Shine Dalgarno və Kozak sekansı arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, Shine Dalgarno sekansı bakterial və arxaeal xəbərçi RNT-də ribosomal bağlanma yeridir, Kozak sekansı isə əksər eukaryotik messenger RNT-lərdə zülal tərcüməsinin başlanğıc yeridir.
Shine Dalgarno və Kozak ardıcıllığı tərcümənin başlanması üçün çox vacib olan iki konsensus ardıcıllığıdır. Molekulyar biologiyada tərcümə sitoplazmadakı ribosomların transkripsiya prosesindən sonra zülalları sintez etdiyi prosesdir. Tərcümə zamanı bir mRNT (messencer RNT) nüvədən kənarda xüsusi bir amin turşusu zəncirini yaratmaq üçün ribosomda deşifrə edilir. Tipik olaraq, bir ribosom tamamlayıcı tRNT antikodon ardıcıllığının mRNT kodonlarına bağlanmasını asanlaşdırmaqla dekodlaşdırma prosesini induksiya edir. Tərcümə üç mərhələdə aparılır: başlanğıc, uzanma və sonlanma.
Shine Dalgarno Sequence nədir?
Shine Dalgarno sekansı bakterial və arxeal messenger RNT-də ribosomal bağlanma yeridir. O, ümumiyyətlə AUG başlanğıc kodonundan yuxarı 8 baza ətrafında yerləşir. Bu RNT ardıcıllığı ribosomu bir mRNA başlanğıc kodonu ilə uyğunlaşdırmaqla ribosomları messencer RNT-yə cəlb etməyə kömək edir. Beləliklə, protein sintezini başlayır. İşə alındıqdan sonra tRNT mRNT kodonlarının diktə etdiyi ardıcıllıqla amin turşularını əlavə edə bilər. Bu xüsusi ardıcıllıq bakteriyalarda yaygındır, lakin arxeylərdə daha nadirdir. Üstəlik, xloroplast və mitoxondrial transkriptlərdə də mövcuddur. Shine Dalgarno ardıcıllığı ilk dəfə avstraliyalı alimlər Con Şayn və Lin Dalqarno tərəfindən təklif edilmişdir. Altı əsas konsensus ardıcıllığı AGGAGG-dir. Məsələn, Escherichia coli-də ardıcıllıq AGGAGGU-dur.
Şəkil 01: Shine Dalgarno Sequence
Başlama yerinin seçimi (AUG) ribosomun 30S alt bölməsi və mRNT şablonu arasındakı qarşılıqlı əlaqədən asılıdır. 30S alt bölməsinin 16srRNA komponentindəki pirimidinlə zəngin bölgə mRNT-də AUG başlanğıc kodonunun yuxarı axınında Shine Dalgarno ardıcıllığı kimi tanınan purinlə zəngin bölgəyə bağlanır. Bundan əlavə, başlanğıc kompleksinin formalaşması zamanı bu tamamlayıcı nukleotid ardıcıllıqları cüt zəncirli RNT strukturu meydana gətirir. Bu, mRNT-nin ribosoma bağlanmasını asanlaşdırır ki, başlanğıc kodonu ribosomun P yerində yerləşdirilsin.
Kozak Sequence nədir?
Kozak ardıcıllığı əksər eukaryotik mRNT-də zülal tərcüməsinin başlama yeridir. Bu ardıcıllığa Kozak konsensus ardıcıllığı da deyilir. Kozak ardıcıllığı eukariotlarda tərcümənin başlanması üçün optimal ardıcıllıqdır. Bu ardıcıllıq zülal tənzimlənməsinin tərkib hissəsidir. Ümumi hüceyrə sağlamlığı üçün də çox vacibdir. O, ribosomların yığılması və tərcümənin başlanmasına vasitəçilik edərək, genetik mesajlardan düzgün protein tərcüməsinə kömək edir.
Şəkil 02: Kozak ardıcıllığı
Bu ardıcıllıq onu kəşf edən alim Merilin Kozakın şərəfinə adlandırılmışdır. O, bunu DNT genomik ardıcıllığının ətraflı təhlili vasitəsilə kəşf edib. Kozak ardıcıllığı 5' (gcc) gccRccAUGG-3'dür. Böyük hərflər qorunan əsasları, kiçik hərflər isə ümumi dəyişən əsasları göstərir. R həmişə bu yerdə yerləşən purin (adenin və ya guanin) göstərir.
Shine Dalgarno və Kozak Sequence arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Shine Dalgarno və Kozak ardıcıllığı tərcümənin başlanmasında çox vacib olan iki konsensus ardıcıllığıdır.
- Hər ikisi RNT ardıcıllığıdır.
- Ribosomun kiçik alt bölməsi hər iki ardıcıllıqla birləşir.
- Hər iki ardıcıllıq ribosomların düzgün yığılmasına və tərcümənin başlanmasına vasitəçilik edir.
- Onlar zülal tənzimlənməsinin və ümumi hüceyrə sağlamlığının ayrılmaz aspektləridir.
Shine Dalgarno və Kozak Sequence Arasındakı Fərq Nədir?
Shine Dalgarno sekansı bakterial və arxaeal xəbərçi RNT-də tapılan ribosomal bağlanma yeridir, Kozak sekansı isə əksər eukaryotik messenger RNT-də tapılan zülal tərcüməsinin başlanğıc yeridir. Beləliklə, Shine Dalgarno və Kozak ardıcıllığı arasındakı əsas fərq budur. Bundan əlavə, Shine Dalgarno ardıcıllığı 5'AGGAGGU3', Kozak ardıcıllığı isə 5' (gcc) gccRccAUGG-3'dür.
Aşağıdakı infoqrafikada Shine Dalgarno və Kozak ardıcıllığı arasındakı fərqlər yan-yana müqayisə üçün cədvəl şəklində verilmişdir.
Xülasə – Shine Dalgarno vs Kozak Sequence
Shine Dalgarno və Kozak ardıcıllığı ribosomların yığılması və tərcümənin başlanması üçün çox vacib olan iki konsensus RNT ardıcıllığıdır. Shine Dalgarno sekansı bakterial və arxeal messenger RNT-də ribosomal bağlanma yeridir, Kozak sekansı isə əksər eukaryotik messencer RNT-də zülal tərcüməsinin başlama yeridir. Beləliklə, bu, Shine Dalgarno və Kozak ardıcıllığı arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
