pBR322 və pUC19 arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, pBR322 uzunluğu 4361 əsas cüt olan plazmid vektoru, pUC19 isə 2686 əsas cüt uzunluğu olan plazmid vektorudur.
Klonlaşdırma vektoru orqanizmdə sabit saxlanıla bilən kiçik DNT parçasıdır. O, həm də klonlaşdırma məqsədilə yad DNT fraqmentinin daxil edilə biləcəyi kiçik bir DNT parçasıdır. Vektor məhdudiyyət sahələri, seçilə bilən marker, reportyor geni və ifadə elementi kimi xarici DNT fraqmentinin vektorlara rahat daxil edilməsinə imkan verən mühüm xüsusiyyətləri ehtiva edir. Klonlaşdırma ilk olaraq E.coli. E. coli üçün klonlama vektorlarına plazmidlər, bakteriofaqlar, kosmidlər və bakterial süni xromosomlar (BAC) daxildir. Ən çox istifadə edilən vektorlar genetik olaraq hazırlanmış plazmidlərdir. pBR322 və pUC19 iki növ plazmid vektorudur.
pBR322 nədir?
pBR322 plazmid vektorudur. E. coli üçün ilk geniş istifadə olunan klonlama vektorlarından biridir. Bu vektor ilk dəfə 1977-ci ildə Kaliforniya Universitetində, San-Fransiskoda Herbert Boyerin laboratoriyasında yaradılmışdır. Bu, uzunluğu 4361 əsas cütü olan dairəvi ikizəncirli DNT-dir.
Şəkil 01: pBR322
Bu plazmid vektorunun xüsusi xüsusiyyətləri var. Normalda iki antibiotik müqavimət geninə malikdir: ampisilin müqavimətini kodlayan gen bla (AmpR) zülalı və tetrasiklin müqavimətini kodlayan gen tetA (TetR) protein. Bundan əlavə, pMB1-in təkrarlanmasının mənşəyini ehtiva edir. Bu plazmid vektoru həmçinin plazmid nüsxə nömrəsinin məhdudlaşdırıcısını kodlayan rop geninə malikdir. Bundan əlavə, bu vektor 40-dan çox məhdudlaşdırma fermenti üçün unikal məhdudlaşdırıcı sahələrə malikdir. Həmin qırx məhdudlaşdırma yerindən 11-i TetR genində yerləşir. TetR geninin promotorunda HindIII və ClaI məhdudlaşdırma fermentləri üçün iki məhdudlaşdırma yeri var. Bundan əlavə, AmpR geni daxilində altı çox vacib məhdudlaşdırma yeri var. pBR322 aşağı nüsxə sayı klonlama vektorudur. Hər bakteriya hüceyrəsi üçün təxminən 20 plazmid nüsxəsini təmin edir. Vektorun molekulyar çəkisi 2,83×106 d altondur.
pUC19 nədir?
pUC19 uzunluğu 2686 əsas cüt olan plazmid vektorudur. Bu, Joachim Messing və həmkarları tərəfindən yaradılmış plazmid vektorları seriyasından biridir. Bu plazmid seriyası üzərində ilk iş Kaliforniya Universitetində aparılmışdır. Bu, dairəvi ikizəncirli DNT-dir.
Şəkil 02: pUC19
Bu plazmid vektoru da mühüm xüsusiyyətlərə malikdir. β glactosidase (lacz) geninin N terminal fraqmentinə malikdir. O, həmçinin çoxlu klonlama saytı (MCS) bölgəsinə malikdir. Bu bölgə lacz geninin 6 və 7 kodonlarına bölünür. MCS bölgəsi bir çox məhdudlaşdırıcı endonükleaz məhdudlaşdırma sahələrini təmin edir. β qlaktosidaza geninə əlavə olaraq, pUC19 ampisillinə qarşı müqavimət genini də kodlayır (AmpR). Üstəlik, replikasiyanın mənşəyi pMB1 plazmidindən əldə edilir. pUC19 kiçik ölçüdə olsa da, yüksək nüsxə nömrəsinə malikdir (hər bakteriya hüceyrəsinə 500-700 nüsxə). Bu plazmid vektorunun molekulyar çəkisi 1,75×106 d altondur.
pBR322 və pUC19 arasında hansı oxşarlıqlar var?
- pBR322 və pUC19 iki növ plazmid vektordur.
- Onlar coli üçün məşhur klonlama vektorlarıdır.
- Hər iki plazmid vektoru pMB1 plazmidinin təkrarlanma formasının eyni mənşəyinə malikdir.
- Bu vektorların çoxsaylı məhdudiyyət saytları var.
- Hər iki plazmid vektorda seçilə bilən marker kimi ampisilin müqavimət geninə malikdir.
pBR322 ilə pUC19 arasındakı fərq nədir?
pBR322 uzunluğu 4361 əsas cüt olan plazmid vektoru, pUC19 isə 2686 əsas cüt uzunluğu olan plazmid vektorudur. Beləliklə, bu pBR322 və pUC19 arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, pBR322 aşağı nüsxə sayı plazmid vektorudur, pUC19 isə yüksək nüsxə sayı plazmid vektorudur.
Aşağıdakı infoqrafika pBR322 və pUC19 arasındakı fərqləri yan-yana müqayisə üçün cədvəl şəklində təqdim edir.
Xülasə – pBR322 vs pUC19
E.coli üçün ən çox istifadə edilən klonlama vektorları genetik olaraq hazırlanmış plazmidlərdir.pBR322 və pUC19 iki növ plazmid vektorudur. pBR322 uzunluğu 4361 əsas cüt olan plazmid vektorudur, pUC19 isə 2686 əsas cüt uzunluğu olan plazmid vektorudur. Beləliklə, bu, pBR322 və pUC19 arasındakı əsas fərqdir.
