Fərq – Yuxarı və Aşağı Axın DNT
Yuxarı və aşağı axın DNT arasındakı fərqi başa düşmək üçün DNT-nin tərkibi və strukturu haqqında ümumi biliyə sahib olmaq vacibdir. DNT polinükleotid zəncirlərindən ibarətdir. Nukleotidlər polinükleotid zəncirlərini yaradan tikinti bloklarıdır və hər bir nukleotid üç komponentdən ibarətdir: beş karbonlu şəkər, azotlu əsas və fosfat qrupu. Bir fosfat qrupu və bir OH qrupu, bir nukleotiddəki şəkər molekulunun müvafiq olaraq 5' mövqedəki karbonuna və 3' mövqedəki karbonuna bağlanır. Nukleotidlər bir nukleotidin 5' fosfat qrupu və bitişik nukleotidin 3' OH qrupu arasında əmələ gələn fosfodiester bağları ilə birləşir. Əgər polinükleotid zəncirində sərbəst 5' fosfat qrupu varsa, o, 5' uc kimi təyin olunur; pulsuz 3' OH qrupu varsa, o, 3' uc kimi təyin olunur. Buna görə də, DNT zəncirlərinin polinükleotid zəncirlərinin son mövqelərinə görə adətən 5' və 3' ucları olur. DNT də ikiqat zəncirli formada mövcuddur. İki ip bir-birinə antiparaleldir. Beləliklə, DNT-də 5'-dən 3'-ə qədər və 3'-dən 5'-ə qədər uzanan iki zəncir var. Upstream və downstream DNT 5'-dən 3' mRNA zəncirinin transkripsiyası və sintezinə istinad edilir. DNT transkripsiyanın başlanğıc yerindən kodlaşdırma zəncirinin 5 ucuna doğru nəzərə alınarsa, bu, yuxarı axın DNT kimi tanınır. DNT transkripsiyanın başlanğıc yerindən kodlaşdırma zəncirindən 3' ucuna doğru nəzərə alınarsa, aşağı axın DNT kimi tanınır. Bu, yuxarı və aşağı axın DNT arasındakı əsas fərqdir.
Yuxarı DNT nədir?
Gen orqanizmin DNT-sində yerləşən struktur və funksional vahid irsiyyətdir. Bir zülal yaratmaq üçün təlimatlarla saxlanılır. Genin DNT molekulunun xüsusi bölgəsi var. Tələb olunduqda, bir mRNT zəncirinin sintezi ilə transkripsiya edir və bir proteinə çevrilir. Normalda genin kodlama zolağı 5'dən 3' istiqamətə qədər uzanır. Transkripsiya edildikdə, eyni istiqamətdə 5'-dən 3'ə qədər bir mRNA zəncirini istehsal edir. Transkripsiya zamanı 3'-dən 5'ə qədər antisens zəncir şablon zəncir kimi xidmət edir və mRNT sintezini başlatır. Gendə bir transkripsiya başlanğıc yeri var. Transkripsiyanın başlanğıc sahəsinə istinad edərək, kodlaşdırma zəncirinin 5' ucuna doğru olan DNT bölgəsi yuxarı axın DNT kimi tanınır. Genin promotoru adətən DNT-nin yuxarı hissəsində yerləşir. Eukaryotik genlərdə genin yuxarı hissəsində TATA qutuları, promotor proksimal elementləri və gücləndiricilər var. Genin yuxarı bölgəsi mənfi ədədlərlə ifadə edilir. Transkripsiya üçün genin yuxarı axını DNT-si çox vacibdir.
Downstream DNT nədir?
Transkripsiyanın başlama yeri genin +1 nöqtəsi kimi tanınır. +1 nöqtədən kodlaşdırma zəncirinin 3' ucuna qədər olan DNT bölgəsi aşağı axın DNT kimi tanınır. Başqa sözlə, genin aşağı axını transkripsiyanın başlanğıc yerindən şablon zəncirinin 5' ucuna doğrudur. Buna görə də, bir gen bölgəsinin aşağı axını DNT-sinə transkripsiya vahidi və terminator ardıcıllığı kimi digər ardıcıllıqlar daxildir. Promotor bir genin aşağı axını ardıcıllığına təsir göstərə bilər. Genin aşağı axın hissəsi müsbət rəqəmlərlə ifadə edilir. Genin aşağı axını DNT-si protein məhsulunu verən faktiki bölgədir.
Şəkil 01: Yuxarı və Aşağı DNT
Yuxarı və Aşağı DNT DNT arasındakı fərq nədir?
Yuxarı və Aşağı DNT |
|
| Transkripsiyanın başlanğıc yerindən kodlaşdırma ardıcıllığının 5' sonuna doğru olan DNT bölgəsi yuxarı axın DNT kimi tanınır. | Transkripsiyanın başlanğıc yerindən kodlaşdırma zəncirinin 3' ucuna doğru DNT bölgəsi aşağı axın DNT kimi tanınır. |
| Elementlər | |
| Promotorlar və gücləndiricilər yuxarı axın DNT-də yerləşir | Transkripsiya vahidi və terminator ardıcıllıqları aşağı axın DNT-də yerləşir. |
| Nömrələmə | |
| Yuxarı bölgədəki nukleotidlər mənfi rəqəmlərlə ifadə edilir | Nükleotidlər müsbət rəqəmlərlə ifadə edilir. |
| Funksiya | |
| Bu bölgə transkripsiyanı tənzimləmək və başlamaq üçün lazım olan elementləri ehtiva edir | Bu bölgədə zülal istehsal etmək və transkripsiyanı dayandırmaq təlimatı var |
Xülasə – Yuxarı və Aşağı Axın DNT
RNT zəncirinin yuxarı və aşağı axını müəyyən etmək asandır. İstinad sahəsinə gəldikdə, RNT zəncirinin 5' ucuna doğru olan bölgə yuxarı RNT, 3' ucuna doğru olan bölgə isə aşağı axın RNT kimi tanınır. Bununla belə, DNT-də hər iki istiqamətdə 5'dən 3'ə və 3'dən 5'ə qədər uzanan iki zəncir var. Beləliklə, yuxarı və aşağı axın DNT arasındakı fərq mürəkkəbdir. Buna görə də, bir genin transkripsiyasına istinad edərək fərqləndirilir. Transkripsiya başlanğıc yerindən hiss zəncirinin 5-ci ucuna doğru DNT bölgəsi yuxarı axın DNT kimi tanınır, transkripsiya başlanğıc yerindən isə hiss zəncirinin 3' ucuna doğru aşağı axın DNT kimi tanınır. Bu, DNT-nin yuxarı və aşağı axını arasındakı fərqdir.
