Benzonaza və DNaz Arasındakı Fərq

2024 Müəllif: Alex Aldridge | [email protected]. Son dəyişdirildi: 2023-12-17 13:32

Əsas Fərq – Benzonaz vs DNase

Nuklein turşularının deqradasiyası bir çox molekulyar biologiya texnikası üçün vacibdir. DNT və RNT-nin arzuolunmaz fraqmentlərindən xilas olmaq üçün rekombinant DNT texnologiyasında geniş istifadə olunur. Nuklein turşusunu parçalayan fermentlərə Nukleazlar deyilir və onlar tələb olunan funksiyaya görə müxtəlif növ ola bilər. DNT-ni parçalayan nukleazlar DNazlar, RNT-ni parçalayanlar isə RNazlar adlanır. Bu fermentlər əsasən təmiz DNT, RNT və ya zülalları təcrid etmək üçün in vitro molekulyar testlərin aparıldığı in vitro təcrübələrdə istifadə olunur. Benzonazlar həm DNT, həm də RNT-ni parçalayan bir növ nukleazlardır, DNazlar isə yalnız DNT-ni parçalayır. Benzonaz və DNaz arasındakı əsas fərq budur.

Benzonaza nədir?

Benzonaza, Serratia marcescens-dən genetik olaraq hazırlanmış endonükleazdır. Bu ferment sənaye miqyasında E. coli hostlarında istehsal olunur. Benzonaza cüt zəncirli DNT, xətti DNT, dairəvi DNT və tək zəncirli RNT-ni parçalamağa qadirdir. Beləliklə, benzonaz kommersiya baxımından vacibdir. Benzonaz fermenti 245 eyni amin turşusu, iki əsas disulfid bağı ilə ~ 30 kDa alt bölməsi olan bir protein dimeridir. Benzonaz 5' ucunda nuklein turşularını parçalayır və sərbəst 5' ucları olan fraqmentlərə səbəb olur. Benzonaz nuklein turşularını istənilən ardıcıllıqla parçalaya bilər, lakin GC ilə zəngin bölgələrə üstünlük verir.

Benzonaza -20 ^{0C-də saxlanılır. Ferment fəaliyyəti üçün optimal pH 8.0 - 9.2 olduğu müəyyən edilmişdir. Benzonazın tətbiqlərinə benzonazın bağlı nuklein turşularını çıxardığı və rekombinant zülal preparatlarından nuklein turşusu çirkləndiricilərinin xaric edildiyi protein 2D gel elektroforezi üçün nümunənin hazırlanması daxildir. O, həmçinin protein ekstraktlarının özlülüyünü az altmaq və hüceyrə qarışığında hüceyrələrin yığılmasının qarşısını almaq üçün istifadə olunur.}

DNaz nədir?

DNase yalnız ikiqat zəncirli DNT-ni parçalaya bilən nükleaz, hidrolitik fermentdir. DNazların iki əsas növü var: DNaz I və DNaz II. DNase I, 5 'sərbəst ucları olan polinükleotidlər istehsal etmək üçün ikiqat zəncirli DNT-nin parçalanmasında iştirak edir. DNase II 3' sərbəst ucları və ya çıxıntıları olan polinükleotid zəncirləri yaratmaq üçün ikiqat zəncirli DNT-nin parçalanmasında iştirak edir.

