Oliqopeptid və polipeptid arasındakı əsas fərq oliqopeptidlərin az miqdarda amin turşusu qalıqları, polipeptidlərin isə çoxlu sayda amin turşusu qalıqları ehtiva etməsidir.
Oliqopeptidlər və polipeptidlər terminləri zülallar kateqoriyasına aiddir. Peptidlər amin turşularının qısa zəncirləridir. Amin turşuları bir-biri ilə peptid bağları vasitəsilə bağlanır. Buna görə də, bu peptidləri bu peptidlərdə olan amin turşularının sayına görə təsnif edə bilərik. Məsələn, dipeptidlər, tripeptidlər, tetrapeptidlər, oliqopeptidlər və polipeptidlər.
Oliqopeptid nədir?
Oliqopeptid hər molekulda az sayda amin turşusu olan amin turşuları zənciridir. Biz tez-tez bu molekulları ümumi termin kimi “peptidlər” adlandırırıq. Bu peptid molekullarında mövcud olan amin turşusu qalıqlarının sayı iki ilə iyirmi amin turşusu arasında dəyişə bilər. Oliqopeptidlərə həmçinin dipeptidlər, tripeptidlər və s. kimi bəzi kiçik peptid formaları daxil ola bilər. Təbii olaraq yaranan oliqopeptidlərin bəzi ümumi nümunələrinə mikroviridin, siyanopeptolinlər, mikrosistinlər və s. daxildir.
Şəkil 01: Tripeptidin strukturu
Bu oliqopeptidlər qeyri-ribosomal peptid sintazaları və ya NRPS tərəfindən istehsal olunur. Ancaq bəzi istisnalar var. Məsələn, siklamidlər və mikroviridin ribosomik yollarla sintez olunur. Oliqopeptidlərin ayrılması prosesinə oliqopeptidin zənginləşdirilməsi, təmizlənməsi və identifikasiyası daxildir. İdentifikasiya prosesi üçün gel xromatoqrafiyası, HPLC, HPLC-kütləvi spektroskopiya, ion mübadiləsi xromatoqrafiyası və s.
Polipeptid nədir
Polipeptid çoxlu sayda amin turşusu olan amin turşusu qalıqları zənciridir. Protein bir və ya daha çox polipeptid zəncirindən ibarətdir. Bu polipeptid zəncirlərində amin turşuları bir növ kovalent kimyəvi bağlar olan peptid bağları vasitəsilə bir-birinə bağlanır. Hər bir polipeptid zəncirində iki terminal var: N-terminal və C-terminal. N-terminal sərbəst amin qrupu ilə bitən amin-terminaldır, C-terminal isə sərbəst karboksil qrupu ilə bitən karboksil-terminaldır. Peptiddə mövcud olan amin turşularının ardıcıllığı mRNT-də polipeptidin və ya zülalın istehsalında iştirak edən kodonlar tərəfindən müəyyən edilir.
Zülaldakı polipeptidlərin sayına və düzülüşünə görə zülal strukturlarının dörd əsas növü vardır:
- İlkin struktur – Zülalın ilkin strukturu eyni zəncirdəki bəzi amin turşuları arasında disulfid körpüləri olan tək polipeptid zəncirindən ibarətdir ki, bu da bükülmüş struktur yaradır.
- İkincil struktur – Zülalın ikincili strukturunun iki əsas forması var: alfa-spiral strukturu və beta-vərəq quruluşu.
Şəkil 02: Alpha Helix Strukturu
- Üçüncü struktur – Bu yüksək qatlanmış şəbəkə strukturudur. Bu quruluş çox vacibdir, çünki zülalın funksiyasını təyin edir.
- Dördüncü quruluş – Bu, bir-biri ilə bağlı olan iki və ya üç polipeptid zəncirindən ibarət olduqca mürəkkəb strukturdur.
Oliqopeptid və Polipeptid Arasındakı Fərq Nədir?
Oliqopeptidlər və polipeptidlər iki fərqli zülal kateqoriyasıdır. Zülal molekullarında mövcud olan amin turşusu qalıqlarının sayından asılı olaraq bir-birindən fərqlənirlər. Buna görə də, oliqopeptid və polipeptid arasındakı əsas fərq oliqopeptidlərin az miqdarda amin turşusu qalıqlarından ibarət olmasıdır, polipeptidlərdə isə çoxlu sayda amin turşusu qalıqları var.
Aşağıdakı infoqrafika oliqopeptid və polipeptid arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
Xülasə – Oliqopeptid və Polipeptid
Oliqopeptidlər və polipeptidlər iki fərqli zülal kateqoriyasıdır. Bu protein molekullarında mövcud olan amin turşusu qalıqlarının sayından asılı olaraq bir-birindən fərqlənirlər. Yəni, oliqopeptid və polipeptid arasındakı əsas fərq oliqopeptidlərin az miqdarda amin turşusu qalıqları, polipeptidlərin isə çoxlu sayda amin turşusu qalıqları ehtiva etməsidir.
