Sinteniya ilə kollinearlıq arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, sinteniya növlərdə eyni xromosomda genetik lokusların fiziki birgə lokalizasiyasıdır, kollinearlıq isə müxtəlif növlərdə eyni xromosomda genetik lokusların fiziki birgə lokalizasiyasıdır. eyni sifariş.
Sinteniya və kollinearlıq genomikada bir-birini əvəz edən iki termindir. Hər iki termin müxtəlif növlərdə xromosomlarda gen lokalizasiya nümunələrini təsvir edir. Taksonlar arasında bu əlaqəli gen tənzimləmələri, genlərin ortaq əcdadları haqqında nəticə çıxararkən dəyərli məlumatdır. Sinteniya, növlərdə eyni xromosomda genetik lokusların fiziki birgə lokalizasiyasına aiddir. Kollinearlıq, eyni ardıcıllığı qoruyan müxtəlif növlərdə eyni xromosomda genetik lokusların fiziki birgə lokalizasiyasına aiddir. Buna görə də o, sinteniyanın bir formasıdır.
Synteny nədir?
Müxtəlif növlərdə eyni xromosomda yerləşən genlər dəsti var. Fərqli növlərdə eyni xromosomda genlərin bu fiziki birgə lokalizasiyası sinteniya kimi tanınır. Həmçinin, bu genlər tək bir xromosomda bir-birinə çox yaxındır. Genlərin sırası mütləq eyni olmaya bilər. Ancaq eyni xromosomda bir-birinə yaxın olan genlərin lokalizasiyası sinteniyada baş verir. Buna görə də, sinteniya əsasən genlərin bir xromosomda paylanma sxemini təsvir edir. Genin birgə lokalizasiyasının bu nümunələri müxtəlif növlər və onların təkamülü arasındakı əlaqələri göstərir. Bununla belə, translokasiyalar, inversiya və xromosom birləşmələri və s. duplikasiyalar, itkilər və qeyri-bərabər homoloji rekombinasiya kimi xromosomların yenidən qurulması səbəbindən sinteniya pozula bilər.
Şəkil 01: Sinteniya
Bütün əlaqəli genlərin sintenik olduğuna inanılır. Bununla belə, bütün sintenik genlər mütləq əlaqəli deyil. Onlar ümumi xromosom ardıcıllığına malikdirlər. İnsanların digər məməlilərlə çoxlu sintenik genləri var. Üstəlik, bir çox dənli bitkilər sintenik genlərə malikdir.
Kollinearlıq nədir?
Kollinearlıq sinteniyanın daha spesifik formasıdır ki, burada genlər dəsti müxtəlif növlərin eyni xromosomunda əcdad növlərində olduğu kimi eyni ardıcıllıqla yerləşir. Buna görə də, əgər kollinearlıqdan sapma olarsa, bu, daha etibarlı filogenetik xarakter olacaq, çünki kollinearlıq genlərin ortaq nəslini izah edir.
Şəkil 02: Kollinearlıq
Çoxtərəfli kollinearlıq təhlili əlaqəli növlər və onların filogeniyası haqqında daha etibarlı məlumat verir.
Sinteniya və Kollinearlıq arasındakı oxşarlıqlar nələrdir?
- Həm sinteniyada, həm də kollinearlıqda iki müxtəlif növdə lokuslar dəsti eyni xromosomda yerləşir.
- Bu terminlər eyni xromosomda genetik lokusların fiziki birgə lokalizasiyasını təsvir edir.
- Kollinearlıq sinteniyanın daha spesifik formasıdır.
- Bəzən hər iki termin genomikada bir-birini əvəz edir.
- İki regionun kollinearlığı varsa, onlar açıq şəkildə sintendirlər.
- Onlar filogeniyanı çıxarmaqda faydalıdır.
Sinteniya və Kollinearlıq Arasındakı Fərq Nədir?
Sinteniya və kollinearlıq genomikada bir-birini əvəz edən iki termindir. Sinteniya müxtəlif növlərdə eyni xromosomda olan bir sıra genlərin fiziki birgə lokalizasiyasına aiddir. Kollinearlıq, genlər dəstinin müxtəlif növlər arasında eyni ardıcıllıqla birgə lokallaşdırıldığı sinteniyanın formasıdır. Buna görə də sinteniya və kollinearlıq arasındakı əsas fərq budur.
Xülasə – Synteny vs Collinearity
Sinteniya və kollinearlıq terminləri müxtəlif növlərdə eyni xromosomda yerləşən genlər toplusuna aiddir. Əslində, bu genlər müxtəlif növlərdə eyni xromosomda birgə lokallaşdırılır. Synteny müxtəlif növlərdə eyni xromosomda çoxlu genlərin fiziki birgə lokalizasiyasını təsvir edir, kollinearlıq isə genlər dəstinin eyni ardıcıllıqla birgə lokallaşdırıldığı sinteniyanın daha spesifik formasıdır. Beləliklə, bu, sinteniya və kollinearlıq arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
