DNT ilə cDNA arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, DNT həm ekzon, həm də intronlar, cDNA isə yalnız ekzonlardan ibarətdir.
DNT və cDNA deoksiribonukleotidlərdən ibarət iki növ nuklein turşusudur. DNT genomu meydana gətirən canlı orqanizmlərin ən vacib makromolekullarından biridir. Genom orqanizmin ümumi genetik məlumatını ehtiva edir. O, kodlaşdıran ardıcıllıqlar olan ekzonlar və kodlaşdırılmayan ardıcıllıqlar olan intronlar da daxil olmaqla müxtəlif növ ardıcıllıqları təşkil edir. Digər tərəfdən, cDNA və ya tamamlayıcı DNT, elm adamları tərəfindən mRNA molekullarından süni şəkildə sintez edilən DNT-nin başqa bir formasıdır.cDNA mRNA şablonlarından əldə edildiyi üçün onun tərkibində kodlaşdırılmayan ardıcıllıqlar və intronlar yoxdur.
DNT nədir?
Dezoksiribonuklein turşusu və ya DNT bakteriyalar da daxil olmaqla bir çox canlı orqanizmin genetik materialı kimi xidmət edir. Genetik məlumat nukleotid ardıcıllığı və genlər şəklində DNT molekullarında yerləşir. Çoxalma zamanı valideyn DNT-si gametlər vasitəsilə nəsillərə ötürülür. Struktur olaraq, DNT deoksiribonukleotidlərin monomerlərindən ibarət makromolekuldur. Deoksiribonukleotidin üç komponenti var; deoksiriboza şəkəri, azotlu əsas (adenin, guanin, sitozin və timin) və fosfat qrupu. Bundan əlavə, DNT molekulları tamamlayıcı azotlu əsaslar arasında hidrogen bağları ilə bağlanmış iki tamamlayıcı DNT zəncirindən hazırlanmış ikiqat sarmal şəklində mövcuddur. Müvafiq olaraq, adenin və timin arasında iki hidrogen bağı, sitozin və guanin arasında isə üç hidrogen bağı var.
Şəkil 01: DNT
DNT spiralında fosfat və şəkər hissələri spiraldan kənarda yerləşir, əsaslar isə spiralın daxili hissəsində qalır. DNT-nin iki zənciri əks istiqamətdə axır. Bundan əlavə, DNT molekulları histon zülalları ilə sıx bir şəkildə bükülür və eukariotlarda xromosomlar adlanan ip kimi strukturlar yaradır. DNT-nin mühüm xüsusiyyəti onun özünü çoxalda bilməsidir, yəni o, özünü təkrarlaya və ya surətini çıxara bilər. O, həmçinin canlı orqanizmlərin zülal sintezində böyük rola malikdir.
cDNA nədir?
cDNA tamamlayıcı DNT deməkdir. Bu, əks transkriptaza fermentinin iştirakı ilə şablon rolunu oynayan messenger RNT (mRNA) tərəfindən süni şəkildə sintez edilən DNT formasıdır. Əksər eukariotlarda genomik DNT ekzon və intronlardan ibarət çoxlu genləri ehtiva edir. Ekzonlar kodlaşdırma ardıcıllığıdır, intronlar isə genomun kodlaşdırılmayan hissəsini təşkil edir. Ümumiyyətlə, gen ifadəsi zamanı DNT ardıcıllığı zülal istehsal etməzdən əvvəl mRNT ardıcıllığına transkripsiya olunur. Yetkin bir mRNT hazırlayarkən, bir bağlama mexanizmi bütün intron ardıcıllığını aradan qaldırır. Beləliklə, yetkin mRNT intronlar və ya kodlaşdırmayan ardıcıllıqları ehtiva etmir.
