Cosmid və Phagemid arasındakı əsas fərq onun ehtiva etdiyi ardıcıllığın növündədir. Kosmiddə cos sahəsi və plazmid var. Beləliklə, o, hibrid vektordur, Fagemid isə F1 faqının təkrarlanmasının F1 mənşəyini ehtiva edən plazmiddir.
Kosmidlər və Fagemidlər klonlaşdırma məqsədləri üçün, xüsusilə DNT-nin daha böyük fraqmentlərini klonlaşdırmaq üçün istifadə olunur. Bunlar xüsusilə müxtəlif zülalların istehsalına cavabdeh olan genlərin klonlanmasında geniş istifadə olunur. Kosmidlər və Fagemidlər ya plazmidlər kimi tək-tək təkrarlanır, ya da viral hissəciklərə qablaşdırılır və sonra təkrarlanır.
Kosmid nədir?
Hibrid plazmid kimi istinad edilən Kosmid, Lambda faq hissəciklərindən və plazmiddən çıxarılan cos yerlərindən ibarətdir. Bu cos yerləri 200 baza cütü olan uzun DNT fraqmentləridir. Beləliklə, plazmidin viral DNT-yə uyğunlaşmasına imkan verən yapışqan və ya yapışqan ucları var. Buna görə də, cos saytları DNT-nin qablaşdırılması üçün çox vacibdir.
Üç sayt var;
- cosN saytı – terminaz fəaliyyəti ilə DNT zəncirinin ləqəblənməsində iştirak edir
- cosB saytı – terminalın saxlanması ilə məşğuldur.
- cosQ saytı – DNT-nin DNazlar tərəfindən deqradasiyasının qarşısının alınmasında iştirak edir.
Şəkil 01: Kosmid
Həmçinin, Kosmidlər uyğun replikasiya mənşəyindən istifadə edərək ya tək zəncirli DNT-ni, ya da iki zəncirli DNT-ni təkrarlaya bilər. Kosmidlər adətən transformantların seçilməsi üçün markerlər kimi antibiotik müqavimət genlərini ehtiva edir. Beləliklə, vektor kimi kosmiddən istifadə klonlaşdırmanı asanlaşdıra bilər və vektorun məhdudlaşdırıcı ferment həzmi daha sonra bu fraqmentləri çıxara bilər.
Fagemid (Fazmid) nədir?
Phazmid kimi də adlandırılan Phagemid də hibrid vektor növüdür. Fagemid replikasiyanın f1 mənşəyi olaraq adlandırılan xüsusi təkrarlanma mənşəyini ehtiva edir. f1 faqından replikasiya çıxarışlarının f1 mənşəyi.
Fagemid həm təkzəncirli, həm də ikizəncirli DNT-ni təkrarlaya bilir. Replikasiya ya müstəqil replikasiya zamanı plazmid kimi baş verə bilər, ya da faj hissəciklərinə qablaşdırıla və nəhayət bakteriya sahibi E coli-yə yoluxa bilər. E coli hüceyrələrini yoluxdurarkən, f1 faqı pilusun olmasını tələb edir. Beləliklə, cinsiyyət pilisi Phagemidlərin in vitro qablaşdırılması zamanı vacibdir.
Kosmid və Fagemid arasındakı oxşarlıqlar nələrdir?
- Həm Cosmid, həm də Phagemid rekombinant DNT texnologiyasında istifadə edilən klonlama vektorlarıdır.
- Cosmid və Phagemid tək və ikizəncirli DNT-ni təkrarlaya bilər.
- Hər ikisi plazmidlərə bənzər müstəqil replikasiyadan keçə bilər.
- Cosmid və Phagemid in vitro qablaşdırmadan keçə və bakteriya hüceyrələrinə yoluxa bilər.
- Həm Cosmid, həm də Phagemid klonlama üçün uyğun replikasiya mənşəli tələb edir.
Kosmid və Fagemid Arasındakı Fərq Nədir?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Kosmid cos saytı və plazmiddən ibarət hibrid vektordur. | Fagemid, F1 faqının təkrarlanmasının F1 mənşəyini ehtiva edən plazmiddir. |
| Cos Saytlarının Varlığı | |
| Cos saytları kosmiddə mövcuddur və in vitro qablaşdırma üçün zəruridir. | Çünki fagemiddə saytlar yoxdur. |
| Replikasiyanın F1 Mənşəyinin Varlığı | |
| Kosmiddə təkrarlanmanın fi mənşəyi ola bilər və ya olmaya bilər. | Replikasiyanın F1 mənşəyi fagemiddə mövcuddur. |
| Antibiotiklərə davamlı genlərin olması | |
| Transformant olmayanlardan transformantları müəyyən etmək üçün kosmidlərdə antibiotikə davamlı genlər mövcuddur. | Fagemidlərdə antibiotikə davamlı genlər yoxdur. |
| In Vitro Qablaşdırma Tələbləri | |
| Cos sayt tələb edir. | Cinsi əlaqə tələb edir. |
Xülasə – Cosmid vs Phagemid
Cosmid və Phagemid rekombinant DNT texnologiyasında istifadə olunan klonlama vektorlarıdır. Kosmidlər cos saytları kimi tanınan xüsusi yapışqan ucları ehtiva edən hibrid vektorlardır. in vitro qablaşdırma bu saytları tələb edir. Fagemidlər f1 faqından çıxarılan f1 replikasiya mənşəli plazmidlərdir. Həm kosmid, həm də fagemid müstəqil replikasiyaya və ya bakterial hüceyrələrə in vitro qablaşdırmaya məruz qala bilər. Bunlar kosmid və fagemid arasındakı mühüm fərqlərdir.
