Saxaroza qradiyenti ilə saxaroza yastığı ultrasentrifuqasiyası arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, saxaroza qradiyenti ilə ultrasentrifuqada davamlı saxaroza qradiyentindən istifadə edilir, saxaroza yastığı ultrasentrifuqasında isə fasiləsiz saxaroza qradiyentindən istifadə edilir.
Saxaroza qradiyenti və saxaroza yastığının ultrasentrifuqalanması xüsusi növ makromolekulları ayırmaq üçün istifadə olunan iki oxşar üsuldur. Hər iki texnikada saxaroza sıxlığı gradientindən istifadə olunur. Lakin saxaroza qradiyenti ilə ultrasentrifuqada davamlı sıxlıq qradiyentindən istifadə olunur, saxaroza yastığı ultrasentrifuqasında isə fasiləsiz sıxlıq qradiyenti istifadə olunur.
Saxaroza Gradient Ultrasentrifuqasiya nədir?
Saxaroza qradiyenti ultrasentrifuqasiya DNT, RNT və zülallar kimi makromolekulları fraksiyalaşdırmaq üçün istifadə edilə bilən bir texnikadır. Bu texnikada bir neçə addım var. Bunlar saxaroza qradiyentinin hazırlanması, sentrifuqalanması, ayrılması və elüsyonudur. Gradientin hazırlanması bu texnikada əsas addımdır. Bu texnikada müxtəlif ölçülü makromolekullardan ibarət nümunə saxaroza qradiyenti sütununun səthində laylanır. Mərkəzdənqaçma zamanı müxtəlif ölçülü makromolekullar saxaroza qradiyenti sütunundan müxtəlif sürətlərdə çökür. Sedimentasiya bir neçə amildən, o cümlədən mərkəzdənqaçma qüvvəsindən, ölçü formasından və makromolekulların sıxlığından, qradientin sıxlığından və özlülüyündən asılıdır. Santrifüjün sonunda makromolekullar sıxlığa görə məkan olaraq ayrılır. Daha böyük makromolekullar (yüksək sıxlıqlı makromolekullar) dibə doğru çökür. Daha yüngül olanlar (aşağı sıxlıqlı makromolekullar) gradientin yuxarı hissəsində qalırlar. Beləliklə, molekullar müxtəlif zolaqlar kimi ayrılır. Sonra zolaqlar ayrılmalı və xüsusi makromolekulun saxarozadan təmizlənməsi aparılmalıdır.
Şəkil 01: Saxaroza Qradienti Ultrasentrifuqa
Tətbiq tərəfində bu üsul DNT molekullarının fraksiyalaşdırılması üçün geniş şəkildə istifadə olunur. Zülal kompleksinin ölçüsünü və tərkibini xarakterizə etmək üçün saxaroza gradient ultrasentrifuqalama adətən istifadə olunur. Üstəlik, bu texnika mRNT-nin qismən təmizlənməsi üçün istifadə olunur.
Saxaroza Yastığı Ultrasentrifuqasiya nədir?
Saxaroza yastıqlarının ultrasentrifuqalanması makromolekulların fraksiyalaşdırılmasına imkan verən başqa bir texnikadır. Saxaroza sıxlığı qradiyentinin ultrasentrifuqasından fərqli olaraq, saxaroza yastığı ultrasantrifüqasiyası fasiləsiz sıxlıq qradiyentindən istifadə edir. Saxaroza konsentrasiyası diskret addımlarla yuxarıdan aşağıya doğru artır. Bu texnikada ayırma, aydınlaşdırılmış ekstraktı saxaroza yastığı adlanan sentrifuqa borusuna kiçik həcmli saxaroza məhlulunun üstünə qoymaqla əldə edilir. Bu, yüksək sürətli sentrifuqada daha yaxşı ayrılmağa imkan verir. Molekullar saxaroza yastığı arasında bir zolaq kimi ayrıldıqda, ağ zolaq toplana və təmizlənə bilər. Bundan əlavə, çirkləri saxaroza yastığı üsulu ilə daha da çıxarmaq olar. Saxaroza yastığı üsulu borunun 60-70%-ni nümunə ilə doldurmağa imkan verir. Beləliklə, saxaroza yastığı üsulu daha böyük həcmdə nümunənin işlənməsinə imkan verir.
Saxaroza qradiyenti ilə saxaroza yastığı ultrasantrifüqasiyası arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Saxaroza qradiyenti və saxaroza yastığının ultrasentrifuqalanması makromolekulların qarışığını ayırmaq üçün istifadə edilən iki üsuldur.
- Hər iki üsulda saxaroza qradiyenti istifadə olunur.
- Sentrifuqa hər iki üsulda bir addımdır.
- Molekullar hər bir metodda zolaq və ya zona kimi çöküntü edir.
Saxaroza qradienti ilə saxaroza yastığı ultrasentrifuqalama arasındakı fərq nədir?
Saxaroza qradiyentinin ultrasentrifuqalanması sentrifuqa borusunda davamlı saxaroza qradiyentindən istifadə edən bir texnikadır, saxaroza yastığı ultrasentrifuqasiyası isə fasiləsiz saxaroza gradientindən istifadə edən bir texnikadır. Beləliklə, bu, saxaroza qradiyenti ilə saxaroza yastığı ultrasantrifüqasiyası arasındakı əsas fərqdir.
Bundan başqa, saxaroza yastığı ultrasentrifuqası nümunənin daha böyük həcminin emal edilməsinə imkan verir, saxaroza qradiyenti isə nümunənin nisbətən aşağı həcminin emal edilməsinə imkan verir.
Aşağıda infoqrafik cədvəl saxaroza qradiyenti və saxaroza yastığı ultrasentrifuqası arasında daha çox fərqi göstərir.
Xülasə – Saxaroza Qradienti ilə Saxaroza Yastığı Ultrasentrifuqası
Saxaroza qradiyenti ultrasentrifuqalama davamlı saxaroza qradiyentindən istifadə edərək makromolekulları ayırır. Bunun əksinə olaraq, saxaroza yastığı ultrasentrifuqasiyası qarışıqda xüsusi növ hissəcikləri ayırmaq üçün fasiləsiz saxaroza gradientindən istifadə edir. Beləliklə, bu saxaroza gradienti ilə saxaroza yastığı ultrasantrifüqasiyası arasındakı əsas fərqdir. Saxaroza yastığı metodu morfoloji cəhətdən bütöv hissəciklərin toplanmasına imkan verir, çünki o, molekulları borunun dibinə qədər əzən saxaroza gradient ultrasentrifuqasından fərqli olaraq mexaniki gərginliyə səbəb olmur. Üstəlik, saxaroza yastıqlarının ultrasentrifuqalanması, saxaroza qradiyenti ilə müqayisədə daha böyük həcmdə nümunənin işlənməsinə imkan verir.