Bundan başqa, cDNA yaratmaq üçün eukaryotik hüceyrələrin mRNT-si çıxarıla və təmizlənə bilər. ferment; əks transkriptaza bu təmizlənmiş eukaryotik mRNT-dən cDNT sintezini katalizləyir. mRNT-dən cDNT qurduqdan sonra, onlar cDNA kitabxanaları yaratmaq üçün bakteriya hüceyrəsinə klonlaşdırıla və ya heteroloji ekspressiya tədqiqatları üçün istifadə edilə bilər.
Şəkil 02: cDNA
Adətən, cDNA prokaryotlarda eukaryotik genlərin klonlanmasında böyük dəyərə malikdir. Prokaryotlarda intronlar olmadığı üçün eukaryotik DNT-dən intronlar çıxara və funksional mRNT yarada bilmirlər. Buna görə də, bütün eukaryotik genləri prokariotlara klonlamazdan əvvəl intronlar çıxarmaq və mRNT-dən cDNT hazırlamaq və prokariotlara klonlaşdırmaq lazımdır.
DNT və cDNT arasındakı oxşarlıqlar nələrdir?
- DNT və cDNA nuklein turşularının iki formasıdır.
- Hər ikisi deoksiribonukleotid monomerlərini ehtiva edir.
- Həmçinin, hər ikisi genlərin kodlama ardıcıllığına malikdir.
DNT ilə cDNT arasındakı fərq nədir?
DNT nuklein turşusunun təbii formasıdır, cDNA isə nuklein turşusunun süni şəkildə qurulmuş formasıdır. Buna görə də bu, DNT və cDNA arasındakı fərqdir. Üstəlik, DNT bir çox canlı orqanizmin genomunu təmsil edir. O, kodlaşdırma və kodlaşdırmayan ardıcıllıqları təşkil edir. Bununla birlikdə, mRNT edərkən, bütün intron ardıcıllıqları zülalların meydana gəlməsi üçün vacib olmadığı üçün kəsilir. Beləliklə, mRNT ardıcıllıqlarında intronlar yoxdur. Bu mRNT ardıcıllığı cDNA sintezi zamanı şablon kimi çıxış edir. Beləliklə, cDNT-də intronlar yoxdur. Müvafiq olaraq, DNT intronlar ehtiva edir, lakin cDNA-da intronlar yoxdur. Bunu DNT ilə cDNA arasındakı əsas fərq kimi deyə bilərik.
Bundan başqa, cDNA yalnız ekzonları ehtiva etdiyi üçün cDNA-lar DNT-dən çox qısadır. DNT minlərlə baza cütünü əhatə edən bəzi intronlar ehtiva edir. Beləliklə, bu da DNT ilə cDNA arasındakı fərqdir. Üstəlik, DNT təbii olaraq ikiqat sarmal şəklində, cDNA isə tək zəncirli ardıcıllıqla meydana gəlir. DNT polimeraza DNT sintezini və ya replikasiyasını kataliz edən fermentdir, əks transkriptaza isə laboratoriyada cDNT sintezini kataliz edən fermentdir.
DNT və cDNA arasındakı fərq haqqında aşağıdakı infoqrafika bu fərqlər haqqında daha ətraflı məlumat verir.
Xülasə – DNT vs cDNA
DNT genomumuzu meydana gətirən mühüm polimerdir. Digər tərəfdən, cDNA, cDNA kitabxanalarını yaratmaq və çətin ifadə olunan zülallar istehsal etmək üçün vacib olan başqa bir DNT formasıdır. mRNA cDNA yaratmaq üçün istifadə olunur. Beləliklə, cDNT-də intronlar yoxdur. Lakin DNT intronlar ehtiva edir. Beləliklə, DNT və cDNA arasındakı əsas fərqdir. DNT genomik DNT kitabxanalarının qurulması üçün faydalıdır, cDNA isə cDNA kitabxanalarının qurulması üçün faydalıdır. cDNA-da intronlar olmadığı üçün cDNA DNT-dən daha qısadır. Ən əsası, DNT cüt zəncirli, cDNA isə tək zəncirlidir. Bu, DNT və cDNA arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
