Əsas Fərq – Kapilyar Elektroforez vs Gel Elektroforez
Elektroforez hissəcik yükü, hissəcik ölçüsü və hissəcik formasına əsaslanaraq biomolekulları ayırmaq üçün istifadə edilən bir texnikadır. Elektroforetik hərəkətlilik kimi tanınan molekulun miqrasiyası istifadə olunan polimer/gelin növündən, onun məsamə ölçüsündən, təmin edilən gərginlikdən, işləmə müddətindən və səthin həcm nisbətindən asılıdır. İstifadə olunan biomolekulun növündən asılı olaraq müxtəlif elektroforez üsulları mövcuddur. İxtira edilən elektroforezin ilk növü kağız elektroforezi idi, burada biomolekulların ayrılması üçün vasitə kimi nitroselüloz kağızı istifadə edilmişdir. Biomolekulları ayırmaq üçün müxtəlif məsamə ölçülü gellərin istifadə edildiyi gel elektroforez prinsipi sonradan icad edilmişdir. Gel elektroforez texnikası texnikanın dəqiqliyini artırmaq üçün daha da dəyişdirilmişdir və belə modifikasiyalardan biri kapilyar elektroforezdir. Kapilyar elektroforez ilə gel elektroforezi arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, gel elektroforez standart məsamə ölçüsündə polimer geldən istifadə edərək şaquli və ya üfüqi müstəvidə, kapilyar elektroforez isə polimer maye və ya gel ilə kapilyar boruda aparılır.
Gel Elektroforez nədir?
Gel elektroforezi yükü, ölçüsü və forması əsasında əsasən nuklein turşularını, zülalları və ya amin turşularını ayırmaq üçün istifadə edilən texnikadır. Bu texnika ayırma mühiti kimi polimer maddə olan fiziki geldən istifadə edir. Ən çox istifadə olunan gellər agaroza (nuklein turşularının ayrılması üçün) və Poliakrilamiddir (zülalların ayrılması üçün). Gel elektroforetik aparatda gel hazırlamaq üçün gel tökmə qabı, quyuların hazırlanması üçün tökmə daraqları, bufer çəni, elektrodlar – müsbət (anod) və mənfi (katod) və gərginlik təchizatı bloku var. DNT və ya RNT kimi mənfi yüklü molekullar katoddan anoda, müsbət yüklü molekullar isə əksinə hərəkət edir. Gel hazırlanması tələbata uyğun olaraq aparılır. Yüksək ayırdetmə və ya molekulların ayrılması tələb olunarsa, daha az məsamə ölçüsü olan yüksək konsentrasiyalı gel hazırlanmalıdır. Gel matrisdə ayrılan molekullar boyanma texnikasından sonra müşahidə edilir. Ayrılmış molekullar gel matrisində zolaqlar kimi görünür.
Şəkil 01: Gel Elektroforez
Gel elektroforezi xüsusi DNT/RNT fraqmentinin və ya zülalın mövcudluğunu müəyyən etmək üçün DNT barmaq izi kimi molekulyar diaqnostikada istifadə olunur. Gel elektroforezi həm də çıxarılan biomolekul nümunəsinin təmizliyini müəyyən edir. Gel elektroforezi daxiletmə və hibridləşmə üçün ilkin addım və ardıcıllıqdan sonra təsdiqedici analiz kimi həyata keçirilir.
Kapilyar elektroforez nədir?
Kapilyar elektroforez, yükə, molekulun ölçüsünə əsasən eyni ayırma prinsipindən istifadə edən, lakin gel maddəsi və ya maye polimer ilə kapilyar boruda həyata keçirilən gel elektroforezinin modifikasiyasıdır. Kapilyarlar əridilmiş silisiumdan hazırlanır və hər bir kapilyar borunun daxili diametri 50-100μm və uzunluğu 25-100 sm-dir. Nümunələr polimer materialı olan kapilyar boruya enjekte edilir və adi gel elektroforezindən daha sürətlə ayrılır. Kapilyar sistem nümunəni istənilən çirklənmədən qoruyan izolyator gödəkçəsi içərisində yaxşı qorunur. Kapilyarlar hidroksietil selüloz kimi maye polimerlərlə və ya poliakrilamid kimi yüksək ayırdedici gellərlə doldurula bilər. Kapilyar elektroforez daha böyük həlli təmin edir; deməli, ayırma daha doğrudur. Kapilyar elektroforez spektrofotometrik analiz vasitəsilə avtomatlaşdırılmış detektor sistemindən istifadə edir. Bu, daha yüksək səth sahəsi ilə həcm nisbəti ilə bağlıdır.
