Agaroz və poliakrilamid gel elektroforezi arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, agaroz gel elektroforezi DNT-nin nisbətən böyük fraqmentlərini ayırmaq üçün üfüqi şəkildə tökülmüş agaroz gellərindən, poliakrilamid gel elektroforezi isə daha qısa nüvə turşusu fraqmentlərini ayırmaq üçün şaquli şəkildə tökülmüş poliakrilamid gellərdən istifadə edir.
Elektroforez DNT, RNT və zülallar kimi biomolekulları ayırmaq üçün gel matrisi üzərində tətbiq olunan elektrik sahəsindən istifadə edən bir texnika növüdür. DNT, RNT və zülal kimi biomolekulların elektroforez vasitəsilə bu cür ayrılması yük və ölçüyə əsaslanır. Nümunələr gelin quyularına yüklənir. Daha sonra elektrik sahəsi gel boyunca tətbiq olunur. Sahə mənfi yüklü molekulların müsbət elektroda doğru hərəkət etməsinə səbəb olur. Gel matrisi ən kiçik molekulların sürətlə keçdiyi və ya daha böyük molekulların yavaş hərəkət etdiyi bir molekulyar ələk kimi çıxış edir. Bu, molekulları yük və ölçüyə görə ayırmağa imkan verir. Buna görə də, agaroza və poliakrilamid gel elektroforezi əsasən molekulları ölçülərinə və yüklərinə görə ayırmağa kömək edən iki növ gel elektroforez texnikasıdır.
Agaroz Gel Elektroforez nədir?
Agarose gel elektroforezi DNT və RNT kimi biomolekulları ayırmaq üçün agaroz gellərindən istifadə edən bir texnikadır. Nuklein turşularını ilk növbədə ölçüsünə görə ayırmaq üçün istifadə olunan bir texnikadır. Bu texnikada istifadə edilən agaroza adlanan əsas birləşmə polisaxariddir. Dəniz yosunlarından gəlir. Agaroza qaynar tamponda həll oluna bilər və sonra üfüqi vəziyyətdə saxlanılan nimçəyə tökülə bilər. Tepsidə, bir plitə meydana gətirmək üçün soyuduqda bərk olur. Agaroza gelləri, gel bərkidikdən sonra DNT və ya RNT kimi nuklein turşularının yükləndiyi quyuların yaradılması üçün yerində daraqla tökülür.
Şəkil 01: Agaroz Gel Elektroforezi
Gel daha sonra müvafiq buferə batırılır və gel üzərində cərəyan tətbiq olunur. DNT molekulun ardıcıl tərkibindən asılı olmayan vahid mənfi yükə malikdir. Beləliklə, DNT molekulları katoddan (-) anoda (+) doğru miqrasiya edəcəklər. Miqrasiya sürəti birbaşa molekulun ölçüsündən asılıdır. Ən böyük makromolekullar geldən keçməkdə ən çətin vaxta malikdirlər. Digər tərəfdən, kiçik makromolekullar geldən sürətlə və olduqca asanlıqla sürüşürlər.
Poliakrilamid Gel Elektroforez nədir?
Poliakrilamid gel elektroforezi (PAGE) biomolekulları ayırmaq üçün poliakrilamid gellərdən istifadə edən bir texnikadır. Bu, bioloji makromolekulları, adətən zülalları və nuklein turşularını elektroforetik hərəkətliliyinə görə ayırmaq üçün geniş istifadə olunan bir texnikadır. Akrilonitrilin nəmləndirilməsi nitrilhidrataz tərəfindən akrilamid molekullarının əmələ gəlməsi ilə nəticələnir. Akrilamid suda həll olunur və sərbəst radikal təşəbbüskarlarının əlavə edilməsi ilə akrilamid polimerləşir və nəticədə poliakrilamid gel əmələ gəlir. Normalda akrilamidin artan konsentrasiyası geldə məsamələrin ölçüsünün azalması ilə nəticələnir. Poliakrilamid gellər agaroz gellərindən fərqli olaraq şaquli şəkildə tökülür.
Şəkil 02: Poliakrilamid Gel Elektroforez
Poliakrilamid gel elektroforezində molekullar molekulların daha yüksək səviyyəli strukturunu qoruyaraq öz doğma vəziyyətində işləyə bilər. Bu metod yerli PAGE adlanır. Alternativ olaraq, daha yüksək səviyyəli strukturu aradan qaldırmaq və molekulu hərəkətliliyi yalnız uzunluğundan asılı olan strukturlaşmamış bir molekula çevirmək üçün kimyəvi denaturant da əlavə edilə bilər. Bu növ SDS-PAGE adlanır.
Agaroza və Poliakrilamid Gel Elektroforez arasındakı oxşarlıqlar nələrdir?
- Aqaroz və poliakrilamid gel elektroforezi iki növ gel elektroforez texnikasıdır.
- Əslində bunlar molekulyar bioloji texnikadır.
- Hər iki üsul DNT və zülallar kimi bioloji makromolekulları aşkar etmək üçün istifadə olunur.
- Bu texnikalar təcrübəli texniklər və ya tədqiqatçılar tərəfindən edilir.
- Hər iki texnikada makromolekulların ayrılması yük və ölçüyə əsaslanır.
- Hər iki üsul DNT və RNT kimi nuklein turşularının ayrılmasına imkan verir.
Agaroza və Poliakrilamid Gel Elektroforez Arasındakı Fərq Nədir?
Agarose gel elektroforezi biomolekulları ayırmaq üçün üfüqi şəkildə tökülmüş agaroz gellərindən istifadə edən bir texnikadır, poliakrilamid gel elektroforezi isə biomolekulları ayırmaq üçün şaquli şəkildə tökülmüş poliakrilamid gellərdən istifadə edən bir texnikadır. Bu agaroz və poliakrilamid gel elektroforezi arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, agaroz gel elektroforezi DNT və RNT-nin ayrılması üçün, poliakrilamid gel elektroforezi isə DNT, RNT və ya zülallar kimi nuklein turşularının ayrılması üçün istifadə olunur.
Aşağıdakı cədvəl agaroza və poliakrilamid gel elektroforezi arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
Xülasə – Agaroza vs Poliakrilamid Gel Elektroforez
Agaroz və poliakrilamid gel elektroforezi molekulyar biologiya laboratoriyalarında istifadə olunan iki növ gel elektroforez texnikasıdır. Agaroz gel elektroforezi biomolekulları ayırmaq üçün agaroz geldən istifadə edir. Agaroza ümumiyyətlə insanlar üçün zəhərli deyil, poliakrilamid isə insanlar üçün zəhərlidir. Bundan əlavə, agaroz gel elektroforezi aşağı qətnamə, poliakrilamid gel elektroforezi isə daha yüksək qətnamə göstərir. Poliakrilamid gel elektroforezi biomolekulları ayırmaq üçün poliakrilamid geldən istifadə edir. Bu, agaroz və poliakrilamid gel elektroforezi arasındakı fərqi ümumiləşdirir
