1D və 2D gel elektroforezi arasındakı əsas fərq gel elektroforezində zülalların ayrılması üçün istifadə olunan xüsusiyyətlərdir. 1D gel elektroforezi zülalları yalnız molekulyar çəkiyə görə ayırır, 2D gel elektroforezi isə zülalları onun izoelektrik nöqtəsi və molekulyar çəkisinə görə ayırır.
Gel elektroforezi ilə zülalın ayrılması zülalları xarakterizə etmək üçün vacib bir texnikadır. Zülallar müxtəlif xüsusiyyətlərə malikdir; buna görə də, agaroza gel elektroforezi ilə DNT ayrılması ilə müqayisədə ayrılma daha mürəkkəbdir.
1D Gel Elektroforez nədir?
1D Gel Elektroforez, bir ölçülü gel elektroforezi kimi də tanınır, molekulyar çəkiyə əsaslanan zülalların ayrılması üsuludur. Zülalın ayrılması əsasən poliakrilamid gel elektroforezindən istifadə etməklə baş verir. Gel elektroforezi konsepsiyasına əsaslanaraq, molekullar molekulyar çəki və yük xüsusiyyətlərinə görə ayrılır.
Buna görə də zülallara vahid yük vermək üçün gel elektroforezindən əvvəl natrium dodesil sulfat (SDS) müalicəsi aparılır. SDS zülalları denatürasiya edir və zülal üzərində vahid mənfi yük təmin edir; elektrik sahəsinin tətbiqi baş verdikdə, zülallar molekulyar çəkilərinə görə müsbət terminala köçürlər. Beləliklə, ayrılıqda yalnız bir mülk nəzərə alınır. Buna görə də bu üsul 1D gel elektroforezi adlanır.
Şəkil 01: 1D Gel Elektroforez
1D gel elektroforezi zamanı zülallar molekulyar çəkilərinə görə ayrılır. Bu baxımdan, yüksək molekulyar ağırlıqlı zülallarla müqayisədə aşağı çəki molekulları geldə daha sürətli miqrasiya edir. Beləliklə, yüksək çəkisi olan zülallar quyuların yaxınlığında qalır.
2D Gel Elektroforez nədir?
2D gel elektroforezi və ya iki ölçülü gel elektroforezi zülalları iki xüsusiyyət əsasında ayırır. İki xüsusiyyət zülalın izoelektrik nöqtəsi və molekulyar çəkidir. Bu zülalın ayrılması üsulu zülalın ayrılmasının həllini artırır. Zülalın izoelektrik nöqtəsi zülalın neytral olduğu pH-dan asılıdır.
Şəkil 02: 2D Gel Elektroforez
Beləliklə, 2D gel elektroforezində zülalın birinci ölçüdə sabit pH qradiyenti üzərində işləməsinə icazə verilir. İkinci ölçüdə zülallar şaquli və ya üfüqi poliakrilamid gel elektroforezi ilə ayrılır. Beləliklə, zülallar ikinci ölçüdə molekulyar çəkilərinə görə ayrılırlar.
Bundan başqa gel elektroforezinin bu üsulu zülalların ayrılmasının həllini artırır. Buna görə də ayrılan zülallar daha təmiz olur. Bununla belə, texnikanın qiyməti bir ölçülü gel elektroforezindən xeyli yüksəkdir.
1D və 2D Gel Elektroforez arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Hər iki üsul zülalları ayırır.
- Buna görə də onlar zülalları xarakterizə etmək üçün vacibdir.
1D və 2D Gel Elektroforez Arasındakı Fərq Nədir?
1D və 2D gel elektroforezi arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, 1D gel elektroforez zülalları yalnız molekulyar çəkiyə görə ayırır, 2D gel elektroforezi isə zülalları həm izoelektrik nöqtəsinə, həm də molekulyar çəkiyə görə ayırır. 1D və 2D gel elektroforezi arasındakı bu əsas fərqə görə, zülalların ayrılmasının həlli və iki texnikanın qiyməti də dəyişir.2D gel elektroforezi 1D gel elektroforezindən daha yüksək rezolyusiya göstərir. Bununla belə, 2D gel elektroforezi 1D gel elektroforezindən daha bahalıdır.
Aşağıdakı infoqrafika 1D və 2D gel elektroforezi arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
Xülasə – 1D vs 2D Gel Elektroforez
Zülalların ayrılması bir çox amillərdən asılıdır. 1D gel elektroforezi zülalları yalnız molekulyar çəkiyə görə ayırır. Bununla belə, iki ölçülü və ya 2D gel elektroforezi zülalın ayrılmasının həllini artırır. Bundan əlavə, 2D gel elektroforezi zülalları izoelektrik nöqtəsi və molekulyar çəki əsasında ayırır. Buna görə də, bu məlumatlar zülalların aşağı emalı və proteomika sahəsində vacibdir. Beləliklə, bu, 1D və 2D gel elektroforezi arasındakı fərqin xülasəsidir.
