Siqma faktoru ilə rho faktoru arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, siqma faktoru bakteriyalarda transkripsiyanın başlaması üçün lazım olan zülaldır, rho faktoru isə bakteriyalarda transkripsiyanın dayandırılması üçün lazım olan zülaldır.
Siqma faktoru və rho faktoru bakterial transkripsiya üçün iki vacib amildir. Bakterial transkripsiya bakterial DNT-nin bir parçasının yeni yaradılmış mRNT zəncirinə (messenger RNT) kopyalandığı bir prosesdir. Bu proses RNT polimeraza kimi tanınan bir ferment tərəfindən kataliz edilir. Bakteriyalar ətraf mühitə düzgün reaksiya vermək üçün transkripsiyaya və tərcüməyə çox etibar edirlər. Bakterial RNT polimeraza nüvədən və holoenzim strukturundan ibarətdir. Nüvədə β, β′, α və 2ω alt bölmələri, holoenzimdə isə siqma faktoru var. Bundan əlavə, rho faktoru kimi tanınan RNT polimerazına köməkçi amil də bakterial transkripsiya üçün çox vacibdir.
Siqma Faktoru nədir?
Siqma faktoru və ya spesifiklik faktoru bakteriyalarda transkripsiyanın başlaması üçün lazım olan zülaldır. Bu bakterial transkripsiya başlanğıc faktorudur. Bu amil transkripsiya zamanı RNT polimeraza fermentinin DNT-nin promotor bölgə adlanan xüsusi bölgəsinə bağlanmasına imkan verir. Siqma faktoru normal olaraq arxeal transkripsiya faktoru B və eukaryotik transkripsiya faktoru TF11B ilə homologdur. Üstəlik, müəyyən bir genin xüsusi siqma faktoru gen və ətraf mühit siqnallarından asılı olaraq dəyişir. Promotorlar RNT polimeraza ilə əlaqəli siqma faktorundan asılı olaraq seçilir.
Şəkil 01: Siqma Faktoru
Siqma faktoru həmçinin plastidlə kodlanmış polimerazanın (PEP) bir hissəsi kimi bitkilərin xloroplastında tapıla bilər. Siqma faktoru və RNT polimerazı birlikdə RNT polimeraza holoenzim kimi tanınır. Siqma amilinin molekulyar çəkisi təxminən 70 kDa-dır. Transkripsiya başlandıqdan sonra siqma faktoru kompleksdən ayrılır. Sonra RNT polimeraza transkripsiya bitənə qədər uzanmağa davam edir.
Rho Faktor nədir?
Rho faktoru transkripsiyanın dayandırılmasında iştirak edən prokaryotik zülaldır. Rho faktoru adətən transkripsiya terminatorunun pauza sahəsinə bağlanır. Bu sahə sitozinlə zəngin guaninin zəif ardıcıllığı ilə açıq oxu çərçivəsinin yaxınlığında tək zəncirli RNT-nin məruz qalmış bölgəsidir. Prokaryotlarda vacib bir transkripsiya proteinidir. Escherichia coli-də rho faktoru təxminən 274,6 kDa eyni alt vahidlərin heksameridir. Hər bir alt bölmənin bir RNT bağlayıcı domeni və ATP hidroliz sahəsi var. Üstəlik, rho faktorunun funksiyası helikaz aktivliyidir.
Şəkil 02: Rho Faktoru
Rho faktoru RNT molekuluna bağlanır və sonra RNT molekullarını köçürmək üçün enerji təmin etmək üçün ATPase aktivliyindən istifadə edir. Rho faktoru, hibrid (RNT-DNT) dupleks quruluşunu açdığı RNT-DNT spiral bölgəsinə çatana qədər translokasiyanı həyata keçirir. Bu proses transkripsiya prosesini dayandıraraq RNT polimerazanı dayandırır.
Siqma faktoru ilə Rho faktoru arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Siqma faktoru və rho faktoru bakterial transkripsiya üçün iki vacib amildir.
- Hər ikisi yalnız prokaryotlarda mövcuddur.
- Onlar amin turşularından ibarət zülallardır.
- Hər ikisi nuklein turşuları bağlayan zülallardır.
- Prokariotlar özünəməxsus zülallar yarada bilən və onlara ətraf mühitə xüsusi reaksiya verməyə kömək edən mRNT yaratmaq üçün bu amillərə çox etibar edirlər.
Siqma Faktoru ilə Rho Faktoru Arasındakı Fərq Nədir?
Siqma faktoru bakteriyalarda transkripsiyanın başlaması üçün lazım olan zülaldır, rho faktor isə bakteriyalarda transkripsiyanın dayandırılması üçün lazım olan zülaldır. Beləliklə, bu siqma amili ilə rho faktoru arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, siqma faktoru DNT-ni bağlayan zülaldır, rho faktoru isə RNT bağlayan zülaldır.
Aşağıdakı infoqrafika yan-yana müqayisə üçün siqma faktoru ilə rho faktoru arasındakı fərqləri cədvəl şəklində təqdim edir.
Xülasə – Sigma Factor vs Rho Factor
Transkripsiya DNT-dəki məlumatın mRNA (messenger RNT) adlı yeni molekula kopyalandığı prosesdir. Bu m-RNT son nəticədə xüsusi bir protein istehsalında iştirak edir. Siqma faktoru və rho faktoru bakterial transkripsiya üçün iki vacib amildir. Onlar zülallardır. Siqma faktoru bakteriyalarda transkripsiyanın başlamasında iştirak edir. Rho faktoru bakteriyalarda transkripsiyanın dayandırılmasından məsuldur. Beləliklə, bu, siqma faktoru ilə rho faktoru arasındakı fərqin xülasəsidir.