Şəkil 02: Kapilyar Elektroforez
Kapilyar elektroforez daha yüksək dəqiqliyin tələb olunduğu məhkəmə tibb kimi hallarda istifadə olunur və bahalı texnika olduğundan ümumiyyətlə istifadə edilmir.
Kapilyar elektroforez və gel elektroforezi arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Hər iki texnikada molekulların ayrılması molekulun yükü və ölçüsünə əsaslanır.
- Hər iki üsul həm nuklein turşularını, həm də zülalları ayırmaq üçün istifadə edilə bilər.
- Hər iki texnikanın nümunə həcmi eynidir.
- Hər iki texnika ayırmağı asanlaşdırmaq üçün buferdən istifadə edir.
Kapilyar Elektroforez və Gel Elektroforez Arasındakı Fərq Nədir?
Kapilyar Elektroforez vs Gel Elektroforez |
|
| Kapilyar elektroforez maye və ya gel polimer mühitindən istifadə edərək kapilyar boruda biomolekulları ayıran texnikadır. | Gel elektroforezi polimer gel mühitindən istifadə edərək şaquli və ya üfüqi müstəvidə biomolekulları ayıran bir texnikadır. |
| Ayrılıq | |
| Kapilyar elektroforezdə ayırma kapilyar boru içərisində aparılır. | Gel elektroforezində ayırma şaquli və ya üfüqi müstəvidə aparılır. |
| Ayrılıq Ortası | |
| Hidroksietilselüloza kimi maye polimerlər kapilyar elektroforezdə istifadə olunur. | Gellər, ya agaroz, ya da poliakrilamid, gel elektroforezində mühit kimi istifadə olunur. |
| Çapraz Bağlantı | |
| Yüksək ayırdetmə kapilyar elektroforezdən əldə edilə bilər. | Gel elektroforezində ayırdetmə aşağıdır. |
| Səth Sahəsi Həcm Nisbi | |
| Kapilyar elektroforezdə səthin həcminə nisbəti yüksəkdir. | Gel elektroforezində səthin həcminə nisbəti aşağıdır. |
| Aşkarlama Texnikası | |
| Aşkar kapilyar elektroforezdə spektrofotometrik avtomatlaşdırılmış detektorlar vasitəsilə həyata keçirilir. | UV transilluminator vasitəsilə boyanma və müşahidə gel elektroforezində aşkarlama üsulları kimi həyata keçirilir. |
Xülasə – Kapilyar Elektroforez vs Gel Elektroforez
Molekulyar diaqnostika elm aləmində böyük rol oynayır. DNT, RNT və Zülalların identifikasiyası və təmizlənməsi diaqnostik prosedurların kritik addımlarıdır. Elektroforez həm gel elektroforezində, həm də çox inkişaf etmiş kapilyar gel elektroforezində biomolekulları ayıran və müəyyən edən bir texnikadır. Gel elektroforezi standart məsamə ölçüsündə bir polimer geldən istifadə edərək şaquli və ya üfüqi müstəvidə aparılır, kapilyar elektroforez isə polimer maye və ya gel ilə kapilyar boruda aparılır. Bu kapilyar elektroforez və gel elektroforezi arasındakı fərqdir. Elektroforez texnikası başa çatdıqdan sonra, hibridləşdirmə və ya barmaq izi kimi üsullarla daha yüksək səviyyəli məlumat əldə etmək üçün biomolekullar daha da işlənir.
Kapilyar Elektroforez vs Gel Elektroforezin PDF versiyasını endirin
Bu məqalənin PDF versiyasını yükləyə və sitat qeydinə əsasən onu oflayn məqsədlər üçün istifadə edə bilərsiniz. Zəhmət olmasa, PDF versiyasını buradan yükləyin Gel Elektroforez və Kapilyar Elektroforez Arasındakı Fərq.