DNase I

DNase I 7.0 – 8.0 arasında optimal pH-da işləyir. Fermentin aktivliyi Ca²⁺, Mg²⁺ və ya Mn^{2+ daxil olmaqla bir çox ion kofaktorlarından asılıdır. Mg}2+ ^{və Mn}2+ ^{aktivliyi DNaz I-nin funksiyasını təyin edir. Mg} varlığında 2+^{, DNase I dsDNA-nın hər bir zəncirini müstəqil şəkildə parçalayır. Bu təsadüfi bir şəkildə baş verir. Bunun əksinə olaraq, Mn}2+, ^{varlığında ferment hər iki DNT zəncirini təxminən eyni yerdə parçalayır. Bu parçalanma iki növ DNT fraqmentinin əmələ gəlməsi ilə nəticələnəcək; küt ucları olan bir növ və bir və ya iki nukleotid çıxıntısı olan digər növ.}

Şəkil 02: DNaz

DNase II

DNase II 4,5-5,0 optimal pH-da işləyir və DNase I-ə bənzər fəaliyyəti üçün ikivalentli metal ionları tələb olunur. DNase II mexanizminin üç əsas addımdan ibarət olduğu məlumdur.

1. DNT onurğasında çoxlu tək zəncir qırılmaları yaranır.
2. Turşuda həll olunan nukleotidlər və oliqonukleotidlər istehsal olunur.
3. Qeyri-xətti hiperkromik sürüşmə sonuncu mərhələdə baş verir.

DNaz fermentinin əsas inhibitorlarına metal çelatatorlar, keçid metalları və natrium dodesil sulfat və β – merkaptoetanol kimi kimyəvi maddələr daxildir.

DNaz-ın əsas tətbiqlərinə DNT-siz RNT ekstraktlarının və zülal ekstraktlarının hazırlanması və in vitro transkripsiya təcrübələri zamanı şablon DNT-nin çıxarılması daxildir.

Benzonaza və DNaz arasında hansı oxşarlıqlar var?

• Hər ikisi hidrolitik fermentlərdir.
• Hər ikisi nüvədir.
• Hər ikisi nuklein turşularının fosfodiester bağlarını parçalayaraq iştirak edir.
• Hər ikisi fermentin fəaliyyətini saxlamaq üçün optimal pH və saxlama temperaturu tələb edir.
• Fermentlərin inhibitorlarına xelatlaşdırıcı maddələr, keçid metalları və yuyucu kimyəvi maddələr daxildir.
• Tətbiqlər əsasən DNT, RNT və zülalların yüksək təmizlik ekstraktlarının əldə edilməsinə yönəlib.
• Hər iki ferment gen mühəndisliyi ilə istehsal edilə bilər.

Benzonaza və DNaz Arasındakı Fərq Nədir?

Benzonaza vs DNaz
Benzonaza qoşa zəncirli DNT, xətti DNT, dairəvi DNT və RNT-ni parçalaya bilən fermentdir.	DNase ikiqat zəncirli DNT-ni parçalaya bilən fermentdir.
Ferment üçün substrat
Həm DNT, həm də RNT benzonaz üçün substratdır.	DNT DNaz üçün substratdır.
Struktur
Benzonazanın optimal pH diapazonu 7.0 -8.0	DNase I-in optimal pH diapazonları 7.0 – 8.0 və DNase II 4.5 – 5.0-dir.

Xülasə – Benzonaz və DNase

Nükleaz fermentləri molekulyar biologiya və gen mühəndisliyi ilə bağlı müxtəlif eksperimental prosedurlarda geniş istifadə olunur. Benzonaz və DNase iki növ nukleazdır. Benzonaz həm DNT, həm də RNT-nin parçalanmasında iştirak edir, DNase isə cüt zəncirli DNT-nin parçalanmasında iştirak edir. Bu benzonaz və DNaz arasındakı əsas fərqdir. Hazırda bu nukleazaların hər iki növü maksimum istehsal üçün optimallaşdırılmış yüksək keyfiyyətli fermentlər verən rekombinant DNT texnologiyası vasitəsilə istehsal olunur.

Benzonase vs DNase-in PDF versiyasını endirin

Bu məqalənin PDF versiyasını yükləyə və sitat qeydinə əsasən onu oflayn məqsədlər üçün istifadə edə bilərsiniz. Zəhmət olmasa PDF versiyasını buradan yükləyin Benzonaz və DNase arasındakı fərq