Ksilen sianol və bromofenol mavisi arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, 1% agaroza geldə ksilen siyanolu daha yavaş, bromofenol mavisi isə daha sürətli miqrasiya edir.
Ksilen sianol və bromofenol mavisi agaroz gel elektroforezi və poliakrilamid gel elektroforezi prosesinin monitorinqində istifadə edilə bilən rəng markerləri kimi vacibdir.
Xylene Cyanol nədir?
Ksilen siyanol elektroforetik rəng markeri və ya izləmə boyasıdır. Agaroz gel elektroforezi və poliakrilamid gel elektroforezi prosesinin monitorinqində faydalıdır. Bu maddə nümunə ilə qarışdırıldıqda, bu maddənin konsentrasiyası adətən təxminən 0 olur.005%-dən 0,03%-ə qədər. Ksilen siyanolu üçün istifadə edə biləcəyimiz bəzi sinonimlərə Acid Blue 147, ksilen siyanolu, ksilen siyanol FF, ksilen siyanolu FF və s. daxildir.
Bu birləşmənin kimyəvi formulu C25H27N2NaO 6S2 Ksilol sianolun molyar kütləsi 538,61 q/mol-dur. Bu maddə 1% agaroz gellərində təxminən 4-5 kilobaza cütü DNT fraqmentləri sürətlə miqrasiya edə bilər. Ancaq bu, istifadə etdiyimiz buferdən asılıdır. Tipik olaraq, 6% poliakrilamid gel üzərində ksilen siyanolu təxminən 140 əsas cüt DNT fraqmenti sürətlə miqrasiya edə bilər. Digər tərəfdən, o, 20% denaturasiya edən poliakrilamid gel elektroforezində 25 əsas oliqonukleotid nisbətində miqrasiya edə bilər.
Ksilen sianolun hidrogen bağı donorlarının sayı 2m, hidrogen bağı qəbul edənlərin sayı isə 8-dir. Bu birləşmənin fırlanan əlaqə sayı 7 kimi verilə bilər. Ksilen siyanolu mürəkkəbliyi 1120 dərəcə kimi təsvir edilə bilər. Onun müəyyən edilmiş əlaqə stereomərkəzi 1 sayı var.
Bromofenol Mavi nədir?
Bromofenol mavisi elektroforetik rəng markeri və boya kimi faydalı olan faydalı pH göstəricisidir. Onun kimyəvi adı 3', 3", 5', 5" tetrabromofenolsulfonftalein, BPB. Bu birləşmənin kimyəvi formulu C19H10Br4O5-dir. S. Bu birləşmənin molyar kütləsi 669,96 q/mol təşkil edir. Qoxusuzdur və sıxlığı 2,2 q/mL olaraq verilə bilər. Onun ərimə temperaturu 273 dərəcə Selsi, qaynama temperaturu isə 279 dərəcədir. Biz onu yavaş-yavaş fenolsulfonftaleinin buzlu sirkə turşusunda isti məhluluna artıq brom əlavə etməklə hazırlaya bilərik.
Bromofenol mavisi pH 3.0 ilə 4.6 aralığında turşu-əsas göstəricisi kimi faydalıdır. PH 3.0-da sarıdan pH 4.6-a qədər dəyişə bilir. Üstəlik, bu geri çevrilə bilən bir reaksiyadır. Struktur olaraq, bromofenol mavisi fenolftaleinə bənzəyir.
Bundan başqa, biz ondan agaroz gel elektroforezi və poliakrilamid gel elektroforezi prosesini izləmək üçün rəng markeri kimi istifadə edə bilərik. Bu maddə orta pH-da mənfi yük daşıya bilər, burada bir geldə DNT və ya zülal ilə eyni istiqamətdə miqrasiya edə bilər. Miqrasiya dərəcəsi gel sıxlığına və tampon tərkibinə görə dəyişə bilər. Bununla belə, 1 dəfə TAE buferində və ya TBE buferində tipik 1% agaroz gelində bu maddə təxminən 300 əsas cütdən ibarət DNT fraqmenti ilə eyni sürətlə miqrasiya edir.
Xylene Cyanol və Bromophenol Blue Arasındakı Fərq Nədir?
Ksilen sianol və bromofenol mavisi vacib rəng markerləridir. Ksilen siyanol və bromofenol mavisi arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, 1% agaroza geldə ksilen siyanolu daha yavaş, bromofenol mavisi isə daha sürətli miqrasiya edir.
Aşağıda yan-yana müqayisə üçün ksilen sianol və bromofenol mavisi arasındakı fərqin xülasəsi cədvəl şəklində verilmişdir.
Xülasə – Xylene Cyanol vs Bromophenol Blue
Ksilen sianol və bromofenol mavisi agaroz gel elektroforezi və poliakrilamid gel elektroforezi prosesinin monitorinqində istifadə olunan rəng markerləri kimi vacibdir. Ksilen sianol və bromofenol mavisi arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, 1% agaroza geldə ksilen siyanolu daha yavaş, bromofenol mavisi isə daha sürətli miqrasiya edir.
