İzoşizomerlərlə neoskizomerlər arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, izoskizomerlər eyni tanınma ardıcıllığına malik olan və DNT-ni eyni mövqelərdə parçalayan məhdudlaşdırıcı fermentlərdir, neoskizomerlər isə eyni tanınma ardıcıllığına malik, lakin DNT-ni fərqli mövqelərdə parçalayan məhdudlaşdırıcı fermentlərdir..
Məhdudiyyət fermentləri və ya məhdudlaşdırıcı endonükleazlar DNT-ni xüsusi tanınma yerlərində və ya yaxınlığında parçalara ayıran fermentlərdir. Məhdudiyyət yerlərində DNT-ni kəsdilər. Məhdudiyyət fermentləri quruluşuna, DNT substratını tanınma yerində kəsib-kəsməməsinə və tanınma və parçalanma yerlərinin bir-birindən ayrı olub-olmamasına görə adətən beş qrupa bölünür. Artıq 3600-dən çox məhdudlaşdırıcı endonükleaz müəyyən edilmişdir. Ticarətdə təxminən 800 məhdudlaşdırıcı ferment mövcuddur. İzoşizomerlər və neosşizomerlər tanınma sahəsinə və parçalanma spesifikliyinə əsaslanan iki növ məhdudlaşdırıcı fermentlərdir.
İzoşizomerlər nədir?
İzoşizomerlər eyni tanınma ardıcıllığına malik olan və DNT-ni eyni mövqelərdə parçalayan məhdudlaşdırıcı fermentlərdir. Bu məhdudlaşdırıcı fermentlər eyni spesifikliyə malikdir. Verilmiş ardıcıllığı tanıyan ilk aşkar edilmiş məhdudlaşdırıcı ferment prototip kimi tanınır, eyni ardıcıllığı tanıyan bütün sonradan müəyyən edilmiş məhdudlaşdırıcı fermentlər isə izoskizomerlər adlanır. Bununla belə, izoskizomerlər sahə üstünlükləri, reaksiya şəraiti, metilləşmə həssaslığı və ulduz aktivliyi ilə fərqlənə bilər. İzoşizomerlər müxtəlif bakteriya suşlarından təcrid olunurlar. Buna görə də, onlar müxtəlif reaksiya şərtlərini tələb edə bilər. Bəzi hallarda, bir cüt izoskizomerdən yalnız biri məhdudlaşdırma sahələrinin həm metilləşdirilmiş, həm də metilləşməmiş formalarını tanıya bilər. Digər tərəfdən, digər məhdudlaşdırıcı ferment məhdudlaşdırma sahəsinin yalnız metillənməmiş formasını tanıya bilər. İzoşizomerlərin bu xüsusi xüsusiyyəti məhdudlaşdırma sahəsinin metilasiya vəziyyətini müəyyən etməyə kömək edir, eyni zamanda onu bakterial vəziyyətdən təcrid edir.
Məsələn, AgeI və BshT1 5’-A↓CCGGT-ni eyni modeldə tanıyır və ayırır. HpaII və MSPI izoskizomerlərin digər cütləridir. Hər ikisi 5'-C↓CGG-3' ardıcıllığını metilləşməmiş halda tanıyır. Lakin ardıcıllığın ikinci C-si metilləşdirildikdə, yalnız MSPI bu ardıcıllığı tanıya bilər, HpaII isə onu tanıya bilməz.
Neoschizomers nədir?
Neoskizomerlər eyni tanınma ardıcıllığına malik olan, lakin DNT-ni müxtəlif mövqelərdə parçalayan məhdudlaşdırıcı fermentlərdir. Bəzi xüsusi molekulyar bioloji tətbiqlərdə bu çox faydalı xüsusiyyətdir. Neoskizomerlər izoskizomerlərin alt çoxluğudur. Neoskizomerlər üçün məşhur nümunələr SmaI (5'-CCC↓GGG-3') və XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); hər ikisi 5'-CCCGGG-3' ardıcıllığını tanıyır, lakin onları fərqli mövqedən ayırır. Beləliklə, bu iki məhdudlaşdırıcı ferment müxtəlif növ uclar yaradır. Bu halda SmaI küt uclar, XmaI isə 5' çıxıntılı uclar yaradır.
Şəkil 01: Neoschizomers
Başqa bir nümunə MaeII və Quyruq məhdudlaşdırıcı fermentlər cütüdür. Prototip MaeII (A↓CGT) 2 əsaslı 5' uzantılı DNT fraqmentləri, neoschizomer Quyruğu (ACGT↓) isə 4 əsaslı 3' uzantılı DNT fraqmentləri istehsal edir.
İzoşizomerlər və Neosşizomerlər arasında hansı oxşarlıqlar var?
- İzoşizomerlər və neosşizomerlər iki növ məhdudlaşdırıcı fermentlərdir.
- Onlar əsasən prokaryotlarda olur.
- Onlar bakteriya və arxeyalarda olan məhdudiyyət-modifikasiya (RM) sisteminin bir hissəsidir.
- Hər ikisi protein molekullarıdır.
- Hər ikisi DNT-ni parçalara ayırır.
İzoşizomerlər və Neosşizomerlər Arasındakı Fərq Nədir?
İzoşizomerlər eyni tanınma ardıcıllığına malik olan və DNT-ni eyni mövqelərdə parçalayan məhdudlaşdırıcı fermentlərdir, neosşizomerlər isə eyni tanınma ardıcıllığına malik olan, lakin DNT-ni müxtəlif mövqelərdə parçalayan məhdudlaşdırıcı fermentlərdir. Beləliklə, bu izoschizomerlər və neoschizomerlər arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, izoskizomerlər eyni spesifikliklərə malikdir, neosşizomerlər isə fərqli xüsusiyyətlərə malikdir.
Aşağıdakı infoqrafika yan-yana müqayisə üçün izoskizomerlər və neosşizomerlər arasındakı fərqləri cədvəl şəklində sadalayır.
Xülasə – İzoşizomerlərə qarşı Neoschizomerlər
Məhdudiyyət fermentləri DNT kəsici fermentlərdir. Onlara molekulyar qayçı da deyilir. Müxtəlif növ məhdudlaşdırıcı fermentlər var. Tanınma sahəsinə və parçalanma spesifikliyinə əsasən, məhdudlaşdırıcı fermentlər izoskizomerlər və neoschizomerlər kimi iki növdür. İzoşizomerlər eyni tanınma ardıcıllığına malikdir və DNT-ni eyni mövqelərdə parçalayır, neosşizomerlər isə eyni tanınma ardıcıllığına malikdirlər, lakin DNT-ni fərqli mövqelərdə parçalayırlar. Beləliklə, izoskizomerlər və neosşizomerlər arasındakı əsas fərq budur.
