DNT və RNT zondları arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, DNT zondları hədəf nukleotid ardıcıllıqlarını tamamlayan DNT fraqmentləridir, RNT zondları isə hədəf ardıcıllıqların tamamlayıcı nuklein turşusu ardıcıllığı olan tək zəncirli RNT uzantılarıdır.
Sond radioaktiv və ya radioaktiv olmayan molekullarla işarələnə bilən DNT və ya RNT-nin süni şəkildə sintez edilmiş qısa ardıcıllığıdır. Uzunluğu 100 ilə 1000 əsas ola bilər. Zondlar zond ardıcıllığını tamamlayan hədəf nukleotid ardıcıllıqlarını aşkar etmək üçün faydalıdır. Əlavə edildikdən sonra zondlar tamamlayıcı ardıcıllıqla və ya hədəf ardıcıllıqla hibridləşir və radioaktivlik daşıdığı üçün hədəf ardıcıllıqlarını müəyyən etmək üçün onu görünən edir. Zondlar genetik xəstəliklərin aşkarlanması, virusologiya, məhkəmə patologiyası, atalıq testi, DNT barmaq izi, RFLP, molekulyar sitogenetik, in situ hibridləşdirmə və s. kimi bir çox mikrob və molekulyar sahələrdə vacib molekulyar alətlərdir.
DNT Probları nədir?
DNT zondları DNT-nin tək zəncirli uzantılarıdır. Onlar hibridləşmə yolu ilə tamamlayıcı nuklein turşusu ardıcıllıqlarının (hədəf ardıcıllıqlarının) mövcudluğunu aşkar etmək üçün istifadə edilə bilər. Bir DNT zondu tamamlayıcı ardıcıllığı ilə hibridləşdikdən sonra ikiqat zəncirli hibrid əmələ gətirir. Onları aşkar etmək üçün DNT zondları ümumiyyətlə radioizotoplar, biotin, epitoplar və ya flüoroforlarla etiketlənir. Biotin ilə etiketlənmiş DNT zondları bir sıra enzimatik və kimyəvi üsullarla streptavidinlə işarələnmiş qələvi fosfatazla aşkar edilə bilər.
Şəkil 01: DNT Probu
DNT zondunun nukleotid ardıcıllığı məlumdur. Onlar 100-dən 1000-ə qədər əsas cüt uzunluğu olan qısa ardıcıllıqlardır. Uzun DNT probları rekombinant DNT texnologiyası ilə yaradıla bilər. Onlar həmçinin PCR və klonlama ilə yaradıla bilər. Klinik mikrobiologiya laboratoriyalarında yoluxucu xəstəliklərin sürətli diaqnostikası üçün DNT zondları asanlıqla mövcuddur.
RNT Probları nədir?
RNT zondları RNT-nin tək zəncirli uzantılarıdır. Onlar nümunədəki hədəf ardıcıllıqları tamamlayan ardıcıllıqlardır. Onlar adətən DNT-nin in vitro transkripsiyası ilə SP6, T7 və ya T3 bakteriofaqlarından olan RNT polimerazları ilə sintez olunurlar. Uzun RNT zondları xəttiləşdirilmiş plazmid DNT-dən in vitro transkripsiya ilə yaradıla bilər. Ümumiyyətlə, RNT zondları DNT zondlarına nisbətən onların tamamlayıcı ardıcıllığına güclü və daha sıx bağlanır. DNT zondları kimi, RNT zondları da transkripsiya edilərkən etiketlənə bilər.
DNT və RNT zondları arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Həm DNT, həm də RNT zondları təkzəncirli nukleotid ardıcıllığıdır.
- Hər ikisi süni şəkildə hazırlanmış və sintez edilmişdir.
- Bundan başqa, onlar radioizotoplar, epitoplar, biotin və ya flüoroforlarla etiketlənə bilər.
- Onların xüsusi DNT və ya RNT hədəf ardıcıllığına güclü yaxınlığı var.
- Onlar hədəf nuklein turşusu ardıcıllığının aşkarlanması üçün müxtəlif ləkələmə və in situ hibridləşdirmə üsullarında istifadə olunur.
- Hər iki növ zond bir-birini tamamlayan ardıcıllıqla hibridləşdirilə bilər.
- Onlardan həmçinin mikroorqanizmlərin identifikasiyası və yoluxucu, irsi və digər xəstəliklərin diaqnostikasında istifadə olunur.
DNT və RNT Probları Arasındakı Fərq Nədir?
DNT zondu hədəf ardıcıllığını tamamlayan qısa bir DNT hissəsidir. Digər tərəfdən, RNT zondu hədəf ardıcıllığını tamamlayan qısa bir zəncirli RNT uzantısıdır. Beləliklə, bu DNT və RNT zondları arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, DNT zondlarında A, T, C və G, RNT zondlarında isə A, U, C və G var.
Bundan başqa, DNT və RNT zondları arasındakı digər fərq onların termodinamik sabitliyidir. RNT zondları DNT zondları ilə müqayisədə daha böyük termodinamik sabitlik nümayiş etdirir.
Aşağıda infoqrafik cədvəldə DNT və RNT zondları arasındakı mühüm fərqlər göstərilir.
Xülasə – DNT vs RNT Probları
Zond molekulyar hibridləşmə yolu ilə DNT və ya RNT nümunəsində xüsusi ardıcıllığın mövcudluğunu aşkar etmək üçün istifadə edilən kiçik DNT və ya RNT fraqmentidir. DNT zondları qısa tək zəncirli DNT fraqmentləri, RNT zondları isə qısa tək zəncirli RNT ardıcıllığıdır. Onlar məlum ardıcıllıqlardır. Termodinamik sabitlik RNT zondlarında DNT zondlarından daha böyükdür. RNT zondları, DNT zondlarının bağlanmasından fərqli olaraq, tamamlayıcı ardıcıllıqla sıx bağlanır. Beləliklə, bu, DNT və RNT zondları arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
